MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 96261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_011369	GCC	2	6	579138	579143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548163
12502	NC_011369	CTG	2	6	579150	579155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548163
12503	NC_011369	TGA	2	6	579178	579183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548163
12504	NC_011369	ACGA	2	8	579232	579239	50 %	0 %	25 %	25 %	209548163
12505	NC_011369	CGA	2	6	579256	579261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548163
12506	NC_011369	GCC	2	6	579267	579272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548163
12507	NC_011369	GCGG	2	8	579273	579280	0 %	0 %	75 %	25 %	209548163
12508	NC_011369	ATG	2	6	579285	579290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548163
12509	NC_011369	CGGCG	2	10	579371	579380	0 %	0 %	60 %	40 %	209548163
12510	NC_011369	CAC	2	6	579408	579413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548163
12511	NC_011369	GATC	2	8	579494	579501	25 %	25 %	25 %	25 %	209548163
12512	NC_011369	GGC	2	6	579502	579507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548163
12513	NC_011369	ATC	2	6	579510	579515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548163
12514	NC_011369	GAC	2	6	579534	579539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548163
12515	NC_011369	GCC	2	6	579691	579696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548163
12516	NC_011369	GCC	3	9	579735	579743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548163
12517	NC_011369	GAA	2	6	579798	579803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209548163
12518	NC_011369	AGG	2	6	579988	579993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209548164
12519	NC_011369	GCG	2	6	580020	580025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548164
12520	NC_011369	AGCG	2	8	580027	580034	25 %	0 %	50 %	25 %	209548164
12521	NC_011369	CGG	2	6	580055	580060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548164
12522	NC_011369	CTT	2	6	580077	580082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209548164
12523	NC_011369	CGA	2	6	580112	580117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548164
12524	NC_011369	CGCC	2	8	580130	580137	0 %	0 %	25 %	75 %	209548164
12525	NC_011369	TCCA	2	8	580138	580145	25 %	25 %	0 %	50 %	209548164
12526	NC_011369	TCG	2	6	580328	580333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548164
12527	NC_011369	TCCG	2	8	580394	580401	0 %	25 %	25 %	50 %	209548164
12528	NC_011369	ATG	2	6	580417	580422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548164
12529	NC_011369	GCA	2	6	580424	580429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548164
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12531	NC_011369	TCGA	2	8	580489	580496	25 %	25 %	25 %	25 %	209548164
12532	NC_011369	CGC	2	6	580508	580513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548164
12533	NC_011369	TTG	2	6	580534	580539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209548164
12534	NC_011369	ATC	2	6	580582	580587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548164
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12539	NC_011369	TGA	3	9	581130	581138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209548165
12540	NC_011369	ATGTCG	2	12	581184	581195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209548165
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12542	NC_011369	CCA	2	6	581350	581355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548166
12543	NC_011369	GCC	2	6	581414	581419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548166
12544	NC_011369	CGA	2	6	581422	581427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548166
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12547	NC_011369	CGGCGC	2	12	581521	581532	0 %	0 %	50 %	50 %	209548166
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12550	NC_011369	GCGG	2	8	581642	581649	0 %	0 %	75 %	25 %	209548166
12551	NC_011369	AGCG	2	8	581663	581670	25 %	0 %	50 %	25 %	209548166
12552	NC_011369	GCTTCG	2	12	581676	581687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548166
12553	NC_011369	GCCGGC	2	12	581732	581743	0 %	0 %	50 %	50 %	209548166
12554	NC_011369	GCC	2	6	581834	581839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209548166
12555	NC_011369	CGG	3	9	581840	581848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548166
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12557	NC_011369	CGA	2	6	581872	581877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548166
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12565	NC_011369	GGCCG	2	10	582234	582243	0 %	0 %	60 %	40 %	209548166
12566	NC_011369	TGC	2	6	582339	582344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548166
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12601	NC_011369	CGG	2	6	584063	584068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548168
12602	NC_011369	GCA	2	6	584171	584176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209548168
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12975	NC_011369	CGG	2	6	600158	600163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548181
12976	NC_011369	TCG	2	6	600192	600197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548181
12977	NC_011369	CGG	2	6	600254	600259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548181
12978	NC_011369	CGG	2	6	600298	600303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548181
12979	NC_011369	GA	3	6	600336	600341	50 %	0 %	50 %	0 %	209548181
12980	NC_011369	ACC	2	6	600345	600350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209548181
12981	NC_011369	TCG	2	6	600409	600414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548181
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12983	NC_011369	GGC	2	6	600464	600469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209548181
12984	NC_011369	TGC	2	6	600496	600501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548181
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12988	NC_011369	GCT	2	6	600659	600664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548181
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12996	NC_011369	GC	3	6	600856	600861	0 %	0 %	50 %	50 %	209548181
12997	NC_011369	CAT	2	6	600869	600874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209548181
12998	NC_011369	TCG	2	6	600883	600888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548181
12999	NC_011369	CTGG	2	8	600890	600897	0 %	25 %	50 %	25 %	209548181
13000	NC_011369	TCG	2	6	600901	600906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209548181

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