MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodococcus opacus B4 plasmid pROB01

Total Repeats: 11139

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012520	CCGCGG	2	12	28328	28339	0 %	0 %	50 %	50 %	226349261
502	NC_012520	TCC	2	6	28342	28347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226349261
503	NC_012520	GGT	2	6	28359	28364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226349261
504	NC_012520	CGG	2	6	28365	28370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349261
505	NC_012520	CCGCG	2	10	28398	28407	0 %	0 %	40 %	60 %	226349261
506	NC_012520	CTG	2	6	28420	28425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349261
507	NC_012520	GCTG	2	8	28496	28503	0 %	25 %	50 %	25 %	226349261
508	NC_012520	TGG	2	6	28513	28518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226349261
509	NC_012520	CGGC	2	8	28556	28563	0 %	0 %	50 %	50 %	226349261
510	NC_012520	TGA	2	6	28571	28576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226349261
511	NC_012520	CGG	4	12	28608	28619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349261
512	NC_012520	TTC	2	6	28630	28635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226349261
513	NC_012520	GCG	2	6	28718	28723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349261
514	NC_012520	CAT	2	6	28746	28751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226349261
515	NC_012520	TCA	2	6	28802	28807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226349261
516	NC_012520	CAC	2	6	28875	28880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226349261
517	NC_012520	ATC	2	6	28948	28953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226349261
518	NC_012520	CTC	2	6	28984	28989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226349261
519	NC_012520	CGCGGC	2	12	29004	29015	0 %	0 %	50 %	50 %	226349261
520	NC_012520	TC	3	6	29025	29030	0 %	50 %	0 %	50 %	226349261
521	NC_012520	CGG	2	6	29118	29123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349261
522	NC_012520	ATCGA	2	10	29161	29170	40 %	20 %	20 %	20 %	226349261
523	NC_012520	CCAA	2	8	29193	29200	50 %	0 %	0 %	50 %	226349261
524	NC_012520	AAC	2	6	29242	29247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226349261
525	NC_012520	CGC	2	6	29271	29276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349261
526	NC_012520	CGT	2	6	29325	29330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349261
527	NC_012520	GGA	2	6	29430	29435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226349261
528	NC_012520	CTC	2	6	29515	29520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226349261
529	NC_012520	GCCG	2	8	29542	29549	0 %	0 %	50 %	50 %	226349261
530	NC_012520	ATC	2	6	29554	29559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226349261
531	NC_012520	GTC	2	6	29605	29610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349261
532	NC_012520	TGC	2	6	29675	29680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349261
533	NC_012520	GAT	2	6	29682	29687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226349261
534	NC_012520	GTC	2	6	29722	29727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349261
535	NC_012520	TTC	2	6	29773	29778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226349261
536	NC_012520	CCG	2	6	29814	29819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349261
537	NC_012520	CAA	2	6	29858	29863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226349261
538	NC_012520	ACCG	2	8	29889	29896	25 %	0 %	25 %	50 %	226349261
539	NC_012520	CAC	2	6	29916	29921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226349261
540	NC_012520	GC	3	6	29923	29928	0 %	0 %	50 %	50 %	226349261
541	NC_012520	TGC	2	6	29934	29939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349261
542	NC_012520	GCC	2	6	29944	29949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349261
543	NC_012520	GTG	2	6	29983	29988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226349261
544	NC_012520	GAA	2	6	30009	30014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226349261
545	NC_012520	GCA	2	6	30070	30075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349261
546	NC_012520	CGG	2	6	30078	30083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349261
547	NC_012520	TCCTC	2	10	30113	30122	0 %	40 %	0 %	60 %	226349261
548	NC_012520	AGCG	2	8	30131	30138	25 %	0 %	50 %	25 %	226349261
549	NC_012520	CGGT	2	8	30197	30204	0 %	25 %	50 %	25 %	226349261
550	NC_012520	GCT	2	6	30238	30243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349261
551	NC_012520	CGG	2	6	30275	30280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349261
552	NC_012520	CGT	2	6	30323	30328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349261
553	NC_012520	CCA	2	6	30365	30370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226349261
554	NC_012520	CAC	3	9	30408	30416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226349261
