MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26501	NC_011004	ATGG	2	8	1158079	1158086	25 %	25 %	50 %	0 %	192289509
26502	NC_011004	ACC	2	6	1158173	1158178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289509
26503	NC_011004	GAT	2	6	1158213	1158218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289509
26504	NC_011004	CTTCGT	2	12	1158273	1158284	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	192289509
26505	NC_011004	GTGCGC	2	12	1158418	1158429	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192289509
26506	NC_011004	GGGT	2	8	1158505	1158512	0 %	25 %	75 %	0 %	192289509
26507	NC_011004	GC	3	6	1158521	1158526	0 %	0 %	50 %	50 %	192289509
26508	NC_011004	GTC	2	6	1158580	1158585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289509
26509	NC_011004	CAC	2	6	1158628	1158633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289509
26510	NC_011004	GAA	2	6	1158681	1158686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289509
26511	NC_011004	CGATGG	2	12	1158725	1158736	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192289509
26512	NC_011004	GAGATG	2	12	1158760	1158771	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	192289509
26513	NC_011004	ACA	2	6	1158782	1158787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289509
26514	NC_011004	ATG	2	6	1158796	1158801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289509
26515	NC_011004	GC	3	6	1158874	1158879	0 %	0 %	50 %	50 %	192289509
26516	NC_011004	GAC	2	6	1158880	1158885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289509
26517	NC_011004	GAAAA	2	10	1159000	1159009	80 %	0 %	20 %	0 %	192289509
26518	NC_011004	TGTCGA	2	12	1159093	1159104	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192289510
26519	NC_011004	CGG	2	6	1159105	1159110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289510
26520	NC_011004	TCA	2	6	1159127	1159132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289510
26521	NC_011004	ACG	2	6	1159135	1159140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289510
26522	NC_011004	TCA	3	9	1159142	1159150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289510
26523	NC_011004	GAT	2	6	1159152	1159157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289510
26524	NC_011004	GGCC	2	8	1159195	1159202	0 %	0 %	50 %	50 %	192289510
26525	NC_011004	GAA	2	6	1159271	1159276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289510
26526	NC_011004	CAAGT	2	10	1159284	1159293	40 %	20 %	20 %	20 %	192289510
26527	NC_011004	AAC	2	6	1159305	1159310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289510
26528	NC_011004	CGA	2	6	1159339	1159344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289510
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26530	NC_011004	GCCT	2	8	1159485	1159492	0 %	25 %	25 %	50 %	192289510
26531	NC_011004	TGG	2	6	1159519	1159524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289510
26532	NC_011004	GTC	2	6	1159530	1159535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289510
26533	NC_011004	GAT	2	6	1159573	1159578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289511
26534	NC_011004	GC	3	6	1159591	1159596	0 %	0 %	50 %	50 %	192289511
26535	NC_011004	CTA	2	6	1159601	1159606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289511
26536	NC_011004	ATC	2	6	1159613	1159618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289511
26537	NC_011004	TCG	2	6	1159656	1159661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289511
26538	NC_011004	CGA	2	6	1159681	1159686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289511
26539	NC_011004	CGGC	2	8	1159689	1159696	0 %	0 %	50 %	50 %	192289511
26540	NC_011004	GGC	2	6	1159841	1159846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289511
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26542	NC_011004	CG	3	6	1160020	1160025	0 %	0 %	50 %	50 %	192289512
26543	NC_011004	GCGG	2	8	1160028	1160035	0 %	0 %	75 %	25 %	192289512
26544	NC_011004	TGG	2	6	1160039	1160044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289512
26545	NC_011004	CGTT	2	8	1160120	1160127	0 %	50 %	25 %	25 %	192289512
26546	NC_011004	GCC	2	6	1160149	1160154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289512
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26548	NC_011004	TCG	2	6	1160285	1160290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289512
26549	NC_011004	ACTGG	2	10	1160307	1160316	20 %	20 %	40 %	20 %	192289512
26550	NC_011004	GCG	2	6	1160317	1160322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289512
26551	NC_011004	CG	4	8	1160467	1160474	0 %	0 %	50 %	50 %	192289512
26552	NC_011004	GGA	2	6	1160520	1160525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289512
26553	NC_011004	CTT	2	6	1160529	1160534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289512
26554	NC_011004	GCG	2	6	1160546	1160551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289512
26555	NC_011004	GAC	2	6	1160618	1160623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289512
26556	NC_011004	GT	4	8	1160894	1160901	0 %	50 %	50 %	0 %	192289513
26557	NC_011004	AGA	2	6	1161210	1161215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289513
26558	NC_011004	CG	3	6	1161218	1161223	0 %	0 %	50 %	50 %	192289513
26559	NC_011004	CGC	2	6	1161393	1161398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289513
26560	NC_011004	TCTG	2	8	1161420	1161427	0 %	50 %	25 %	25 %	192289513
26561	NC_011004	GCAAG	2	10	1161430	1161439	40 %	0 %	40 %	20 %	192289513
26562	NC_011004	CGA	3	9	1161442	1161450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289513
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26603	NC_011004	CCGA	2	8	1165535	1165542	25 %	0 %	25 %	50 %	192289517
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26964	NC_011004	TCG	2	6	1189160	1189165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289536
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