MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_011004	GCT	2	6	1190511	1190516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289536
27003	NC_011004	CGA	2	6	1190567	1190572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289536
27004	NC_011004	GCC	2	6	1190578	1190583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289536
27005	NC_011004	CAA	2	6	1190601	1190606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289536
27006	NC_011004	GCG	2	6	1190617	1190622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289536
27007	NC_011004	GAA	2	6	1190634	1190639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289536
27008	NC_011004	CGA	2	6	1190697	1190702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289536
27009	NC_011004	CGC	2	6	1190715	1190720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289536
27010	NC_011004	GCG	2	6	1190746	1190751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289536
27011	NC_011004	AAG	3	9	1190762	1190770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289536
27012	NC_011004	CCG	2	6	1190859	1190864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289536
27013	NC_011004	GCC	2	6	1191043	1191048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289536
27014	NC_011004	GCG	2	6	1191127	1191132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289536
27015	NC_011004	GAG	2	6	1191166	1191171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289536
27016	NC_011004	CGA	2	6	1191246	1191251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289536
27017	NC_011004	CGA	2	6	1191261	1191266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289536
27018	NC_011004	CT	3	6	1191268	1191273	0 %	50 %	0 %	50 %	192289536
27019	NC_011004	AAC	2	6	1191307	1191312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289536
27020	NC_011004	GCC	2	6	1191356	1191361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289536
27021	NC_011004	GCC	2	6	1191364	1191369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289536
27022	NC_011004	GTCG	2	8	1191420	1191427	0 %	25 %	50 %	25 %	192289536
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27028	NC_011004	AAG	2	6	1191523	1191528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289536
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27030	NC_011004	CGG	2	6	1191602	1191607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289537
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27032	NC_011004	AGG	2	6	1191615	1191620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289537
27033	NC_011004	GGTCG	2	10	1191665	1191674	0 %	20 %	60 %	20 %	192289537
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27036	NC_011004	CTG	2	6	1191713	1191718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289537
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27043	NC_011004	CG	3	6	1191852	1191857	0 %	0 %	50 %	50 %	192289537
27044	NC_011004	CGA	2	6	1191982	1191987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289537
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27052	NC_011004	GAA	2	6	1192574	1192579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289537
27053	NC_011004	GATA	2	8	1192627	1192634	50 %	25 %	25 %	0 %	192289537
27054	NC_011004	GGC	2	6	1192717	1192722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289537
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27056	NC_011004	GCCG	2	8	1192813	1192820	0 %	0 %	50 %	50 %	192289537
27057	NC_011004	TCG	2	6	1192845	1192850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289537
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27066	NC_011004	C	6	6	1193313	1193318	0 %	0 %	0 %	100 %	192289537
27067	NC_011004	GCA	2	6	1193371	1193376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289537
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27089	NC_011004	ATCTC	2	10	1194539	1194548	20 %	40 %	0 %	40 %	192289537
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27106	NC_011004	CGGC	2	8	1195698	1195705	0 %	0 %	50 %	50 %	192289538
27107	NC_011004	TCCT	2	8	1195735	1195742	0 %	50 %	0 %	50 %	192289538
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27114	NC_011004	GGT	2	6	1196005	1196010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289538
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27116	NC_011004	CGC	2	6	1196145	1196150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289538
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27232	NC_011004	GCG	2	6	1200887	1200892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289540
27233	NC_011004	CA	3	6	1200921	1200926	50 %	0 %	0 %	50 %	192289540
27234	NC_011004	GCG	2	6	1201030	1201035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289540
27235	NC_011004	AAG	2	6	1201038	1201043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289540
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27243	NC_011004	CGT	2	6	1201444	1201449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289541
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27247	NC_011004	TCGGT	2	10	1201642	1201651	0 %	40 %	40 %	20 %	192289541
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27251	NC_011004	GCA	2	6	1201729	1201734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289541
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27452	NC_011004	TGA	2	6	1210208	1210213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289552
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27456	NC_011004	CGCC	2	8	1210415	1210422	0 %	0 %	25 %	75 %	192289552
27457	NC_011004	GAA	2	6	1210425	1210430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289552
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27463	NC_011004	CTC	2	6	1210573	1210578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289552
27464	NC_011004	CCG	2	6	1210592	1210597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289552
27465	NC_011004	TCC	2	6	1210619	1210624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289552
27466	NC_011004	CGA	2	6	1210638	1210643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289552
27467	NC_011004	GAG	2	6	1210648	1210653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289552
27468	NC_011004	TC	3	6	1210686	1210691	0 %	50 %	0 %	50 %	192289552
27469	NC_011004	GCC	2	6	1210705	1210710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289552
27470	NC_011004	GTC	2	6	1210720	1210725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289552
27471	NC_011004	TGCG	2	8	1210746	1210753	0 %	25 %	50 %	25 %	192289552
27472	NC_011004	CGT	2	6	1210759	1210764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289552
27473	NC_011004	CGA	2	6	1210773	1210778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289552
27474	NC_011004	GAC	2	6	1210779	1210784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289552
27475	NC_011004	GTCGAG	2	12	1210876	1210887	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192289552
27476	NC_011004	ACG	2	6	1210898	1210903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289552
27477	NC_011004	CA	3	6	1210921	1210926	50 %	0 %	0 %	50 %	192289552
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27479	NC_011004	AAGGCG	2	12	1211026	1211037	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	192289552
27480	NC_011004	CGG	3	9	1211111	1211119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289552
27481	NC_011004	CG	3	6	1211153	1211158	0 %	0 %	50 %	50 %	192289552
27482	NC_011004	CGA	2	6	1211163	1211168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289552
27483	NC_011004	CGC	2	6	1211190	1211195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289552
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27485	NC_011004	CGA	2	6	1211253	1211258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289552
27486	NC_011004	TGGG	2	8	1211346	1211353	0 %	25 %	75 %	0 %	192289552
27487	NC_011004	GTC	2	6	1211391	1211396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289552
27488	NC_011004	GCG	2	6	1211411	1211416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289552
27489	NC_011004	CT	3	6	1211453	1211458	0 %	50 %	0 %	50 %	192289552
27490	NC_011004	CGA	3	9	1211463	1211471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289552
27491	NC_011004	ATG	2	6	1211512	1211517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289552
27492	NC_011004	GCC	2	6	1211824	1211829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289553
27493	NC_011004	CCG	2	6	1211832	1211837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289553
27494	NC_011004	CGG	2	6	1211844	1211849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289553
27495	NC_011004	ATCC	2	8	1211939	1211946	25 %	25 %	0 %	50 %	192289553
27496	NC_011004	GGAC	2	8	1211947	1211954	25 %	0 %	50 %	25 %	192289553
27497	NC_011004	CCGC	2	8	1212018	1212025	0 %	0 %	25 %	75 %	192289553
27498	NC_011004	CATC	2	8	1212073	1212080	25 %	25 %	0 %	50 %	192289553
27499	NC_011004	TGA	3	9	1212222	1212230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289553
27500	NC_011004	GCC	3	9	1212314	1212322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289553

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