MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28002	NC_011004	GTC	2	6	1235249	1235254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289577
28003	NC_011004	GC	3	6	1235353	1235358	0 %	0 %	50 %	50 %	192289577
28004	NC_011004	GTC	2	6	1235365	1235370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289577
28005	NC_011004	TGC	2	6	1235454	1235459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289577
28006	NC_011004	CGC	2	6	1235466	1235471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289577
28007	NC_011004	CAT	2	6	1235474	1235479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289577
28008	NC_011004	GCC	2	6	1235492	1235497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289577
28009	NC_011004	GC	3	6	1235502	1235507	0 %	0 %	50 %	50 %	192289577
28010	NC_011004	GC	4	8	1235527	1235534	0 %	0 %	50 %	50 %	192289577
28011	NC_011004	CCA	2	6	1235556	1235561	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289577
28012	NC_011004	CGG	2	6	1235572	1235577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289577
28013	NC_011004	CGATC	2	10	1235578	1235587	20 %	20 %	20 %	40 %	192289577
28014	NC_011004	GCG	2	6	1235605	1235610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289577
28015	NC_011004	CTGAT	2	10	1235625	1235634	20 %	40 %	20 %	20 %	192289577
28016	NC_011004	GTG	2	6	1235657	1235662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289577
28017	NC_011004	CGA	2	6	1235668	1235673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289577
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28019	NC_011004	TCAT	2	8	1235705	1235712	25 %	50 %	0 %	25 %	192289577
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28116	NC_011004	TGG	2	6	1238856	1238861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289580
28117	NC_011004	CGG	2	6	1238905	1238910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289580
28118	NC_011004	CGC	2	6	1238914	1238919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289580
28119	NC_011004	GCA	2	6	1238938	1238943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289580
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28123	NC_011004	GCT	2	6	1239091	1239096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289580
28124	NC_011004	CGC	2	6	1239097	1239102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289580
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28228	NC_011004	GC	3	6	1243264	1243269	0 %	0 %	50 %	50 %	192289583
28229	NC_011004	CCG	2	6	1243310	1243315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289583
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28348	NC_011004	GGCC	2	8	1248079	1248086	0 %	0 %	50 %	50 %	192289586
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28454	NC_011004	GC	3	6	1252524	1252529	0 %	0 %	50 %	50 %	192289590
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28463	NC_011004	CG	3	6	1252829	1252834	0 %	0 %	50 %	50 %	192289591
28464	NC_011004	GCC	2	6	1252836	1252841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289591
28465	NC_011004	CG	3	6	1252867	1252872	0 %	0 %	50 %	50 %	192289591
28466	NC_011004	TCGC	2	8	1252880	1252887	0 %	25 %	25 %	50 %	192289591
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28468	NC_011004	CGG	2	6	1253009	1253014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289591
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28481	NC_011004	GCT	2	6	1253294	1253299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289591
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28490	NC_011004	GCT	2	6	1253707	1253712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289592
28491	NC_011004	CGA	2	6	1253796	1253801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289592
28492	NC_011004	CGC	2	6	1253802	1253807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289592
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28494	NC_011004	TGC	2	6	1253853	1253858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289592
28495	NC_011004	AGC	2	6	1253864	1253869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289592
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28497	NC_011004	CGT	2	6	1253946	1253951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289592
28498	NC_011004	CACC	2	8	1253952	1253959	25 %	0 %	0 %	75 %	192289592
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28500	NC_011004	CGC	2	6	1254010	1254015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289592

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