MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304 plasmid pRLG202

Total Repeats: 11129

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_011366	TGG	2	6	227214	227219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	209546199
5002	NC_011366	ATC	2	6	227255	227260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546199
5003	NC_011366	GCG	2	6	227273	227278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546199
5004	NC_011366	GCCG	2	8	227308	227315	0 %	0 %	50 %	50 %	209546199
5005	NC_011366	GC	3	6	227327	227332	0 %	0 %	50 %	50 %	209546199
5006	NC_011366	CGAC	2	8	227376	227383	25 %	0 %	25 %	50 %	209546199
5007	NC_011366	GGCAC	2	10	227427	227436	20 %	0 %	40 %	40 %	209546199
5008	NC_011366	CAA	2	6	227464	227469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	209546199
5009	NC_011366	GAG	2	6	227474	227479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	209546199
5010	NC_011366	TCG	2	6	227520	227525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546199
5011	NC_011366	CGG	2	6	227536	227541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546199
5012	NC_011366	GC	3	6	227551	227556	0 %	0 %	50 %	50 %	209546199
5013	NC_011366	ATG	2	6	227567	227572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546199
5014	NC_011366	CTGC	2	8	227590	227597	0 %	25 %	25 %	50 %	209546199
5015	NC_011366	CGA	2	6	227602	227607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546199
5016	NC_011366	TC	3	6	227647	227652	0 %	50 %	0 %	50 %	209546199
5017	NC_011366	ATC	2	6	227693	227698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546199
5018	NC_011366	TGC	2	6	227700	227705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546199
5019	NC_011366	CGC	2	6	227719	227724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546199
5020	NC_011366	TCG	2	6	227742	227747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546199
5021	NC_011366	CCG	2	6	227769	227774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546199
5022	NC_011366	GAT	2	6	227919	227924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546200
5023	NC_011366	CGC	2	6	228008	228013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546200
5024	NC_011366	GCC	2	6	228022	228027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546200
5025	NC_011366	GCG	2	6	228064	228069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546200
5026	NC_011366	GTT	2	6	228087	228092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546200
5027	NC_011366	TGT	2	6	228260	228265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	209546200
5028	NC_011366	CGC	2	6	228276	228281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546200
5029	NC_011366	CGC	2	6	228299	228304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546200
5030	NC_011366	TCT	2	6	228314	228319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546200
5031	NC_011366	GCC	2	6	228369	228374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546200
5032	NC_011366	CGG	2	6	228395	228400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546200
5033	NC_011366	GCC	2	6	228414	228419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546200
5034	NC_011366	GCT	2	6	228480	228485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546200
5035	NC_011366	ATCG	2	8	228492	228499	25 %	25 %	25 %	25 %	209546200
5036	NC_011366	TGCC	2	8	228568	228575	0 %	25 %	25 %	50 %	209546200
5037	NC_011366	GCA	2	6	228581	228586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546200
5038	NC_011366	TGA	2	6	228590	228595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546200
5039	NC_011366	CTGG	2	8	228618	228625	0 %	25 %	50 %	25 %	209546200
5040	NC_011366	CGC	2	6	228644	228649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546200
5041	NC_011366	GCC	2	6	228658	228663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546200
5042	NC_011366	GCC	2	6	228724	228729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546200
5043	NC_011366	GCCC	2	8	228734	228741	0 %	0 %	25 %	75 %	209546200
5044	NC_011366	ATC	2	6	228805	228810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546201
5045	NC_011366	TCG	2	6	228836	228841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546201
5046	NC_011366	CGA	2	6	228932	228937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546201
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5048	NC_011366	CGCC	2	8	229001	229008	0 %	0 %	25 %	75 %	209546201
5049	NC_011366	TCC	2	6	229057	229062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546201
5050	NC_011366	GAAG	2	8	229077	229084	50 %	0 %	50 %	0 %	209546201
5051	NC_011366	CGA	2	6	229091	229096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546201
5052	NC_011366	TCG	2	6	229169	229174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546201
5053	NC_011366	GGC	2	6	229179	229184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546201
5054	NC_011366	GCCATC	2	12	229375	229386	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	209546201
5055	NC_011366	GCG	2	6	229395	229400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546201
5056	NC_011366	CGC	2	6	229422	229427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546201
5057	NC_011366	TCG	2	6	229442	229447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546201
5058	NC_011366	TGA	2	6	229541	229546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546201
5059	NC_011366	GCG	2	6	229607	229612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546201
5060	NC_011366	CGCCA	2	10	229665	229674	20 %	0 %	20 %	60 %	209546201
5061	NC_011366	CTC	2	6	229707	229712	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	209546201
5062	NC_011366	CCG	2	6	229722	229727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546201
5063	NC_011366	TGC	2	6	229850	229855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546201
5064	NC_011366	CCG	2	6	229868	229873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546201
5065	NC_011366	TGCC	2	8	229883	229890	0 %	25 %	25 %	50 %	209546201
5066	NC_011366	CGC	2	6	229896	229901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546201
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5068	NC_011366	CG	3	6	229934	229939	0 %	0 %	50 %	50 %	209546201
5069	NC_011366	CGC	2	6	229958	229963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546201
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5080	NC_011366	GCCC	2	8	230346	230353	0 %	0 %	25 %	75 %	209546201
