MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodospirillum centenum SW chromosome

Total Repeats: 110774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011420	CGGC	2	8	33	40	0 %	0 %	50 %	50 %	209963360
2	NC_011420	ACG	2	6	135	140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
3	NC_011420	CGT	2	6	154	159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963360
4	NC_011420	GGC	2	6	223	228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
5	NC_011420	CCA	2	6	276	281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963360
6	NC_011420	GCG	2	6	348	353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
7	NC_011420	CAG	2	6	403	408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
8	NC_011420	CAG	2	6	443	448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
9	NC_011420	GCGG	2	8	449	456	0 %	0 %	75 %	25 %	209963360
10	NC_011420	GGCC	2	8	484	491	0 %	0 %	50 %	50 %	209963360
11	NC_011420	GCG	2	6	504	509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
12	NC_011420	CAG	2	6	523	528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
13	NC_011420	ATG	2	6	540	545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209963360
14	NC_011420	CCAGCG	2	12	585	596	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	209963360
15	NC_011420	CAC	2	6	748	753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963360
16	NC_011420	ATC	2	6	803	808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209963360
17	NC_011420	GGC	2	6	809	814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
18	NC_011420	CGA	2	6	874	879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
19	NC_011420	GGC	2	6	896	901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
20	NC_011420	CAT	2	6	949	954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209963360
21	NC_011420	CCA	3	9	981	989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963360
22	NC_011420	GGCA	2	8	994	1001	25 %	0 %	50 %	25 %	209963360
23	NC_011420	CGC	2	6	1090	1095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963360
24	NC_011420	CGG	3	9	1206	1214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
25	NC_011420	ACG	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
26	NC_011420	GGCAGC	2	12	1301	1312	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209963360
27	NC_011420	CGG	2	6	1326	1331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
28	NC_011420	GTG	2	6	1340	1345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963360
29	NC_011420	CGA	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
30	NC_011420	ACG	2	6	1355	1360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
31	NC_011420	TGG	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963360
32	NC_011420	CCA	2	6	1473	1478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963360
33	NC_011420	GCG	2	6	1580	1585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
34	NC_011420	CGT	2	6	1591	1596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963360
35	NC_011420	GCG	2	6	1614	1619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
36	NC_011420	GCG	2	6	1647	1652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
37	NC_011420	GGGC	2	8	1659	1666	0 %	0 %	75 %	25 %	209963360
38	NC_011420	ACC	2	6	1784	1789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963360
39	NC_011420	CGC	3	9	1848	1856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963360
40	NC_011420	TGG	2	6	1860	1865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963360
41	NC_011420	CGC	2	6	1878	1883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963360
42	NC_011420	CCG	2	6	1889	1894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963360
43	NC_011420	GCC	2	6	1897	1902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963360
44	NC_011420	GCC	2	6	1906	1911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963360
45	NC_011420	ACC	2	6	1915	1920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209963360
46	NC_011420	GCC	2	6	1922	1927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963360
47	NC_011420	CCG	5	15	1928	1942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963360
48	NC_011420	CGA	2	6	1950	1955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
49	NC_011420	GGA	2	6	1969	1974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963360
50	NC_011420	CGGCAG	2	12	1993	2004	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	209963360
51	NC_011420	GGC	2	6	2019	2024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
52	NC_011420	GTG	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963360
53	NC_011420	AGC	2	6	2057	2062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
54	NC_011420	CGG	2	6	2074	2079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
55	NC_011420	GCA	3	9	2115	2123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
56	NC_011420	TGG	2	6	2136	2141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963360
57	NC_011420	CGA	2	6	2181	2186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
58	NC_011420	CGG	3	9	2211	2219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
59	NC_011420	GGC	2	6	2242	2247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
60	NC_011420	GCT	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963360
61	NC_011420	CGG	2	6	2346	2351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
62	NC_011420	GCA	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
63	NC_011420	TCC	2	6	2379	2384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209963360
64	NC_011420	CGAC	2	8	2400	2407	25 %	0 %	25 %	50 %	209963360
65	NC_011420	CGG	2	6	2424	2429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
66	NC_011420	CGCT	2	8	2444	2451	0 %	25 %	25 %	50 %	209963360
67	NC_011420	GTG	2	6	2540	2545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963360
68	NC_011420	GAC	3	9	2585	2593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
69	NC_011420	GCG	5	15	2601	2615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
70	NC_011420	CGA	2	6	2659	2664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
71	NC_011420	CGG	2	6	2683	2688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
72	NC_011420	TC	3	6	2704	2709	0 %	50 %	0 %	50 %	209963360
73	NC_011420	CGG	2	6	2710	2715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
74	NC_011420	GAC	2	6	2723	2728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
75	NC_011420	CGG	2	6	2737	2742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
76	NC_011420	GTC	2	6	2756	2761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963360
77	NC_011420	GGC	2	6	2770	2775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
78	NC_011420	GC	3	6	2774	2779	0 %	0 %	50 %	50 %	209963360
