MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG203

Total Repeats: 5256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011370	CAA	2	6	59	64	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209551939
2	NC_011370	GCC	4	12	103	114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551939
3	NC_011370	GCC	2	6	144	149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551939
4	NC_011370	GCC	2	6	181	186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551939
5	NC_011370	CG	4	8	425	432	0 %	0 %	50 %	50 %	209551939
6	NC_011370	GAA	2	6	441	446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551939
7	NC_011370	TGA	2	6	525	530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551939
8	NC_011370	GCA	2	6	598	603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551939
9	NC_011370	CGC	2	6	618	623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551939
10	NC_011370	CT	4	8	638	645	0 %	50 %	0 %	50 %	209551939
11	NC_011370	CGGA	2	8	656	663	25 %	0 %	50 %	25 %	209551939
12	NC_011370	TGT	2	6	681	686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209551939
13	NC_011370	CTT	2	6	757	762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209551939
14	NC_011370	CAA	2	6	765	770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209551939
15	NC_011370	GAA	2	6	816	821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551939
16	NC_011370	CGC	2	6	927	932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551939
17	NC_011370	AG	3	6	937	942	50 %	0 %	50 %	0 %	209551939
18	NC_011370	GGA	2	6	974	979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209551939
19	NC_011370	GAA	2	6	991	996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551939
20	NC_011370	GAA	2	6	1012	1017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551939
21	NC_011370	AGG	2	6	1040	1045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209551939
22	NC_011370	GAT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551940
23	NC_011370	TCGA	2	8	1346	1353	25 %	25 %	25 %	25 %	209551940
24	NC_011370	CGC	2	6	1399	1404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551940
25	NC_011370	TGG	2	6	1426	1431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551940
26	NC_011370	CGA	2	6	1459	1464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551940
27	NC_011370	CG	3	6	1483	1488	0 %	0 %	50 %	50 %	209551940
28	NC_011370	GAAAG	2	10	1583	1592	60 %	0 %	40 %	0 %	209551941
29	NC_011370	TGT	2	6	1598	1603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209551941
30	NC_011370	GCC	2	6	1647	1652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551941
31	NC_011370	AGCA	2	8	1701	1708	50 %	0 %	25 %	25 %	209551941
32	NC_011370	CCG	2	6	1723	1728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551941
33	NC_011370	TCGA	2	8	1791	1798	25 %	25 %	25 %	25 %	209551941
34	NC_011370	TGC	2	6	1843	1848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551941
35	NC_011370	ACA	2	6	1849	1854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209551941
36	NC_011370	GGGC	2	8	1874	1881	0 %	0 %	75 %	25 %	209551941
37	NC_011370	TGG	2	6	1982	1987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551941
38	NC_011370	ATC	2	6	1995	2000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551941
39	NC_011370	TCG	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551941
40	NC_011370	CGA	2	6	2059	2064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551941
41	NC_011370	AGC	2	6	2066	2071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551941
42	NC_011370	CAT	2	6	2135	2140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551941
43	NC_011370	CGT	2	6	2194	2199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551941
44	NC_011370	GAA	2	6	2202	2207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551941
45	NC_011370	TGG	2	6	2209	2214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551941
46	NC_011370	CG	3	6	2226	2231	0 %	0 %	50 %	50 %	209551941
47	NC_011370	CGG	2	6	2237	2242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551941
48	NC_011370	CGC	2	6	2273	2278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551941
49	NC_011370	CCTCG	2	10	2285	2294	0 %	20 %	20 %	60 %	209551941
50	NC_011370	TCA	2	6	2308	2313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551941
51	NC_011370	GCA	2	6	2442	2447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551942
52	NC_011370	GCGG	2	8	2483	2490	0 %	0 %	75 %	25 %	209551942
53	NC_011370	CAA	2	6	2494	2499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209551942
54	NC_011370	TTG	2	6	2516	2521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209551942
55	NC_011370	CGAG	2	8	2534	2541	25 %	0 %	50 %	25 %	209551942
56	NC_011370	GAC	2	6	2555	2560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551942
57	NC_011370	GCT	2	6	2629	2634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551942
58	NC_011370	TC	3	6	2664	2669	0 %	50 %	0 %	50 %	209551942
