MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_011004	CGA	2	6	1275561	1275566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289614
29003	NC_011004	TGCGG	2	10	1275567	1275576	0 %	20 %	60 %	20 %	192289614
29004	NC_011004	TCG	2	6	1275581	1275586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289614
29005	NC_011004	GCG	2	6	1275587	1275592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289614
29006	NC_011004	CGGC	2	8	1275659	1275666	0 %	0 %	50 %	50 %	192289614
29007	NC_011004	CGT	2	6	1275695	1275700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289614
29008	NC_011004	GGC	3	9	1275712	1275720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289614
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29010	NC_011004	TGC	2	6	1275740	1275745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289614
29011	NC_011004	GCT	2	6	1275750	1275755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289614
29012	NC_011004	GCTGGT	2	12	1275762	1275773	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	192289614
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29054	NC_011004	CGA	3	9	1277696	1277704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289616
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29114	NC_011004	ATC	2	6	1280531	1280536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289621
29115	NC_011004	TCGG	2	8	1280561	1280568	0 %	25 %	50 %	25 %	192289621
29116	NC_011004	GCA	2	6	1280611	1280616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289621
29117	NC_011004	GCT	2	6	1280623	1280628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289621
29118	NC_011004	CGC	2	6	1280630	1280635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289621
29119	NC_011004	CGGCG	2	10	1280649	1280658	0 %	0 %	60 %	40 %	192289621
29120	NC_011004	TCT	2	6	1280673	1280678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289621
29121	NC_011004	GC	3	6	1280699	1280704	0 %	0 %	50 %	50 %	192289621
29122	NC_011004	GAC	2	6	1280713	1280718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289621
29123	NC_011004	ATGCGA	2	12	1280787	1280798	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	192289622
29124	NC_011004	GCG	2	6	1280809	1280814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289622
29125	NC_011004	CGC	2	6	1280819	1280824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289622
29126	NC_011004	GCT	2	6	1280828	1280833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289622
29127	NC_011004	GGC	2	6	1280843	1280848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289622
29128	NC_011004	CGA	2	6	1280891	1280896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289622
29129	NC_011004	GTG	2	6	1280931	1280936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289622
29130	NC_011004	GC	5	10	1280940	1280949	0 %	0 %	50 %	50 %	192289622
29131	NC_011004	CGG	2	6	1280954	1280959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289622
29132	NC_011004	GGT	2	6	1280963	1280968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289622
29133	NC_011004	CGA	2	6	1281029	1281034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289622
29134	NC_011004	CTCG	2	8	1281056	1281063	0 %	25 %	25 %	50 %	192289622
29135	NC_011004	GC	3	6	1281209	1281214	0 %	0 %	50 %	50 %	192289622
29136	NC_011004	GTG	2	6	1281234	1281239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289622
29137	NC_011004	CAG	3	9	1281240	1281248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289622
29138	NC_011004	AAGG	2	8	1281252	1281259	50 %	0 %	50 %	0 %	192289622
29139	NC_011004	GAC	2	6	1281276	1281281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289622
29140	NC_011004	GAA	2	6	1281293	1281298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289622
29141	NC_011004	GAT	2	6	1281299	1281304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289622
29142	NC_011004	GGTCG	2	10	1281308	1281317	0 %	20 %	60 %	20 %	192289622
29143	NC_011004	GTG	2	6	1281318	1281323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289622
29144	NC_011004	CGATC	2	10	1281332	1281341	20 %	20 %	20 %	40 %	192289622
29145	NC_011004	GCA	3	9	1281353	1281361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289622
29146	NC_011004	GCTGCG	2	12	1281368	1281379	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192289622
29147	NC_011004	CGAT	2	8	1281472	1281479	25 %	25 %	25 %	25 %	192289622
29148	NC_011004	CGT	2	6	1281509	1281514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289622
29149	NC_011004	TCG	2	6	1281550	1281555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289622
29150	NC_011004	CGG	2	6	1281581	1281586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289622
29151	NC_011004	CGGTGC	2	12	1281679	1281690	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192289622
29152	NC_011004	GCC	2	6	1281798	1281803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289623
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29154	NC_011004	CGC	2	6	1281834	1281839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289623
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29158	NC_011004	GC	3	6	1281955	1281960	0 %	0 %	50 %	50 %	192289623
29159	NC_011004	GAC	2	6	1282049	1282054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289623
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29161	NC_011004	GCA	2	6	1282143	1282148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289623
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29163	NC_011004	CG	3	6	1282243	1282248	0 %	0 %	50 %	50 %	192289623
29164	NC_011004	TGA	2	6	1282299	1282304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289623
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29167	NC_011004	CGTT	2	8	1282439	1282446	0 %	50 %	25 %	25 %	192289623
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29169	NC_011004	CCG	2	6	1282491	1282496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289623