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5083	NC_011366	GAT	2	6	230549	230554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546202
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5090	NC_011366	CGAT	2	8	230770	230777	25 %	25 %	25 %	25 %	209546202
5091	NC_011366	CGCC	2	8	230785	230792	0 %	0 %	25 %	75 %	209546202
5092	NC_011366	GCC	2	6	230805	230810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546202
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5094	NC_011366	CGAG	2	8	230854	230861	25 %	0 %	50 %	25 %	209546202
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5098	NC_011366	AC	3	6	230953	230958	50 %	0 %	0 %	50 %	209546202
5099	NC_011366	ATA	2	6	230969	230974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	209546202
5100	NC_011366	CG	3	6	231019	231024	0 %	0 %	50 %	50 %	209546202
5101	NC_011366	GCAG	2	8	231067	231074	25 %	0 %	50 %	25 %	209546202
5102	NC_011366	AAG	3	9	231075	231083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546202
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5106	NC_011366	CGG	2	6	231206	231211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546202
5107	NC_011366	GCC	2	6	231249	231254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546202
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5109	NC_011366	AAG	2	6	231261	231266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546202
5110	NC_011366	CAG	2	6	231284	231289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546202
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5112	NC_011366	CAG	2	6	231341	231346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546202
5113	NC_011366	TCA	2	6	231349	231354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546202
5114	NC_011366	AAG	2	6	231372	231377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546202
5115	NC_011366	AGC	2	6	231384	231389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546202
5116	NC_011366	AGC	3	9	231393	231401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546202
5117	NC_011366	CTT	2	6	231444	231449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	209546202
5118	NC_011366	TGA	2	6	231515	231520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546203
5119	NC_011366	ATG	2	6	231535	231540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546203
5120	NC_011366	AGA	2	6	231572	231577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546203
5121	NC_011366	TGA	2	6	231617	231622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546203
5122	NC_011366	GATC	2	8	231633	231640	25 %	25 %	25 %	25 %	209546203
5123	NC_011366	GCC	2	6	231645	231650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546203
5124	NC_011366	GAC	2	6	231651	231656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546203
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5126	NC_011366	GAC	2	6	231669	231674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546203
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5146	NC_011366	GC	3	6	232223	232228	0 %	0 %	50 %	50 %	209546203
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5235	NC_011366	CAG	2	6	235644	235649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546207
5236	NC_011366	TGTCGC	2	12	235654	235665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546207
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5239	NC_011366	CGA	2	6	235694	235699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546207
5240	NC_011366	TCA	2	6	235789	235794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546207
5241	NC_011366	GAT	2	6	235803	235808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546207
5242	NC_011366	CGGCCT	2	12	235949	235960	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	209546207
5243	NC_011366	TGC	2	6	236011	236016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546207
5244	NC_011366	ACT	2	6	236041	236046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546207
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5360	NC_011366	CGGCG	2	10	242159	242168	0 %	0 %	60 %	40 %	209546214
5361	NC_011366	CGA	2	6	242186	242191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546214
5362	NC_011366	CGATG	2	10	242210	242219	20 %	20 %	40 %	20 %	209546214
5363	NC_011366	ATCC	2	8	242262	242269	25 %	25 %	0 %	50 %	209546214
5364	NC_011366	GCT	2	6	242294	242299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546214
5365	NC_011366	TGACC	2	10	242325	242334	20 %	20 %	20 %	40 %	209546214
5366	NC_011366	CTG	2	6	242373	242378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546215
5367	NC_011366	CTG	2	6	242394	242399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546215
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5370	NC_011366	TCGC	2	8	242493	242500	0 %	25 %	25 %	50 %	209546215
5371	NC_011366	CCG	2	6	242576	242581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	209546215
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5373	NC_011366	TCG	2	6	242665	242670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546215
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5388	NC_011366	CGA	2	6	243395	243400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546216
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5393	NC_011366	CGG	2	6	243630	243635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546216
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5401	NC_011366	GCG	2	6	244551	244556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546217
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5472	NC_011366	GCT	2	6	247539	247544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546220
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5478	NC_011366	CGG	2	6	247746	247751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546220
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5480	NC_011366	GAT	2	6	247821	247826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	209546220
5481	NC_011366	AGA	2	6	247853	247858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	209546220
5482	NC_011366	CGA	2	6	247925	247930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	209546220
5483	NC_011366	CGG	2	6	247953	247958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	209546220
5484	NC_011366	ATC	2	6	247969	247974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	209546220
5485	NC_011366	TCG	2	6	247979	247984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	209546220
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