MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 23198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_012633	T	6	6	162106	162111	0 %	100 %	0 %	0 %	229586360
3002	NC_012633	TA	3	6	162118	162123	50 %	50 %	0 %	0 %	229586360
3003	NC_012633	TAA	2	6	162131	162136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586360
3004	NC_012633	CTTCAT	2	12	162154	162165	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	229586360
3005	NC_012633	AAATT	2	10	162168	162177	60 %	40 %	0 %	0 %	229586360
3006	NC_012633	T	6	6	162176	162181	0 %	100 %	0 %	0 %	229586360
3007	NC_012633	ATT	2	6	162182	162187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586360
3008	NC_012633	GCG	2	6	162255	162260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229586360
3009	NC_012633	GTT	2	6	162275	162280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586360
3010	NC_012633	GAT	2	6	162299	162304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586360
3011	NC_012633	GTC	2	6	162314	162319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586360
3012	NC_012633	A	6	6	162359	162364	100 %	0 %	0 %	0 %	229586360
3013	NC_012633	ATT	2	6	162465	162470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586360
3014	NC_012633	T	6	6	162498	162503	0 %	100 %	0 %	0 %	229586360
3015	NC_012633	TTC	3	9	162526	162534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586360
3016	NC_012633	TATCA	2	10	162545	162554	40 %	40 %	0 %	20 %	229586360
3017	NC_012633	ATA	2	6	162608	162613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586360
3018	NC_012633	TAGCT	2	10	162632	162641	20 %	40 %	20 %	20 %	229586360
3019	NC_012633	TTG	2	6	162664	162669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586360
3020	NC_012633	TTC	2	6	162674	162679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586360
3021	NC_012633	ATC	2	6	162728	162733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586360
3022	NC_012633	TAA	2	6	162781	162786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586361
3023	NC_012633	TGTGA	2	10	162827	162836	20 %	40 %	40 %	0 %	229586361
3024	NC_012633	TATAT	2	10	162859	162868	40 %	60 %	0 %	0 %	229586361
3025	NC_012633	TAT	2	6	162891	162896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586361
3026	NC_012633	ATT	2	6	162923	162928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586361
3027	NC_012633	T	6	6	162993	162998	0 %	100 %	0 %	0 %	229586361
3028	NC_012633	GTG	2	6	162999	163004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229586361
3029	NC_012633	ATT	2	6	163013	163018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586361
3030	NC_012633	CGG	2	6	163072	163077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229586361
3031	NC_012633	AAT	2	6	163092	163097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586361
3032	NC_012633	ATA	2	6	163122	163127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586361
3033	NC_012633	AAT	2	6	163165	163170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586361
3034	NC_012633	GAA	2	6	163189	163194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586361
3035	NC_012633	TAT	2	6	163234	163239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586361
3036	NC_012633	AT	3	6	163278	163283	50 %	50 %	0 %	0 %	229586361
3037	NC_012633	CTA	2	6	163314	163319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586361
3038	NC_012633	CTG	2	6	163348	163353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586361
3039	NC_012633	CTA	2	6	163404	163409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586361
3040	NC_012633	T	8	8	163416	163423	0 %	100 %	0 %	0 %	229586361
3041	NC_012633	T	6	6	163456	163461	0 %	100 %	0 %	0 %	229586361
3042	NC_012633	TTATT	2	10	163494	163503	20 %	80 %	0 %	0 %	229586361
3043	NC_012633	TTA	2	6	163526	163531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586361
3044	NC_012633	TTC	2	6	163549	163554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229586361
3045	NC_012633	AT	3	6	163578	163583	50 %	50 %	0 %	0 %	229586361
3046	NC_012633	ATT	2	6	163600	163605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586361
3047	NC_012633	A	6	6	163640	163645	100 %	0 %	0 %	0 %	229586361
3048	NC_012633	A	6	6	163824	163829	100 %	0 %	0 %	0 %	229586362
3049	NC_012633	A	7	7	163844	163850	100 %	0 %	0 %	0 %	229586362
3050	NC_012633	AGA	2	6	163880	163885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586362
3051	NC_012633	AATTT	2	10	163915	163924	40 %	60 %	0 %	0 %	229586362
3052	NC_012633	TCAATT	2	12	163928	163939	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	229586362
3053	NC_012633	AAT	2	6	163964	163969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586362
3054	NC_012633	TGT	2	6	163976	163981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586362
3055	NC_012633	GAA	2	6	164034	164039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586362
3056	NC_012633	TAA	2	6	164047	164052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586362
3057	NC_012633	ATA	2	6	164121	164126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586362