79	NC_011420	CGG	2	6	2781	2786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
80	NC_011420	GGC	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
81	NC_011420	GCG	2	6	2831	2836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963360
82	NC_011420	CGA	2	6	2878	2883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
83	NC_011420	GGT	2	6	2887	2892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963360
84	NC_011420	CGA	2	6	2950	2955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
85	NC_011420	CGACC	2	10	3061	3070	20 %	0 %	20 %	60 %	209963360
86	NC_011420	CGA	2	6	3079	3084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963360
87	NC_011420	CCG	2	6	3312	3317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963360
88	NC_011420	CGC	2	6	3459	3464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963361
89	NC_011420	GGTC	2	8	3511	3518	0 %	25 %	50 %	25 %	209963361
90	NC_011420	CGGG	2	8	3526	3533	0 %	0 %	75 %	25 %	209963361
91	NC_011420	GCA	2	6	3547	3552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963361
92	NC_011420	CAG	2	6	3593	3598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963361
93	NC_011420	CCG	2	6	3604	3609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963361
94	NC_011420	CGA	2	6	3616	3621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963361
95	NC_011420	GGCG	2	8	3637	3644	0 %	0 %	75 %	25 %	209963361
96	NC_011420	GCC	2	6	3658	3663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963361
97	NC_011420	GCC	2	6	3684	3689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963361
98	NC_011420	TCA	2	6	3732	3737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209963361
99	NC_011420	AGC	2	6	3759	3764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963361
100	NC_011420	GCG	2	6	3774	3779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963361
101	NC_011420	GCC	2	6	3793	3798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963361
102	NC_011420	CGCCC	2	10	3812	3821	0 %	0 %	20 %	80 %	209963361
103	NC_011420	GCCC	2	8	3826	3833	0 %	0 %	25 %	75 %	209963361
104	NC_011420	GCCC	2	8	3838	3845	0 %	0 %	25 %	75 %	209963361
105	NC_011420	CCGG	2	8	3892	3899	0 %	0 %	50 %	50 %	209963361
106	NC_011420	GC	4	8	3943	3950	0 %	0 %	50 %	50 %	209963361
107	NC_011420	GCC	2	6	3958	3963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963361
108	NC_011420	CAG	2	6	4004	4009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963361
109	NC_011420	CCT	2	6	4132	4137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209963361
110	NC_011420	GGC	2	6	4187	4192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963361
111	NC_011420	CGG	2	6	4226	4231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963361
112	NC_011420	TCG	2	6	4287	4292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963361
113	NC_011420	GA	3	6	4293	4298	50 %	0 %	50 %	0 %	209963361
114	NC_011420	GCC	3	9	4503	4511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963362
115	NC_011420	GCG	2	6	4535	4540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963362
116	NC_011420	TGG	2	6	4550	4555	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963362
117	NC_011420	CGG	3	9	4572	4580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963362
118	NC_011420	CGC	2	6	4599	4604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963362
119	NC_011420	GC	4	8	4612	4619	0 %	0 %	50 %	50 %	209963362
120	NC_011420	CGG	2	6	4625	4630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963362
121	NC_011420	CCG	2	6	4659	4664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963362
122	NC_011420	CGA	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209963362
123	NC_011420	CGC	2	6	4770	4775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963362
124	NC_011420	CGCC	2	8	4793	4800	0 %	0 %	25 %	75 %	209963362
125	NC_011420	CATGAC	2	12	4866	4877	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	209963362
126	NC_011420	CGG	2	6	4910	4915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963362
127	NC_011420	CGG	2	6	4919	4924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963362
128	NC_011420	GGCC	2	8	4944	4951	0 %	0 %	50 %	50 %	209963362
129	NC_011420	CCGG	2	8	4972	4979	0 %	0 %	50 %	50 %	209963362
130	NC_011420	GGCG	2	8	4986	4993	0 %	0 %	75 %	25 %	209963362
131	NC_011420	GGC	2	6	5026	5031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963362
132	NC_011420	CG	3	6	5054	5059	0 %	0 %	50 %	50 %	209963362
133	NC_011420	AGG	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209963362
134	NC_011420	GGC	2	6	5161	5166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963362
135	NC_011420	GCTG	2	8	5189	5196	0 %	25 %	50 %	25 %	209963362
136	NC_011420	TCG	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963362
137	NC_011420	G	6	6	5324	5329	0 %	0 %	100 %	0 %	209963362
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265	NC_011420	CGC	2	6	9819	9824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963366
266	NC_011420	C	6	6	9859	9864	0 %	0 %	0 %	100 %	209963366
267	NC_011420	CGT	2	6	10011	10016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963366
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269	NC_011420	GCG	2	6	10088	10093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963367
270	NC_011420	GATCTC	2	12	10144	10155	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	209963367
271	NC_011420	CCG	2	6	10282	10287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963367
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273	NC_011420	TGG	2	6	10410	10415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209963367
274	NC_011420	ATG	2	6	10418	10423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209963367
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286	NC_011420	CTG	2	6	10844	10849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963368
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299	NC_011420	CCGT	2	8	11292	11299	0 %	25 %	25 %	50 %	209963370
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382	NC_011420	CG	3	6	14801	14806	0 %	0 %	50 %	50 %	209963373
383	NC_011420	CATCGC	2	12	14903	14914	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209963373
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387	NC_011420	G	6	6	15011	15016	0 %	0 %	100 %	0 %	209963373
388	NC_011420	GCG	2	6	15046	15051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209963373
389	NC_011420	TGCA	2	8	15166	15173	25 %	25 %	25 %	25 %	209963374
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391	NC_011420	CCG	2	6	15203	15208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209963374
392	NC_011420	TCG	2	6	15251	15256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209963374
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