MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27502	NC_011004	GCC	2	6	1212466	1212471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289554
27503	NC_011004	GCCG	2	8	1212475	1212482	0 %	0 %	50 %	50 %	192289554
27504	NC_011004	ACGA	2	8	1212490	1212497	50 %	0 %	25 %	25 %	192289554
27505	NC_011004	GCA	2	6	1212516	1212521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289554
27506	NC_011004	CGA	2	6	1212594	1212599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289554
27507	NC_011004	GCC	2	6	1212625	1212630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289554
27508	NC_011004	GAA	2	6	1212705	1212710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289554
27509	NC_011004	CA	3	6	1212863	1212868	50 %	0 %	0 %	50 %	192289554
27510	NC_011004	GC	3	6	1213052	1213057	0 %	0 %	50 %	50 %	192289554
27511	NC_011004	TGC	2	6	1213082	1213087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289554
27512	NC_011004	CTG	2	6	1213113	1213118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289554
27513	NC_011004	GAT	2	6	1213122	1213127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289554
27514	NC_011004	GAA	2	6	1213129	1213134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289554
27515	NC_011004	GC	3	6	1213138	1213143	0 %	0 %	50 %	50 %	192289554
27516	NC_011004	CCA	2	6	1213186	1213191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289555
27517	NC_011004	GTC	2	6	1213193	1213198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289555
27518	NC_011004	GCC	2	6	1213293	1213298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289555
27519	NC_011004	GCA	2	6	1213318	1213323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289555
27520	NC_011004	GC	3	6	1213343	1213348	0 %	0 %	50 %	50 %	192289555
27521	NC_011004	TCGA	2	8	1213371	1213378	25 %	25 %	25 %	25 %	192289555
27522	NC_011004	CTC	2	6	1213412	1213417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289555
27523	NC_011004	GCA	2	6	1213480	1213485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289555
27524	NC_011004	GCC	2	6	1213486	1213491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289555
27525	NC_011004	GCCA	2	8	1213554	1213561	25 %	0 %	25 %	50 %	192289555
27526	NC_011004	CGA	2	6	1213588	1213593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289555
27527	NC_011004	GAT	2	6	1213601	1213606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289555
27528	NC_011004	CTC	2	6	1213607	1213612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289555
27529	NC_011004	CGC	3	9	1213623	1213631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289555
27530	NC_011004	CTT	2	6	1213637	1213642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289555
27531	NC_011004	CTTCTG	2	12	1213649	1213660	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	192289555
27532	NC_011004	CCG	2	6	1214460	1214465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289556
27533	NC_011004	CGC	2	6	1214544	1214549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289556
27534	NC_011004	ACA	2	6	1214555	1214560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289556
27535	NC_011004	TCT	2	6	1214583	1214588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289556
27536	NC_011004	CG	3	6	1214628	1214633	0 %	0 %	50 %	50 %	192289556
27537	NC_011004	TCAG	2	8	1214666	1214673	25 %	25 %	25 %	25 %	192289556
27538	NC_011004	CA	3	6	1214709	1214714	50 %	0 %	0 %	50 %	192289556
27539	NC_011004	CGCC	2	8	1214777	1214784	0 %	0 %	25 %	75 %	192289556
27540	NC_011004	CGA	2	6	1214835	1214840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289556
27541	NC_011004	GCA	2	6	1214855	1214860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289556
27542	NC_011004	CAC	2	6	1214923	1214928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289556
27543	NC_011004	AGGC	2	8	1214948	1214955	25 %	0 %	50 %	25 %	192289556
27544	NC_011004	ATC	2	6	1215047	1215052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289556
27545	NC_011004	GC	3	6	1215391	1215396	0 %	0 %	50 %	50 %	192289557
27546	NC_011004	ATCCCC	2	12	1215398	1215409	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	192289557
27547	NC_011004	GGC	2	6	1215435	1215440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289557
27548	NC_011004	GC	3	6	1215456	1215461	0 %	0 %	50 %	50 %	192289557
27549	NC_011004	CG	3	6	1215516	1215521	0 %	0 %	50 %	50 %	192289557
27550	NC_011004	CAC	2	6	1215528	1215533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289557
27551	NC_011004	TCA	2	6	1215536	1215541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289557
27552	NC_011004	TTC	2	6	1215737	1215742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289558
27553	NC_011004	CGG	2	6	1215796	1215801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289558
27554	NC_011004	CGA	2	6	1215826	1215831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289558
27555	NC_011004	GCA	2	6	1215863	1215868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289558
27556	NC_011004	TCG	2	6	1215882	1215887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289558
27557	NC_011004	GCC	2	6	1215966	1215971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289558
27558	NC_011004	GGC	2	6	1216043	1216048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289558
27559	NC_011004	CGC	2	6	1216096	1216101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289558
27560	NC_011004	GCT	2	6	1216147	1216152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289558
27561	NC_011004	GGC	2	6	1216167	1216172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289558
27562	NC_011004	GC	4	8	1216171	1216178	0 %	0 %	50 %	50 %	192289558
27563	NC_011004	TGT	2	6	1216212	1216217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289558
27564	NC_011004	GCCA	2	8	1216253	1216260	25 %	0 %	25 %	50 %	192289558
27565	NC_011004	CCG	2	6	1216266	1216271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289558
27566	NC_011004	CGA	2	6	1216324	1216329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289558
27567	NC_011004	CGC	2	6	1216357	1216362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289558
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27569	NC_011004	CGC	2	6	1216505	1216510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289558
27570	NC_011004	TCCG	2	8	1216591	1216598	0 %	25 %	25 %	50 %	192289558
27571	NC_011004	CGC	2	6	1216606	1216611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289558
27572	NC_011004	GAT	2	6	1216675	1216680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289558
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27575	NC_011004	AACC	2	8	1216809	1216816	50 %	0 %	0 %	50 %	192289559
27576	NC_011004	ACG	3	9	1216831	1216839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289559
27577	NC_011004	CGA	2	6	1216848	1216853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289559
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27583	NC_011004	CGC	2	6	1217189	1217194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289559
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27589	NC_011004	GC	3	6	1217466	1217471	0 %	0 %	50 %	50 %	192289560
27590	NC_011004	AAT	2	6	1217531	1217536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192289560
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27599	NC_011004	GCCGA	2	10	1217699	1217708	20 %	0 %	40 %	40 %	192289561
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27602	NC_011004	TGCG	2	8	1217881	1217888	0 %	25 %	50 %	25 %	192289561
27603	NC_011004	CGTCG	2	10	1217938	1217947	0 %	20 %	40 %	40 %	192289561
27604	NC_011004	TC	3	6	1217953	1217958	0 %	50 %	0 %	50 %	192289561
27605	NC_011004	GAA	2	6	1218172	1218177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289561
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27613	NC_011004	GGC	2	6	1218511	1218516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289561
27614	NC_011004	GCA	2	6	1218577	1218582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289561
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27616	NC_011004	CCAT	2	8	1218642	1218649	25 %	25 %	0 %	50 %	192289561
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27848	NC_011004	TCG	2	6	1230271	1230276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289570
27849	NC_011004	GGC	2	6	1230314	1230319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289570
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27852	NC_011004	CGC	2	6	1230386	1230391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289570
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