MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 chromosome

Total Repeats: 96261

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011369	CGG	2	6	23855	23860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547638
502	NC_011369	CGAG	2	8	23888	23895	25 %	0 %	50 %	25 %	209547638
503	NC_011369	TGC	2	6	23995	24000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547638
504	NC_011369	CGG	2	6	24047	24052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547638
505	NC_011369	GGC	3	9	24060	24068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547638
506	NC_011369	GCAT	2	8	24121	24128	25 %	25 %	25 %	25 %	209547638
507	NC_011369	CGA	2	6	24131	24136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547638
508	NC_011369	CCT	2	6	24158	24163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547638
509	NC_011369	GCG	2	6	24177	24182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547638
510	NC_011369	ATC	2	6	24526	24531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547639
511	NC_011369	GAA	2	6	24541	24546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209547639
512	NC_011369	GCC	2	6	24556	24561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547639
513	NC_011369	CGC	2	6	24577	24582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547639
514	NC_011369	CAG	2	6	24610	24615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547639
515	NC_011369	CTC	2	6	24633	24638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209547639
516	NC_011369	CAC	3	9	24646	24654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	209547639
517	NC_011369	CGGCTG	2	12	24670	24681	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	209547639
518	NC_011369	GTC	2	6	24739	24744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547639
519	NC_011369	GAC	2	6	24745	24750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547639
520	NC_011369	GTCAT	2	10	24779	24788	20 %	40 %	20 %	20 %	209547639
521	NC_011369	TCAT	2	8	25059	25066	25 %	50 %	0 %	25 %	209547640
522	NC_011369	AGG	2	6	25077	25082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547640
523	NC_011369	CGC	2	6	25165	25170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547640
524	NC_011369	GCC	2	6	25179	25184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547640
525	NC_011369	GAT	2	6	25189	25194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547640
526	NC_011369	CGC	2	6	25220	25225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547640
527	NC_011369	CT	3	6	25231	25236	0 %	50 %	0 %	50 %	209547640
528	NC_011369	GGC	2	6	25252	25257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547640
529	NC_011369	CAT	2	6	25291	25296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547640
530	NC_011369	GCC	2	6	25301	25306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547640
531	NC_011369	GC	3	6	25311	25316	0 %	0 %	50 %	50 %	209547640
532	NC_011369	CGG	2	6	25324	25329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547640
533	NC_011369	ATGTCG	2	12	25359	25370	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	209547640
534	NC_011369	TTG	2	6	25393	25398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209547640
535	NC_011369	TC	3	6	25607	25612	0 %	50 %	0 %	50 %	209547641
536	NC_011369	CTG	2	6	25629	25634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547641
537	NC_011369	CCG	2	6	25635	25640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547641
538	NC_011369	GCG	2	6	25657	25662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547641
539	NC_011369	GCC	2	6	25681	25686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547641
540	NC_011369	GGC	3	9	25696	25704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547641
541	NC_011369	CAG	2	6	25732	25737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547641
542	NC_011369	GCG	2	6	25764	25769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547641
543	NC_011369	GCC	2	6	25817	25822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547641
544	NC_011369	CCG	2	6	25830	25835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547641
545	NC_011369	CGA	2	6	25839	25844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547641
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547	NC_011369	GTG	2	6	25907	25912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547641
548	NC_011369	CAG	2	6	25915	25920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547641
549	NC_011369	CGG	2	6	25938	25943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547641
550	NC_011369	GC	3	6	25968	25973	0 %	0 %	50 %	50 %	209547641
551	NC_011369	TGG	2	6	26010	26015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547641
552	NC_011369	CCG	2	6	26025	26030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547641
553	NC_011369	CGA	2	6	26139	26144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547641
554	NC_011369	CGG	2	6	26145	26150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547641
555	NC_011369	GAT	2	6	26191	26196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547641
556	NC_011369	TCG	2	6	26198	26203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547641
557	NC_011369	GGC	2	6	26224	26229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547641
558	NC_011369	TCGA	2	8	26255	26262	25 %	25 %	25 %	25 %	209547641
559	NC_011369	GCC	2	6	26296	26301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547641
560	NC_011369	GCA	3	9	26325	26333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547641
561	NC_011369	CGA	2	6	26352	26357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547641
562	NC_011369	GAG	2	6	26420	26425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547641
563	NC_011369	GCC	2	6	26464	26469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547641
564	NC_011369	CCG	3	9	26475	26483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209547641
565	NC_011369	CAG	2	6	26497	26502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547641
566	NC_011369	GCCG	2	8	26551	26558	0 %	0 %	50 %	50 %	209547641
567	NC_011369	GAC	2	6	26575	26580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547641
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570	NC_011369	C	6	6	26610	26615	0 %	0 %	0 %	100 %	209547641
571	NC_011369	ATC	2	6	26681	26686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547641
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573	NC_011369	ATG	2	6	26728	26733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209547641
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593	NC_011369	CGG	2	6	27584	27589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547642
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595	NC_011369	GC	3	6	27620	27625	0 %	0 %	50 %	50 %	209547642
596	NC_011369	ATC	2	6	27678	27683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547642
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610	NC_011369	AGC	2	6	28128	28133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547642
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619	NC_011369	GATC	2	8	28549	28556	25 %	25 %	25 %	25 %	209547642
620	NC_011369	GA	3	6	28560	28565	50 %	0 %	50 %	0 %	209547642
621	NC_011369	TCG	2	6	28590	28595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547642
622	NC_011369	GTG	2	6	28604	28609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209547642
623	NC_011369	CAT	2	6	28625	28630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209547642
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626	NC_011369	TCG	2	6	28752	28757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209547642
627	NC_011369	GGA	2	6	28861	28866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209547642
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632	NC_011369	CGA	2	6	29068	29073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547642
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745	NC_011369	GC	3	6	33645	33650	0 %	0 %	50 %	50 %	209547645
746	NC_011369	AAGGC	2	10	33672	33681	40 %	0 %	40 %	20 %	209547645
747	NC_011369	TCGAT	2	10	33708	33717	20 %	40 %	20 %	20 %	209547645
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751	NC_011369	CGG	2	6	33787	33792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209547645
752	NC_011369	ACG	2	6	33876	33881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209547645
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