59	NC_011370	TTTC	2	8	2690	2697	0 %	75 %	0 %	25 %	209551942
60	NC_011370	CTGC	2	8	2722	2729	0 %	25 %	25 %	50 %	209551942
61	NC_011370	GAA	2	6	2735	2740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551942
62	NC_011370	GC	3	6	2882	2887	0 %	0 %	50 %	50 %	209551942
63	NC_011370	CCG	2	6	3019	3024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551942
64	NC_011370	CAG	2	6	3080	3085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551942
65	NC_011370	CGC	2	6	3091	3096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551942
66	NC_011370	TAC	2	6	3099	3104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551942
67	NC_011370	CGA	2	6	3106	3111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551942
68	NC_011370	GCC	2	6	3113	3118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551942
69	NC_011370	CCG	2	6	3179	3184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551942
70	NC_011370	CG	3	6	3183	3188	0 %	0 %	50 %	50 %	209551942
71	NC_011370	A	7	7	3189	3195	100 %	0 %	0 %	0 %	209551942
72	NC_011370	CAA	2	6	3207	3212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209551942
73	NC_011370	TGGGC	2	10	3245	3254	0 %	20 %	60 %	20 %	209551943
74	NC_011370	GTC	2	6	3310	3315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551943
75	NC_011370	GCC	2	6	3319	3324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551943
76	NC_011370	GCC	2	6	3334	3339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551943
77	NC_011370	GGC	2	6	3411	3416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551943
78	NC_011370	TGG	2	6	3419	3424	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551943
79	NC_011370	TGG	2	6	3428	3433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551943
80	NC_011370	TCCG	2	8	3453	3460	0 %	25 %	25 %	50 %	209551943
81	NC_011370	GTC	2	6	3550	3555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551943
82	NC_011370	CTTG	2	8	3603	3610	0 %	50 %	25 %	25 %	209551943
83	NC_011370	GGC	2	6	3646	3651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551943
84	NC_011370	GAA	2	6	3712	3717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551943
85	NC_011370	GAT	2	6	3723	3728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551943
86	NC_011370	CGC	2	6	3729	3734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551943
87	NC_011370	CG	3	6	3827	3832	0 %	0 %	50 %	50 %	209551943
88	NC_011370	TCCGC	2	10	3840	3849	0 %	20 %	20 %	60 %	209551943
89	NC_011370	CT	3	6	3861	3866	0 %	50 %	0 %	50 %	209551943
90	NC_011370	ACT	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551943
91	NC_011370	CGC	2	6	3985	3990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551943
92	NC_011370	CGAG	2	8	4038	4045	25 %	0 %	50 %	25 %	209551943
93	NC_011370	TCGT	2	8	4069	4076	0 %	50 %	25 %	25 %	209551943
94	NC_011370	CAGG	2	8	4137	4144	25 %	0 %	50 %	25 %	209551943
95	NC_011370	GTG	2	6	4159	4164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551943
96	NC_011370	ATCC	2	8	4205	4212	25 %	25 %	0 %	50 %	209551943
97	NC_011370	CCATC	2	10	4233	4242	20 %	20 %	0 %	60 %	209551943
98	NC_011370	CATG	2	8	4260	4267	25 %	25 %	25 %	25 %	209551943
99	NC_011370	CCG	2	6	4271	4276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551943
100	NC_011370	GCGG	2	8	4297	4304	0 %	0 %	75 %	25 %	209551943
101	NC_011370	GCC	2	6	4354	4359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551943
102	NC_011370	AGG	2	6	4412	4417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209551944
103	NC_011370	CG	4	8	4435	4442	0 %	0 %	50 %	50 %	209551944
104	NC_011370	CGC	2	6	4476	4481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551944
105	NC_011370	TG	3	6	4502	4507	0 %	50 %	50 %	0 %	209551944
106	NC_011370	TCA	2	6	4570	4575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551944
107	NC_011370	AAG	2	6	4590	4595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551944
108	NC_011370	CGA	2	6	4684	4689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551944
109	NC_011370	TGA	2	6	4747	4752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551944
110	NC_011370	GAA	2	6	4792	4797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551944
111	NC_011370	TCG	2	6	4864	4869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551944
112	NC_011370	TGG	2	6	4888	4893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551944
113	NC_011370	TCG	2	6	4903	4908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551944
114	NC_011370	GCC	2	6	4965	4970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551944
115	NC_011370	CAA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209551944
116	NC_011370	TC	3	6	5052	5057	0 %	50 %	0 %	50 %	209551944
117	NC_011370	CGC	2	6	5065	5070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551944
118	NC_011370	CGCGG	2	10	5112	5121	0 %	0 %	60 %	40 %	209551944
119	NC_011370	TCG	2	6	5149	5154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551944
