MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 96261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_011369	CCCG	2	8	648652	648659	0 %	0 %	25 %	75 %	209548232
14002	NC_011369	TCG	2	6	648699	648704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548232
14003	NC_011369	CGA	2	6	648730	648735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548232
14004	NC_011369	CACCGA	2	12	648758	648769	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	209548232
14005	NC_011369	TGA	2	6	648808	648813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548232
14006	NC_011369	GCG	2	6	648832	648837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548232
14007	NC_011369	CGT	2	6	648892	648897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548232
14008	NC_011369	CCTT	2	8	648927	648934	0 %	50 %	0 %	50 %	209548232
14009	NC_011369	GTC	2	6	648954	648959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548232
14010	NC_011369	CA	3	6	648982	648987	50 %	0 %	0 %	50 %	209548232
14011	NC_011369	GCG	2	6	649015	649020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548232
14012	NC_011369	ATC	2	6	649032	649037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548232
14013	NC_011369	CGA	2	6	649039	649044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548232
14014	NC_011369	CGA	2	6	649072	649077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548232
14015	NC_011369	GCCG	2	8	649106	649113	0 %	0 %	50 %	50 %	209548232
14016	NC_011369	CTG	2	6	649142	649147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548232
14017	NC_011369	CGG	2	6	649156	649161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548232
14018	NC_011369	ATC	2	6	649299	649304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548232
14019	NC_011369	ATC	2	6	649723	649728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548233
14020	NC_011369	TCT	2	6	649742	649747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548233
14021	NC_011369	CCG	2	6	649787	649792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548233
14022	NC_011369	GCA	2	6	649843	649848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548233
14023	NC_011369	TGG	2	6	650048	650053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209548233
14024	NC_011369	GAGT	2	8	650057	650064	25 %	25 %	50 %	0 %	209548233
14025	NC_011369	GCG	2	6	650078	650083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548233
14026	NC_011369	A	6	6	650090	650095	100 %	0 %	0 %	0 %	209548233
14027	NC_011369	ATC	2	6	650272	650277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548234
14028	NC_011369	CCG	2	6	650291	650296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548234
14029	NC_011369	CGT	2	6	650341	650346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548234
14030	NC_011369	GCG	2	6	650371	650376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548234
14031	NC_011369	AGC	2	6	650407	650412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548234
14032	NC_011369	GCG	2	6	650532	650537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548234
14033	NC_011369	TC	3	6	650559	650564	0 %	50 %	0 %	50 %	209548234
14034	NC_011369	GCG	2	6	650618	650623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548234
14035	NC_011369	CGC	2	6	650639	650644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548234
14036	NC_011369	GAC	2	6	650741	650746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548234
14037	NC_011369	TCGG	2	8	650754	650761	0 %	25 %	50 %	25 %	209548234
14038	NC_011369	GCC	2	6	650767	650772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548234
14039	NC_011369	GGC	2	6	650810	650815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548234
14040	NC_011369	CG	3	6	650844	650849	0 %	0 %	50 %	50 %	209548234
14041	NC_011369	GCC	2	6	650855	650860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548234
14042	NC_011369	ACCG	2	8	650930	650937	25 %	0 %	25 %	50 %	209548234
14043	NC_011369	TCG	2	6	650970	650975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548234
14044	NC_011369	TCA	2	6	650989	650994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548234
14045	NC_011369	TCG	2	6	651000	651005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548234
14046	NC_011369	CGGC	2	8	651037	651044	0 %	0 %	50 %	50 %	209548234
14047	NC_011369	GCG	2	6	651099	651104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548234
14048	NC_011369	GCAT	2	8	651141	651148	25 %	25 %	25 %	25 %	209548234
14049	NC_011369	CGG	2	6	651154	651159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548234
14050	NC_011369	CGAT	2	8	651164	651171	25 %	25 %	25 %	25 %	209548234
14051	NC_011369	GC	3	6	651216	651221	0 %	0 %	50 %	50 %	209548234
14052	NC_011369	GCC	3	9	651239	651247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548234
14053	NC_011369	GCC	2	6	651275	651280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548234
14054	NC_011369	TCG	2	6	651297	651302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548234
14055	NC_011369	CG	3	6	651324	651329	0 %	0 %	50 %	50 %	209548234
14056	NC_011369	GCC	2	6	651336	651341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548234
14057	NC_011369	TCG	2	6	651351	651356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548234
14058	NC_011369	ACG	2	6	651467	651472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548235
14059	NC_011369	GAG	2	6	651475	651480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548235
14060	NC_011369	GCC	2	6	651541	651546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548235
14061	NC_011369	ATC	2	6	651563	651568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548235
14062	NC_011369	GCA	2	6	651569	651574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548235
14063	NC_011369	ATC	2	6	651590	651595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548235
14064	NC_011369	GC	3	6	651706	651711	0 %	0 %	50 %	50 %	209548235
14065	NC_011369	CTTC	2	8	651786	651793	0 %	50 %	0 %	50 %	209548235
14066	NC_011369	CG	3	6	651835	651840	0 %	0 %	50 %	50 %	209548235
14067	NC_011369	CG	3	6	651919	651924	0 %	0 %	50 %	50 %	209548235
14068	NC_011369	TGA	2	6	651939	651944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548235
14069	NC_011369	CGT	2	6	651988	651993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548235
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14071	NC_011369	GCG	2	6	652128	652133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548235
14072	NC_011369	ACCGT	2	10	652193	652202	20 %	20 %	20 %	40 %	209548235