555	NC_012520	CCAG	2	8	30466	30473	25 %	0 %	25 %	50 %	226349261
556	NC_012520	GCT	2	6	30528	30533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349261
557	NC_012520	GCC	2	6	30538	30543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349261
558	NC_012520	CTC	2	6	30609	30614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226349262
559	NC_012520	AC	3	6	30616	30621	50 %	0 %	0 %	50 %	226349262
560	NC_012520	GTG	3	9	30662	30670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226349262
561	NC_012520	GCT	2	6	30671	30676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349262
562	NC_012520	TCA	2	6	30703	30708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226349262
563	NC_012520	CGA	2	6	30736	30741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349262
564	NC_012520	GGC	2	6	30786	30791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349262
565	NC_012520	ACG	2	6	30889	30894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349262
566	NC_012520	GCA	2	6	30906	30911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349262
567	NC_012520	CGC	2	6	30932	30937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349262
568	NC_012520	CGC	2	6	30956	30961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349262
569	NC_012520	CGC	2	6	30968	30973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349262
570	NC_012520	TCG	2	6	31021	31026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349262
571	NC_012520	ACA	2	6	31211	31216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226349262
572	NC_012520	CAG	2	6	31243	31248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349262
573	NC_012520	CCG	2	6	31297	31302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349262
574	NC_012520	CGG	2	6	31360	31365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349262
575	NC_012520	CGG	2	6	31388	31393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349262
576	NC_012520	GAC	2	6	31407	31412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349262
577	NC_012520	ACC	2	6	31423	31428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226349262
578	NC_012520	CCG	2	6	31429	31434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349262
579	NC_012520	GC	3	6	31436	31441	0 %	0 %	50 %	50 %	226349262
580	NC_012520	CAT	2	6	31448	31453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226349262
581	NC_012520	GGA	2	6	31598	31603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	226349262
582	NC_012520	GCG	2	6	31657	31662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349262
583	NC_012520	CCG	2	6	31672	31677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349262
584	NC_012520	ACC	2	6	31710	31715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226349262
585	NC_012520	GCA	2	6	31765	31770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349262
586	NC_012520	CGC	2	6	31774	31779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349262
587	NC_012520	GCT	2	6	31800	31805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349262
588	NC_012520	CAA	2	6	31854	31859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226349262
589	NC_012520	GCG	2	6	31912	31917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349262
590	NC_012520	ACC	2	6	32000	32005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226349262
591	NC_012520	ATC	2	6	32133	32138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	226349262
592	NC_012520	GCC	2	6	32139	32144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349262
593	NC_012520	CGG	2	6	32150	32155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349262
594	NC_012520	CGT	2	6	32165	32170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349262
595	NC_012520	CGG	2	6	32177	32182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349262
596	NC_012520	GCCG	2	8	32216	32223	0 %	0 %	50 %	50 %	226349262
597	NC_012520	GAA	2	6	32237	32242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	226349262
598	NC_012520	CGGC	2	8	32489	32496	0 %	0 %	50 %	50 %	226349263
599	NC_012520	TTC	2	6	32498	32503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226349263
600	NC_012520	CGA	2	6	32523	32528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349263
601	NC_012520	GT	3	6	32661	32666	0 %	50 %	50 %	0 %	226349263
602	NC_012520	TGCG	2	8	32688	32695	0 %	25 %	50 %	25 %	226349263
603	NC_012520	CAG	2	6	32701	32706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349263
604	NC_012520	CTT	2	6	32791	32796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226349263
605	NC_012520	ACC	2	6	32824	32829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226349264
606	NC_012520	CCG	2	6	32894	32899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349264
607	NC_012520	TCGA	2	8	32931	32938	25 %	25 %	25 %	25 %	226349264
608	NC_012520	CGA	2	6	32984	32989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349264