3058	NC_012633	CT	3	6	164180	164185	0 %	50 %	0 %	50 %	229586362
3059	NC_012633	GGT	2	6	164193	164198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229586362
3060	NC_012633	ATA	2	6	164200	164205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586362
3061	NC_012633	TGA	2	6	164243	164248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586362
3062	NC_012633	TAA	2	6	164288	164293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586362
3063	NC_012633	ATTTT	2	10	164302	164311	20 %	80 %	0 %	0 %	229586362
3064	NC_012633	TAT	2	6	164398	164403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586362
3065	NC_012633	AGA	2	6	164449	164454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586362
3066	NC_012633	ATT	2	6	164498	164503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586362
3067	NC_012633	AGCCG	2	10	164507	164516	20 %	0 %	40 %	40 %	229586362
3068	NC_012633	AAAGAA	2	12	164568	164579	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	229586362
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3070	NC_012633	TAA	3	9	164600	164608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586362
3071	NC_012633	AAG	2	6	164650	164655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586362
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3073	NC_012633	AGT	2	6	164774	164779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586362
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3076	NC_012633	ACT	2	6	164825	164830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229586362
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3078	NC_012633	AGT	2	6	165043	165048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586363
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3080	NC_012633	GTTGAG	2	12	165152	165163	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	229586363
3081	NC_012633	GCT	2	6	165179	165184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586363
3082	NC_012633	TTG	2	6	165201	165206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586363
3083	NC_012633	TAA	2	6	165229	165234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586363
3084	NC_012633	GTA	2	6	165363	165368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586363
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3088	NC_012633	AAG	2	6	165543	165548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586363
3089	NC_012633	GCGT	2	8	165552	165559	0 %	25 %	50 %	25 %	229586363
3090	NC_012633	AAAG	2	8	165578	165585	75 %	0 %	25 %	0 %	229586363
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3092	NC_012633	ATT	2	6	165623	165628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586363
3093	NC_012633	TGA	2	6	165640	165645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586363
3094	NC_012633	GGC	2	6	165649	165654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229586363
3095	NC_012633	AT	3	6	165659	165664	50 %	50 %	0 %	0 %	229586363
3096	NC_012633	TGC	2	6	165667	165672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586363
3097	NC_012633	TA	3	6	165720	165725	50 %	50 %	0 %	0 %	229586363
3098	NC_012633	AAAG	2	8	165736	165743	75 %	0 %	25 %	0 %	229586363
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3102	NC_012633	AAG	2	6	165943	165948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229586364
3103	NC_012633	GAAT	2	8	165950	165957	50 %	25 %	25 %	0 %	229586364
3104	NC_012633	AAAT	2	8	165964	165971	75 %	25 %	0 %	0 %	229586364
3105	NC_012633	AAGT	2	8	165985	165992	50 %	25 %	25 %	0 %	229586364
3106	NC_012633	CAA	2	6	166057	166062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229586364
3107	NC_012633	T	6	6	166127	166132	0 %	100 %	0 %	0 %	229586364
3108	NC_012633	TAT	2	6	166208	166213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229586364
3109	NC_012633	ATA	2	6	166288	166293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586364
3110	NC_012633	CT	3	6	166342	166347	0 %	50 %	0 %	50 %	229586364
3111	NC_012633	ATAG	2	8	166353	166360	50 %	25 %	25 %	0 %	229586364
3112	NC_012633	TTG	2	6	166378	166383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229586364
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3117	NC_012633	TGC	2	6	166547	166552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229586364
3118	NC_012633	TAA	2	6	166556	166561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229586364
3119	NC_012633	GGT	2	6	166572	166577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229586364
3120	NC_012633	T	6	6	166624	166629	0 %	100 %	0 %	0 %	229586364
3121	NC_012633	AAGA	2	8	166704	166711	75 %	0 %	25 %	0 %	229586364
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3123	NC_012633	TAG	2	6	166807	166812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586364
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3490	NC_012633	GTA	2	6	184806	184811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229586380
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