120	NC_011370	GGA	2	6	5156	5161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209551944
121	NC_011370	GGC	2	6	5167	5172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551944
122	NC_011370	TGG	2	6	5230	5235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551944
123	NC_011370	ATCC	2	8	5239	5246	25 %	25 %	0 %	50 %	209551944
124	NC_011370	GGA	2	6	5309	5314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209551944
125	NC_011370	GGAC	2	8	5423	5430	25 %	0 %	50 %	25 %	209551944
126	NC_011370	GGTT	2	8	5607	5614	0 %	50 %	50 %	0 %	209551944
127	NC_011370	GGT	2	6	5694	5699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551944
128	NC_011370	GGAC	2	8	5825	5832	25 %	0 %	50 %	25 %	209551944
129	NC_011370	GAA	2	6	5951	5956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551944
130	NC_011370	AAG	3	9	6047	6055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209551945
131	NC_011370	GTC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551945
132	NC_011370	CGG	2	6	6067	6072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551945
133	NC_011370	CGA	2	6	6220	6225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551945
134	NC_011370	TTG	2	6	6315	6320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209551945
135	NC_011370	TCG	2	6	6343	6348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551945
136	NC_011370	TCC	2	6	6378	6383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209551945
137	NC_011370	CG	4	8	6385	6392	0 %	0 %	50 %	50 %	209551945
138	NC_011370	CG	3	6	6397	6402	0 %	0 %	50 %	50 %	209551945
139	NC_011370	GCA	2	6	6468	6473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551945
140	NC_011370	AGCA	2	8	6493	6500	50 %	0 %	25 %	25 %	209551945
141	NC_011370	GCG	2	6	6628	6633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551945
142	NC_011370	CCG	2	6	6768	6773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551945
143	NC_011370	CG	3	6	6795	6800	0 %	0 %	50 %	50 %	209551946
144	NC_011370	AAC	2	6	6809	6814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209551946
145	NC_011370	GCC	2	6	6964	6969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551946
146	NC_011370	TCCGAG	2	12	7002	7013	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	209551946
147	NC_011370	CGTGG	2	10	7023	7032	0 %	20 %	60 %	20 %	209551946
148	NC_011370	GGAT	2	8	7146	7153	25 %	25 %	50 %	0 %	209551946
149	NC_011370	CGG	2	6	7161	7166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551946
150	NC_011370	GA	3	6	7199	7204	50 %	0 %	50 %	0 %	209551946
151	NC_011370	GTG	2	6	7222	7227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209551946
152	NC_011370	GC	3	6	7234	7239	0 %	0 %	50 %	50 %	209551946
153	NC_011370	GCT	2	6	7275	7280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551946
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156	NC_011370	TTG	2	6	7451	7456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209551946
157	NC_011370	GAC	2	6	7505	7510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551946
158	NC_011370	GA	3	6	7574	7579	50 %	0 %	50 %	0 %	209551946
159	NC_011370	TTG	2	6	7625	7630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209551946
160	NC_011370	CGC	2	6	7818	7823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551947
161	NC_011370	GGA	2	6	7837	7842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209551947
162	NC_011370	CGG	2	6	7894	7899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551947
163	NC_011370	GAG	2	6	7913	7918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209551947
164	NC_011370	CGTC	2	8	7986	7993	0 %	25 %	25 %	50 %	209551947
165	NC_011370	GCG	2	6	8022	8027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551947
166	NC_011370	GAT	2	6	8029	8034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551947
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168	NC_011370	GCA	2	6	8085	8090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551947
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170	NC_011370	GC	3	6	8249	8254	0 %	0 %	50 %	50 %	209551947
171	NC_011370	CAAC	2	8	8357	8364	50 %	0 %	0 %	50 %	209551947
172	NC_011370	CGA	2	6	8380	8385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551947
173	NC_011370	GAG	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209551947
174	NC_011370	CGG	2	6	8458	8463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551947
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176	NC_011370	TCT	2	6	8618	8623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209551947
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184	NC_011370	CGGA	2	8	8925	8932	25 %	0 %	50 %	25 %	209551948
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250	NC_011370	GGCG	2	8	12145	12152	0 %	0 %	75 %	25 %	209551951
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253	NC_011370	CGTG	2	8	12283	12290	0 %	25 %	50 %	25 %	209551951
