MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_011004	ACG	2	6	1123855	1123860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289480
26003	NC_011004	GC	3	6	1123896	1123901	0 %	0 %	50 %	50 %	192289480
26004	NC_011004	CAGC	2	8	1123923	1123930	25 %	0 %	25 %	50 %	192289480
26005	NC_011004	CGCC	2	8	1123939	1123946	0 %	0 %	25 %	75 %	192289480
26006	NC_011004	GTCG	2	8	1124053	1124060	0 %	25 %	50 %	25 %	192289481
26007	NC_011004	TCCG	2	8	1124124	1124131	0 %	25 %	25 %	50 %	192289481
26008	NC_011004	AGCG	2	8	1124155	1124162	25 %	0 %	50 %	25 %	192289481
26009	NC_011004	CG	3	6	1124209	1124214	0 %	0 %	50 %	50 %	192289481
26010	NC_011004	CGC	2	6	1124236	1124241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289481
26011	NC_011004	GCA	2	6	1124270	1124275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289481
26012	NC_011004	TTC	2	6	1124295	1124300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289481
26013	NC_011004	ACG	2	6	1124307	1124312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289481
26014	NC_011004	GC	3	6	1124382	1124387	0 %	0 %	50 %	50 %	192289481
26015	NC_011004	ACG	2	6	1124388	1124393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289481
26016	NC_011004	CGA	3	9	1124410	1124418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289481
26017	NC_011004	GCG	2	6	1124425	1124430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289481
26018	NC_011004	CCG	2	6	1124472	1124477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289482
26019	NC_011004	CT	3	6	1124525	1124530	0 %	50 %	0 %	50 %	192289482
26020	NC_011004	GGCT	2	8	1124639	1124646	0 %	25 %	50 %	25 %	192289482
26021	NC_011004	GCG	2	6	1124662	1124667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289482
26022	NC_011004	GAC	2	6	1124677	1124682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289482
26023	NC_011004	GAT	2	6	1124725	1124730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289482
26024	NC_011004	AGCG	3	12	1124748	1124759	25 %	0 %	50 %	25 %	192289482
26025	NC_011004	TTC	2	6	1124791	1124796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289482
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26029	NC_011004	AGCG	2	8	1124873	1124880	25 %	0 %	50 %	25 %	192289482
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26032	NC_011004	CGG	2	6	1124979	1124984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289482
26033	NC_011004	CG	3	6	1125054	1125059	0 %	0 %	50 %	50 %	192289482
26034	NC_011004	CAG	2	6	1125127	1125132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289482
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26036	NC_011004	GCGA	2	8	1125247	1125254	25 %	0 %	50 %	25 %	192289482
26037	NC_011004	CAG	2	6	1125280	1125285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289482
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26042	NC_011004	CGA	2	6	1125579	1125584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289482
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26049	NC_011004	CGA	2	6	1125816	1125821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289482
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26053	NC_011004	AAG	2	6	1126610	1126615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289483
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26056	NC_011004	GC	3	6	1126680	1126685	0 %	0 %	50 %	50 %	192289483
26057	NC_011004	CG	3	6	1126689	1126694	0 %	0 %	50 %	50 %	192289483
26058	NC_011004	ACC	2	6	1126709	1126714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289483
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26232	NC_011004	CGG	2	6	1139880	1139885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289495
26233	NC_011004	CGA	2	6	1139892	1139897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289495
26234	NC_011004	AAC	2	6	1139991	1139996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289495
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26237	NC_011004	CGT	2	6	1140129	1140134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289495
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26243	NC_011004	GTC	2	6	1140219	1140224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289495
26244	NC_011004	GC	3	6	1140225	1140230	0 %	0 %	50 %	50 %	192289495
26245	NC_011004	GCG	2	6	1140242	1140247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289495
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26255	NC_011004	GC	3	6	1142780	1142785	0 %	0 %	50 %	50 %	192289496
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26340	NC_011004	GAA	3	9	1148643	1148651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289501
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26343	NC_011004	GCCA	2	8	1148818	1148825	25 %	0 %	25 %	50 %	192289501
26344	NC_011004	GCG	2	6	1148894	1148899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289501
26345	NC_011004	AGC	2	6	1148947	1148952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289501
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26347	NC_011004	CTT	2	6	1149147	1149152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289501
