MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia africae ESF-5 chromosome

Total Repeats: 23198

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_012633	TCT	2	6	1154918	1154923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587165
21003	NC_012633	T	7	7	1154926	1154932	0 %	100 %	0 %	0 %	229587165
21004	NC_012633	TAA	2	6	1155030	1155035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587165
21005	NC_012633	ATT	2	6	1155080	1155085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587165
21006	NC_012633	CT	3	6	1155088	1155093	0 %	50 %	0 %	50 %	229587165
21007	NC_012633	TCAC	2	8	1155152	1155159	25 %	25 %	0 %	50 %	229587165
21008	NC_012633	TTCT	2	8	1155165	1155172	0 %	75 %	0 %	25 %	229587165
21009	NC_012633	CAA	2	6	1155258	1155263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587165
21010	NC_012633	ATC	2	6	1155346	1155351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587165
21011	NC_012633	CTA	2	6	1155423	1155428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587165
21012	NC_012633	TTA	2	6	1155486	1155491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587165
21013	NC_012633	GTC	2	6	1155644	1155649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587165
21014	NC_012633	CTTT	2	8	1155777	1155784	0 %	75 %	0 %	25 %	229587166
21015	NC_012633	AAT	2	6	1155853	1155858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587166
21016	NC_012633	TAT	2	6	1155861	1155866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587166
21017	NC_012633	ATA	2	6	1155876	1155881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587166
21018	NC_012633	T	6	6	1155888	1155893	0 %	100 %	0 %	0 %	229587166
21019	NC_012633	ATTT	2	8	1155948	1155955	25 %	75 %	0 %	0 %	229587166
21020	NC_012633	TAT	2	6	1156005	1156010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587166
21021	NC_012633	T	6	6	1156049	1156054	0 %	100 %	0 %	0 %	229587166
21022	NC_012633	CAATAA	2	12	1156057	1156068	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	229587166
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21024	NC_012633	T	6	6	1156100	1156105	0 %	100 %	0 %	0 %	229587166
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21031	NC_012633	TAT	2	6	1156462	1156467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587167
21032	NC_012633	AT	3	6	1156466	1156471	50 %	50 %	0 %	0 %	229587167
21033	NC_012633	CAT	2	6	1156509	1156514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587167
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21035	NC_012633	T	6	6	1156576	1156581	0 %	100 %	0 %	0 %	229587167
21036	NC_012633	TTAA	2	8	1156672	1156679	50 %	50 %	0 %	0 %	229587167
21037	NC_012633	GTT	2	6	1156759	1156764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587167
21038	NC_012633	GCT	2	6	1156765	1156770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587167
21039	NC_012633	GCG	2	6	1156799	1156804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587167
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21042	NC_012633	GCTT	2	8	1156893	1156900	0 %	50 %	25 %	25 %	229587167
21043	NC_012633	TAG	2	6	1156976	1156981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587167
21044	NC_012633	TA	3	6	1156983	1156988	50 %	50 %	0 %	0 %	229587167
21045	NC_012633	CTAACT	2	12	1157099	1157110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587167
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21052	NC_012633	TAT	2	6	1157279	1157284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587167
21053	NC_012633	AAT	2	6	1157325	1157330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587167
21054	NC_012633	TGC	2	6	1157347	1157352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587167
21055	NC_012633	CTT	2	6	1157363	1157368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587167
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21057	NC_012633	ATTTAT	2	12	1157472	1157483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587167
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21059	NC_012633	AGT	2	6	1157542	1157547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587167
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21061	NC_012633	TA	3	6	1157658	1157663	50 %	50 %	0 %	0 %	229587167
21062	NC_012633	CAG	2	6	1157675	1157680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587167
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21073	NC_012633	TAA	2	6	1158122	1158127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587168
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21089	NC_012633	AT	3	6	1161216	1161221	50 %	50 %	0 %	0 %	229587169
21090	NC_012633	CAAG	2	8	1161273	1161280	50 %	0 %	25 %	25 %	229587169
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21110	NC_012633	AG	3	6	1162161	1162166	50 %	0 %	50 %	0 %	229587169
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21355	NC_012633	TTG	2	6	1182187	1182192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587183
21356	NC_012633	TCA	2	6	1182245	1182250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587183
21357	NC_012633	TTC	2	6	1182290	1182295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587183
21358	NC_012633	CAT	2	6	1182336	1182341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587183
21359	NC_012633	CTC	2	6	1182385	1182390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587183
21360	NC_012633	T	6	6	1182472	1182477	0 %	100 %	0 %	0 %	229587183
21361	NC_012633	CTG	2	6	1182534	1182539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587183
21362	NC_012633	T	7	7	1182592	1182598	0 %	100 %	0 %	0 %	229587183
21363	NC_012633	CTT	2	6	1182600	1182605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587183
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21365	NC_012633	C	7	7	1182629	1182635	0 %	0 %	0 %	100 %	229587183
21366	NC_012633	TA	3	6	1182687	1182692	50 %	50 %	0 %	0 %	229587183
21367	NC_012633	TTG	2	6	1182723	1182728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587183
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21370	NC_012633	GCT	2	6	1182842	1182847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587183
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21383	NC_012633	TTTA	2	8	1183801	1183808	25 %	75 %	0 %	0 %	229587184
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21458	NC_012633	GTA	2	6	1187382	1187387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587185
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21470	NC_012633	AT	3	6	1188010	1188015	50 %	50 %	0 %	0 %	229587185
21471	NC_012633	ACTCCG	2	12	1188021	1188032	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	229587185
21472	NC_012633	GTAA	2	8	1188189	1188196	50 %	25 %	25 %	0 %	229587185
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21474	NC_012633	ATA	2	6	1188251	1188256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587185
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21483	NC_012633	CTTGTA	2	12	1188565	1188576	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	229587185
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21499	NC_012633	CTG	2	6	1189162	1189167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587185
21500	NC_012633	CTC	2	6	1189207	1189212	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587185

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