MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_011004	AGC	2	6	1254143	1254148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289592
28503	NC_011004	GC	3	6	1254147	1254152	0 %	0 %	50 %	50 %	192289592
28504	NC_011004	CGC	3	9	1254150	1254158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289592
28505	NC_011004	CAC	2	6	1254169	1254174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289592
28506	NC_011004	CTC	2	6	1254229	1254234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289592
28507	NC_011004	CGG	2	6	1254252	1254257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289592
28508	NC_011004	GAT	2	6	1254303	1254308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289592
28509	NC_011004	TTC	2	6	1254313	1254318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289592
28510	NC_011004	CTT	2	6	1254346	1254351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289592
28511	NC_011004	GCA	2	6	1254381	1254386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289592
28512	NC_011004	TCG	2	6	1254431	1254436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289592
28513	NC_011004	CGCC	2	8	1254546	1254553	0 %	0 %	25 %	75 %	192289592
28514	NC_011004	GAA	2	6	1254583	1254588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289592
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28516	NC_011004	GTCG	2	8	1254655	1254662	0 %	25 %	50 %	25 %	192289592
28517	NC_011004	CCG	2	6	1254663	1254668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289592
28518	NC_011004	CGGT	2	8	1254674	1254681	0 %	25 %	50 %	25 %	192289592
28519	NC_011004	GTGG	2	8	1254688	1254695	0 %	25 %	75 %	0 %	192289592
28520	NC_011004	CGA	2	6	1254696	1254701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289592
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28522	NC_011004	GCGG	2	8	1254755	1254762	0 %	0 %	75 %	25 %	192289592
28523	NC_011004	GTC	2	6	1254859	1254864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289592
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28535	NC_011004	GCT	2	6	1255210	1255215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289592
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28543	NC_011004	GAT	2	6	1255474	1255479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289592
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28546	NC_011004	GCCG	2	8	1255619	1255626	0 %	0 %	50 %	50 %	192289592
28547	NC_011004	GGA	2	6	1255636	1255641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289592
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28552	NC_011004	CAA	3	9	1256153	1256161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289593
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28617	NC_011004	GAT	2	6	1259517	1259522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289597
28618	NC_011004	CG	3	6	1259574	1259579	0 %	0 %	50 %	50 %	192289597
28619	NC_011004	CGC	2	6	1259586	1259591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289597
28620	NC_011004	GAT	2	6	1259607	1259612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289597
28621	NC_011004	GCT	2	6	1259630	1259635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289597
28622	NC_011004	CCG	2	6	1259668	1259673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289597
28623	NC_011004	GAA	2	6	1259706	1259711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289597
28624	NC_011004	GGCGCC	2	12	1259817	1259828	0 %	0 %	50 %	50 %	192289597
28625	NC_011004	CGA	2	6	1259840	1259845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289597
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28628	NC_011004	TGA	2	6	1259897	1259902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289597
28629	NC_011004	GTC	2	6	1259907	1259912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289597
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28639	NC_011004	TCT	2	6	1260242	1260247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289597
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28643	NC_011004	CGA	2	6	1260824	1260829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289598
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28684	NC_011004	CG	3	6	1262520	1262525	0 %	0 %	50 %	50 %	192289600
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28694	NC_011004	CTG	3	9	1263233	1263241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289601
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28719	NC_011004	GCA	2	6	1263978	1263983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289603
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28722	NC_011004	CGA	2	6	1264062	1264067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289603
28723	NC_011004	CAC	2	6	1264132	1264137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289603
28724	NC_011004	CG	4	8	1264159	1264166	0 %	0 %	50 %	50 %	192289603
28725	NC_011004	GGCCA	2	10	1264186	1264195	20 %	0 %	40 %	40 %	192289603
28726	NC_011004	TCGCC	2	10	1264251	1264260	0 %	20 %	20 %	60 %	192289603
28727	NC_011004	TCA	2	6	1264263	1264268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289603
28728	NC_011004	CGG	2	6	1264299	1264304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289603
28729	NC_011004	GCC	2	6	1264330	1264335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289603
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28731	NC_011004	CGT	3	9	1264392	1264400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289603
28732	NC_011004	GAT	2	6	1264411	1264416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289603
28733	NC_011004	GCT	2	6	1264441	1264446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289603
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28961	NC_011004	GC	4	8	1273715	1273722	0 %	0 %	50 %	50 %	192289612
28962	NC_011004	GTGA	2	8	1273745	1273752	25 %	25 %	50 %	0 %	192289612
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28964	NC_011004	CGC	2	6	1273777	1273782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289612
28965	NC_011004	CG	3	6	1273808	1273813	0 %	0 %	50 %	50 %	192289612
28966	NC_011004	TCGA	2	8	1273821	1273828	25 %	25 %	25 %	25 %	192289612
28967	NC_011004	TGC	2	6	1273938	1273943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289612
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28969	NC_011004	TGC	2	6	1274074	1274079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289612
28970	NC_011004	CG	3	6	1274091	1274096	0 %	0 %	50 %	50 %	192289612
28971	NC_011004	CGT	2	6	1274098	1274103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289612
28972	NC_011004	GC	3	6	1274153	1274158	0 %	0 %	50 %	50 %	192289612
28973	NC_011004	GAGGCG	2	12	1274166	1274177	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	192289612
28974	NC_011004	CGT	2	6	1274194	1274199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289612
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28977	NC_011004	CG	3	6	1274655	1274660	0 %	0 %	50 %	50 %	192289613
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28988	NC_011004	CCGA	2	8	1274972	1274979	25 %	0 %	25 %	50 %	192289613
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28991	NC_011004	CGTT	2	8	1275265	1275272	0 %	50 %	25 %	25 %	192289614
28992	NC_011004	ATC	2	6	1275277	1275282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289614
28993	NC_011004	GGC	2	6	1275343	1275348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289614
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