254	NC_011370	AC	3	6	12294	12299	50 %	0 %	0 %	50 %	209551951
255	NC_011370	GGC	2	6	12328	12333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551951
256	NC_011370	TGCA	2	8	12339	12346	25 %	25 %	25 %	25 %	209551951
257	NC_011370	GCT	2	6	12364	12369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551951
258	NC_011370	CGG	2	6	12484	12489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551951
259	NC_011370	GCC	3	9	12494	12502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551951
260	NC_011370	ATGG	2	8	12649	12656	25 %	25 %	50 %	0 %	209551952
261	NC_011370	GAT	2	6	12763	12768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551952
262	NC_011370	ATG	2	6	12774	12779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551952
263	NC_011370	AGG	2	6	12792	12797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209551952
264	NC_011370	ACA	2	6	12851	12856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209551952
265	NC_011370	GCG	2	6	12950	12955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551952
266	NC_011370	CGT	2	6	13072	13077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551952
267	NC_011370	TGC	2	6	13152	13157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551952
268	NC_011370	GAC	2	6	13163	13168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551952
269	NC_011370	GCT	3	9	13171	13179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551952
270	NC_011370	T	6	6	13203	13208	0 %	100 %	0 %	0 %	209551952
271	NC_011370	GC	3	6	13302	13307	0 %	0 %	50 %	50 %	209551952
272	NC_011370	TTCT	2	8	13344	13351	0 %	75 %	0 %	25 %	209551952
273	NC_011370	GCC	2	6	13367	13372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551952
274	NC_011370	TCA	2	6	13640	13645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551953
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277	NC_011370	TGC	2	6	13703	13708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551953
278	NC_011370	TCT	2	6	13743	13748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209551953
279	NC_011370	ATC	2	6	13753	13758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551953
280	NC_011370	GCA	2	6	13883	13888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551953
281	NC_011370	ATG	2	6	13891	13896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209551953
282	NC_011370	CAT	2	6	13926	13931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551953
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284	NC_011370	TTCC	3	12	14027	14038	0 %	50 %	0 %	50 %	209551954
285	NC_011370	GCG	2	6	14087	14092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551954
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288	NC_011370	TCA	2	6	14200	14205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551954
289	NC_011370	CGT	2	6	14276	14281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209551954
290	NC_011370	AG	3	6	14302	14307	50 %	0 %	50 %	0 %	209551954
291	NC_011370	CCA	2	6	14313	14318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209551954
292	NC_011370	CGG	2	6	14388	14393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551954
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295	NC_011370	GCG	2	6	14478	14483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551954
296	NC_011370	ATCA	2	8	14489	14496	50 %	25 %	0 %	25 %	209551954
297	NC_011370	AAAC	2	8	14593	14600	75 %	0 %	0 %	25 %	209551955
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299	NC_011370	TTTG	2	8	14640	14647	0 %	75 %	25 %	0 %	209551955
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305	NC_011370	CGC	2	6	14975	14980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551955
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322	NC_011370	CGA	2	6	16182	16187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551956
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382	NC_011370	CCT	2	6	18661	18666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209551958
383	NC_011370	TGT	2	6	18705	18710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209551958
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385	NC_011370	CGGCG	2	10	18999	19008	0 %	0 %	60 %	40 %	209551959
386	NC_011370	CGA	2	6	19069	19074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209551959
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390	NC_011370	TTC	2	6	19190	19195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209551959
391	NC_011370	CGG	2	6	19254	19259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209551959
392	NC_011370	CCG	2	6	19276	19281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551959
393	NC_011370	CCG	2	6	19297	19302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209551959
394	NC_011370	ATC	2	6	19323	19328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209551959
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