26348	NC_011004	GCC	2	6	1149156	1149161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289501
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26442	NC_011004	GGC	2	6	1153955	1153960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289505
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26444	NC_011004	CAT	2	6	1154031	1154036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289505
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26446	NC_011004	GCG	2	6	1155371	1155376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289506
26447	NC_011004	GGA	2	6	1155454	1155459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289506
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26450	NC_011004	ACCAGC	5	30	1155543	1155572	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	192289506
26451	NC_011004	CGA	2	6	1155615	1155620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289506
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26454	NC_011004	GCC	2	6	1155937	1155942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289507
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26456	NC_011004	TTG	2	6	1156012	1156017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289507
26457	NC_011004	CCG	2	6	1156042	1156047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289507
26458	NC_011004	CGA	2	6	1156103	1156108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289507
26459	NC_011004	GC	3	6	1156167	1156172	0 %	0 %	50 %	50 %	192289507
26460	NC_011004	GAA	2	6	1156185	1156190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289507
26461	NC_011004	TCA	2	6	1156239	1156244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289508
26462	NC_011004	ACG	2	6	1156255	1156260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289508
26463	NC_011004	TGTCGA	2	12	1156271	1156282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192289508
26464	NC_011004	TCGA	2	8	1156384	1156391	25 %	25 %	25 %	25 %	192289508
26465	NC_011004	CTG	2	6	1156426	1156431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289508
26466	NC_011004	TTG	2	6	1156471	1156476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289508
26467	NC_011004	GCCT	2	8	1156544	1156551	0 %	25 %	25 %	50 %	192289508
26468	NC_011004	TC	4	8	1156567	1156574	0 %	50 %	0 %	50 %	192289508
26469	NC_011004	G	6	6	1156591	1156596	0 %	0 %	100 %	0 %	192289508
26470	NC_011004	CTCGCG	2	12	1156630	1156641	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192289508
26471	NC_011004	CG	3	6	1156665	1156670	0 %	0 %	50 %	50 %	192289508
26472	NC_011004	CCA	2	6	1156680	1156685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289508
26473	NC_011004	GC	3	6	1156695	1156700	0 %	0 %	50 %	50 %	192289508
26474	NC_011004	CGC	2	6	1156722	1156727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289508
26475	NC_011004	GGT	2	6	1156752	1156757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289508
26476	NC_011004	ACGA	2	8	1156762	1156769	50 %	0 %	25 %	25 %	192289508
26477	NC_011004	GCTC	2	8	1156847	1156854	0 %	25 %	25 %	50 %	192289508
26478	NC_011004	GC	3	6	1156870	1156875	0 %	0 %	50 %	50 %	192289508
26479	NC_011004	CG	3	6	1156917	1156922	0 %	0 %	50 %	50 %	192289508
26480	NC_011004	CGAGCG	2	12	1156938	1156949	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192289508
26481	NC_011004	TTC	2	6	1157006	1157011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289508
26482	NC_011004	CGTCG	2	10	1157068	1157077	0 %	20 %	40 %	40 %	192289508
26483	NC_011004	CGAG	2	8	1157214	1157221	25 %	0 %	50 %	25 %	192289508
26484	NC_011004	ACA	2	6	1157294	1157299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289508
26485	NC_011004	GTG	2	6	1157410	1157415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289508
26486	NC_011004	CAT	2	6	1157427	1157432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289508
26487	NC_011004	GCA	2	6	1157459	1157464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289508
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26489	NC_011004	ATCG	2	8	1157526	1157533	25 %	25 %	25 %	25 %	192289508
26490	NC_011004	CGG	2	6	1157586	1157591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289508
26491	NC_011004	ACCA	2	8	1157625	1157632	50 %	0 %	0 %	50 %	192289508
26492	NC_011004	CGG	2	6	1157646	1157651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289508
26493	NC_011004	GAA	2	6	1157678	1157683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289509
26494	NC_011004	AGCG	2	8	1157709	1157716	25 %	0 %	50 %	25 %	192289509
26495	NC_011004	CGT	2	6	1157721	1157726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289509
26496	NC_011004	GCC	2	6	1157790	1157795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289509
26497	NC_011004	CGT	2	6	1157829	1157834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289509
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26499	NC_011004	GTC	2	6	1157908	1157913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289509
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