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14074	NC_011369	CAT	2	6	652264	652269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548235
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14077	NC_011369	CCCA	2	8	652459	652466	25 %	0 %	0 %	75 %	209548235
14078	NC_011369	CGC	2	6	652576	652581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548235
14079	NC_011369	GATC	2	8	652656	652663	25 %	25 %	25 %	25 %	209548235
14080	NC_011369	CGGC	2	8	652712	652719	0 %	0 %	50 %	50 %	209548236
14081	NC_011369	CGA	2	6	652727	652732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548236
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14083	NC_011369	GA	3	6	652800	652805	50 %	0 %	50 %	0 %	209548236
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14087	NC_011369	GCC	2	6	652916	652921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548236
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14089	NC_011369	TCC	2	6	652945	652950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548236
14090	NC_011369	CAGG	2	8	653088	653095	25 %	0 %	50 %	25 %	209548236
14091	NC_011369	GCGG	2	8	653100	653107	0 %	0 %	75 %	25 %	209548236
14092	NC_011369	CGA	2	6	653111	653116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548236
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14095	NC_011369	TGAA	2	8	653197	653204	50 %	25 %	25 %	0 %	209548236
14096	NC_011369	TGGG	2	8	653209	653216	0 %	25 %	75 %	0 %	209548236
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14102	NC_011369	ACCG	2	8	653497	653504	25 %	0 %	25 %	50 %	209548236
14103	NC_011369	ACGGC	2	10	653590	653599	20 %	0 %	40 %	40 %	209548236
14104	NC_011369	CCT	2	6	653604	653609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548236
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14107	NC_011369	GCC	2	6	653806	653811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548236
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14113	NC_011369	TCG	2	6	654211	654216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548237
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14119	NC_011369	CGG	2	6	654375	654380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548237
14120	NC_011369	AAC	2	6	654396	654401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209548237
14121	NC_011369	TCG	2	6	654421	654426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548237
14122	NC_011369	GCA	2	6	655290	655295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548238
14123	NC_011369	GCA	2	6	655299	655304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548238
14124	NC_011369	CGG	2	6	655321	655326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548238
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14127	NC_011369	CTT	2	6	655465	655470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548238
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14130	NC_011369	CTTC	2	8	655590	655597	0 %	50 %	0 %	50 %	209548238
14131	NC_011369	GCA	2	6	655605	655610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548238
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14151	NC_011369	CGAGC	2	10	656641	656650	20 %	0 %	40 %	40 %	209548238
14152	NC_011369	CCGG	2	8	656652	656659	0 %	0 %	50 %	50 %	209548238
14153	NC_011369	CAG	2	6	656668	656673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548238
14154	NC_011369	GCCG	2	8	656721	656728	0 %	0 %	50 %	50 %	209548238
14155	NC_011369	AGC	2	6	656741	656746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548238
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14223	NC_011369	GTC	2	6	659856	659861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548240
14224	NC_011369	GGC	2	6	659873	659878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548240
14225	NC_011369	CGC	2	6	659887	659892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548240
14226	NC_011369	GGCG	2	8	659920	659927	0 %	0 %	75 %	25 %	209548240
14227	NC_011369	GCG	2	6	659930	659935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548240
14228	NC_011369	ACT	2	6	660066	660071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548240
14229	NC_011369	CGT	2	6	660131	660136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548241
14230	NC_011369	GAT	2	6	660191	660196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548241
14231	NC_011369	CTC	2	6	660206	660211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209548241
14232	NC_011369	ATCAG	2	10	660219	660228	40 %	20 %	20 %	20 %	209548241
14233	NC_011369	CGG	3	9	660274	660282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548241
14234	NC_011369	CTT	2	6	660338	660343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548241
14235	NC_011369	CGA	2	6	660349	660354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548241
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14237	NC_011369	CGG	2	6	660462	660467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548241
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14473	NC_011369	CGATG	2	10	671613	671622	20 %	20 %	40 %	20 %	209548255
14474	NC_011369	GCC	2	6	671626	671631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548255
14475	NC_011369	GAC	2	6	671635	671640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548255
14476	NC_011369	AAG	2	6	671710	671715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548255
14477	NC_011369	CTTG	2	8	671742	671749	0 %	50 %	25 %	25 %	209548255
14478	NC_011369	CTT	2	6	671799	671804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548255
14479	NC_011369	ACG	2	6	671815	671820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548255
14480	NC_011369	GCC	2	6	671843	671848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548255
14481	NC_011369	TCG	2	6	671852	671857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548255
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14484	NC_011369	GC	3	6	672057	672062	0 %	0 %	50 %	50 %	209548255
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14486	NC_011369	ATGC	2	8	672134	672141	25 %	25 %	25 %	25 %	209548255
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14493	NC_011369	GTC	2	6	672604	672609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548256
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14498	NC_011369	TCG	2	6	672904	672909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548257
14499	NC_011369	CG	3	6	673000	673005	0 %	0 %	50 %	50 %	209548257
14500	NC_011369	GCT	2	6	673027	673032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548257

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