MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 96261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_011369	ATC	2	6	45022	45027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547656
1003	NC_011369	CTT	2	6	45088	45093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547656
1004	NC_011369	CGC	2	6	45126	45131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547656
1005	NC_011369	CGC	2	6	45162	45167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547656
1006	NC_011369	CGA	2	6	45177	45182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547656
1007	NC_011369	GGC	2	6	45201	45206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547656
1008	NC_011369	TCG	2	6	45242	45247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547656
1009	NC_011369	CG	3	6	45246	45251	0 %	0 %	50 %	50 %	209547656
1010	NC_011369	CGA	2	6	45279	45284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547656
1011	NC_011369	ACC	2	6	45302	45307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547656
1012	NC_011369	CCT	2	6	45330	45335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547656
1013	NC_011369	CGCT	2	8	45336	45343	0 %	25 %	25 %	50 %	209547656
1014	NC_011369	GCG	2	6	45372	45377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547656
1015	NC_011369	AGC	2	6	45416	45421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547656
1016	NC_011369	CGG	2	6	45498	45503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547656
1017	NC_011369	CGG	2	6	45519	45524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547656
1018	NC_011369	GGC	2	6	45526	45531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547656
1019	NC_011369	GAC	2	6	45550	45555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547656
1020	NC_011369	CG	3	6	45574	45579	0 %	0 %	50 %	50 %	209547656
1021	NC_011369	CGC	2	6	45600	45605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547656
1022	NC_011369	GGT	2	6	45610	45615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547656
1023	NC_011369	GCC	2	6	45616	45621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547656
1024	NC_011369	GAG	2	6	45626	45631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547656
1025	NC_011369	CTT	2	6	45673	45678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547656
1026	NC_011369	TCG	2	6	45701	45706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547656
1027	NC_011369	AGGCC	2	10	45783	45792	20 %	0 %	40 %	40 %	209547656
1028	NC_011369	CGA	2	6	45816	45821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547656
1029	NC_011369	GCG	2	6	45841	45846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547656
1030	NC_011369	GCC	2	6	45849	45854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547656
1031	NC_011369	GAT	2	6	45865	45870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547656
1032	NC_011369	GAA	2	6	46121	46126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547657
1033	NC_011369	GCC	2	6	46137	46142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547657
1034	NC_011369	CCGG	2	8	46153	46160	0 %	0 %	50 %	50 %	209547657
1035	NC_011369	GTT	2	6	46178	46183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547657
1036	NC_011369	CCGC	2	8	46189	46196	0 %	0 %	25 %	75 %	209547657
1037	NC_011369	GCG	2	6	46199	46204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547657
1038	NC_011369	TGC	2	6	46216	46221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547657
1039	NC_011369	TCA	2	6	46234	46239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547657
1040	NC_011369	GCT	2	6	46245	46250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547657
1041	NC_011369	ATCT	2	8	46275	46282	25 %	50 %	0 %	25 %	209547657
1042	NC_011369	GCCG	2	8	46353	46360	0 %	0 %	50 %	50 %	209547657
1043	NC_011369	ATT	2	6	46378	46383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	209547657
1044	NC_011369	TCA	2	6	46429	46434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547657
1045	NC_011369	GCC	2	6	46452	46457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547657
1046	NC_011369	ATGA	2	8	46464	46471	50 %	25 %	25 %	0 %	209547657
1047	NC_011369	CGT	2	6	46487	46492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547657
1048	NC_011369	CCG	2	6	46501	46506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547657
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1050	NC_011369	CCGC	2	8	46591	46598	0 %	0 %	25 %	75 %	209547657
1051	NC_011369	CGA	2	6	46628	46633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547657
1052	NC_011369	TCACCA	2	12	46639	46650	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	209547657
1053	NC_011369	TTG	2	6	46666	46671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547657
1054	NC_011369	ATCC	2	8	46741	46748	25 %	25 %	0 %	50 %	209547657
1055	NC_011369	CCAT	2	8	46750	46757	25 %	25 %	0 %	50 %	209547657
1056	NC_011369	CGGGCG	2	12	46870	46881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547658
1057	NC_011369	GCA	2	6	46883	46888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547658
1058	NC_011369	AC	3	6	46973	46978	50 %	0 %	0 %	50 %	209547658
1059	NC_011369	CAAGGT	2	12	46994	47005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	209547658
1060	NC_011369	GAC	3	9	47015	47023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547658
1061	NC_011369	ACAAGG	2	12	47053	47064	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	209547658
1062	NC_011369	GCCG	2	8	47072	47079	0 %	0 %	50 %	50 %	209547658
1063	NC_011369	CGC	2	6	47096	47101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547658
1064	NC_011369	GCA	2	6	47108	47113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547658
1065	NC_011369	CTG	2	6	47175	47180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547658
1066	NC_011369	CCG	2	6	47203	47208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547658
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1069	NC_011369	CAA	2	6	47264	47269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547658
1070	NC_011369	GCG	2	6	47356	47361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547658
1071	NC_011369	GCA	2	6	47405	47410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547658
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1093	NC_011369	CAA	2	6	48189	48194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209547659
1094	NC_011369	TGA	2	6	48439	48444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547660
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1098	NC_011369	GAA	2	6	48524	48529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547660
1099	NC_011369	GCT	2	6	48533	48538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547660
1100	NC_011369	GGCG	2	8	48563	48570	0 %	0 %	75 %	25 %	209547660
1101	NC_011369	GGA	2	6	48614	48619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547660
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1105	NC_011369	GAC	2	6	48750	48755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547660
1106	NC_011369	GC	3	6	48757	48762	0 %	0 %	50 %	50 %	209547660
1107	NC_011369	TCG	2	6	48787	48792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547660
1108	NC_011369	GCG	3	9	48817	48825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547660
1109	NC_011369	CGA	2	6	48845	48850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547660
1110	NC_011369	TCG	2	6	48853	48858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547660
1111	NC_011369	ATC	2	6	48880	48885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547660
1112	NC_011369	CAG	2	6	48891	48896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547660
1113	NC_011369	TCG	2	6	48946	48951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547660
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1116	NC_011369	GCC	2	6	49044	49049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547660
1117	NC_011369	CTG	2	6	49170	49175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547660
1118	NC_011369	GCGCG	2	10	49176	49185	0 %	0 %	60 %	40 %	209547660
1119	NC_011369	GCG	2	6	49210	49215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547660
1120	NC_011369	CGA	2	6	49217	49222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547660
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1123	NC_011369	CG	3	6	49381	49386	0 %	0 %	50 %	50 %	209547660
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1244	NC_011369	CGG	2	6	55152	55157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547665
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1495	NC_011369	GAC	2	6	66252	66257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547678
1496	NC_011369	TCT	2	6	66263	66268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547678
1497	NC_011369	TTC	2	6	66316	66321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209547678
1498	NC_011369	GCC	2	6	66331	66336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547678
1499	NC_011369	TGCA	2	8	66337	66344	25 %	25 %	25 %	25 %	209547678
1500	NC_011369	TCG	2	6	66404	66409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547678

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