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29173	NC_011004	CGG	2	6	1282665	1282670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289623
29174	NC_011004	GC	3	6	1282690	1282695	0 %	0 %	50 %	50 %	192289623
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29179	NC_011004	GATCGC	2	12	1282876	1282887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192289623
29180	NC_011004	GGT	2	6	1282918	1282923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289623
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29182	NC_011004	CGA	2	6	1283029	1283034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289623
29183	NC_011004	GGAC	2	8	1283080	1283087	25 %	0 %	50 %	25 %	192289623
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29188	NC_011004	CCA	2	6	1283338	1283343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289623
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29192	NC_011004	GC	3	6	1283404	1283409	0 %	0 %	50 %	50 %	192289623
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29195	NC_011004	GCT	2	6	1283491	1283496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289623
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29199	NC_011004	TTCAAC	2	12	1283654	1283665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289623
29200	NC_011004	GCG	2	6	1283736	1283741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289623
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29208	NC_011004	GCCGCG	2	12	1283983	1283994	0 %	0 %	50 %	50 %	192289623
29209	NC_011004	TCGA	2	8	1284005	1284012	25 %	25 %	25 %	25 %	192289623
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29211	NC_011004	CGG	2	6	1284079	1284084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289623
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29213	NC_011004	CCA	2	6	1284255	1284260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289623
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29215	NC_011004	CCG	2	6	1284286	1284291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289623
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29217	NC_011004	ACCG	2	8	1284454	1284461	25 %	0 %	25 %	50 %	192289623
29218	NC_011004	GCG	2	6	1284515	1284520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289623
29219	NC_011004	TGG	3	9	1284552	1284560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289623
29220	NC_011004	CGCTGA	2	12	1284609	1284620	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192289623
29221	NC_011004	GAT	2	6	1284673	1284678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289623
29222	NC_011004	CAT	2	6	1284700	1284705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289623
29223	NC_011004	CTG	2	6	1284722	1284727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289623
29224	NC_011004	CGG	2	6	1284748	1284753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289623
29225	NC_011004	GCGGT	2	10	1284794	1284803	0 %	20 %	60 %	20 %	192289623
29226	NC_011004	GGC	2	6	1284829	1284834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289623
29227	NC_011004	GAT	2	6	1284835	1284840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289623
29228	NC_011004	GCT	2	6	1284892	1284897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289623
29229	NC_011004	GCT	2	6	1284919	1284924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289623
29230	NC_011004	TGC	2	6	1284957	1284962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289623
29231	NC_011004	CCG	2	6	1284971	1284976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289623
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29234	NC_011004	CGG	2	6	1285093	1285098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289624
29235	NC_011004	TGG	2	6	1285120	1285125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289624
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29237	NC_011004	TCG	2	6	1285243	1285248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289624
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29252	NC_011004	TGA	2	6	1285961	1285966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289625
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29257	NC_011004	GC	3	6	1286164	1286169	0 %	0 %	50 %	50 %	192289625
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29331	NC_011004	GC	3	6	1288549	1288554	0 %	0 %	50 %	50 %	192289628
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29343	NC_011004	CGG	2	6	1288948	1288953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289628
29344	NC_011004	CGG	2	6	1288981	1288986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289628
29345	NC_011004	CGA	2	6	1289016	1289021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289628
29346	NC_011004	CGCGA	2	10	1289079	1289088	20 %	0 %	40 %	40 %	192289628
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29348	NC_011004	CGA	2	6	1289512	1289517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289629
29349	NC_011004	CCG	2	6	1289518	1289523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289629
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29357	NC_011004	GCG	2	6	1289655	1289660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289629
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29359	NC_011004	GAC	2	6	1289677	1289682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289629
29360	NC_011004	GCA	2	6	1289683	1289688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289629
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29372	NC_011004	GGC	2	6	1290082	1290087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289629
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29459	NC_011004	GGC	2	6	1293530	1293535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289633
29460	NC_011004	GTCAGC	2	12	1293549	1293560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192289633
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