609	NC_012520	GCC	2	6	33067	33072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349264
610	NC_012520	GAGG	2	8	33078	33085	25 %	0 %	75 %	0 %	226349264
611	NC_012520	CGA	2	6	33101	33106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349264
612	NC_012520	CG	3	6	33126	33131	0 %	0 %	50 %	50 %	226349264
613	NC_012520	ACC	2	6	33184	33189	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	226349264
614	NC_012520	AG	3	6	33359	33364	50 %	0 %	50 %	0 %	226349265
615	NC_012520	TTC	2	6	33379	33384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226349265
616	NC_012520	TCG	3	9	33510	33518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349265
617	NC_012520	ACA	3	9	35592	35600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	226349266
618	NC_012520	GCA	2	6	35606	35611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349266
619	NC_012520	GTG	2	6	35614	35619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226349266
620	NC_012520	GCC	2	6	35654	35659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349266
621	NC_012520	CGGT	2	8	35707	35714	0 %	25 %	50 %	25 %	226349266
622	NC_012520	GCC	2	6	35721	35726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349266
623	NC_012520	CGC	2	6	35762	35767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349266
624	NC_012520	GTCGAC	2	12	35832	35843	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	226349266
625	NC_012520	CA	3	6	35969	35974	50 %	0 %	0 %	50 %	226349266
626	NC_012520	TTC	2	6	36039	36044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	226349266
627	NC_012520	CGCC	2	8	36065	36072	0 %	0 %	25 %	75 %	226349266
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635	NC_012520	CGGC	2	8	36498	36505	0 %	0 %	50 %	50 %	226349266
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754	NC_012520	GCA	2	6	43319	43324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349271
755	NC_012520	TC	3	6	43349	43354	0 %	50 %	0 %	50 %	226349271
756	NC_012520	GTGGG	2	10	43355	43364	0 %	20 %	80 %	0 %	226349271
757	NC_012520	CGG	2	6	43367	43372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349271
758	NC_012520	AGC	2	6	43399	43404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349271
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760	NC_012520	CGG	2	6	43433	43438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349271
761	NC_012520	TCG	3	9	43444	43452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349271
762	NC_012520	TGC	2	6	43618	43623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349271
763	NC_012520	GGC	2	6	43638	43643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349271
764	NC_012520	GCC	2	6	43644	43649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349271
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768	NC_012520	GC	3	6	43970	43975	0 %	0 %	50 %	50 %	226349271
769	NC_012520	GGCG	2	8	44035	44042	0 %	0 %	75 %	25 %	226349271
770	NC_012520	CAG	2	6	44130	44135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349271
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774	NC_012520	TCG	2	6	44233	44238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349271
775	NC_012520	CCG	2	6	44248	44253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	226349271
776	NC_012520	GTA	2	6	44295	44300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	226349271
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778	NC_012520	AGC	2	6	44356	44361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349271
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780	NC_012520	TCG	2	6	44374	44379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349271
781	NC_012520	CCGGG	2	10	44439	44448	0 %	0 %	60 %	40 %	226349271
782	NC_012520	CGA	2	6	44455	44460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349271
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784	NC_012520	GGT	2	6	44564	44569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226349271
785	NC_012520	GGC	2	6	44622	44627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349271
786	NC_012520	CGG	2	6	44675	44680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349271
787	NC_012520	GGT	2	6	44787	44792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	226349271
788	NC_012520	CGG	2	6	44832	44837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349271
789	NC_012520	GCG	2	6	44854	44859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	226349271
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874	NC_012520	GCA	2	6	50358	50363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	226349277
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877	NC_012520	CCT	2	6	50420	50425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	226349277
878	NC_012520	GCT	2	6	50468	50473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	226349277
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