MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_011004	GCG	2	6	818635	818640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289210
19002	NC_011004	TCG	2	6	818690	818695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289210
19003	NC_011004	TTGGCG	2	12	818708	818719	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	192289210
19004	NC_011004	GCG	3	9	818717	818725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289210
19005	NC_011004	CGC	2	6	818746	818751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289210
19006	NC_011004	AGC	2	6	818818	818823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289211
19007	NC_011004	GGC	2	6	818829	818834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289211
19008	NC_011004	GC	3	6	818833	818838	0 %	0 %	50 %	50 %	192289211
19009	NC_011004	AGC	2	6	818896	818901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289211
19010	NC_011004	GCG	2	6	818905	818910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289211
19011	NC_011004	CG	3	6	818975	818980	0 %	0 %	50 %	50 %	192289211
19012	NC_011004	CGG	2	6	819014	819019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289211
19013	NC_011004	GAT	2	6	819036	819041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289211
19014	NC_011004	GCG	2	6	819048	819053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289211
19015	NC_011004	GCA	2	6	819061	819066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289211
19016	NC_011004	CAT	2	6	819084	819089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289211
19017	NC_011004	CAGC	2	8	819113	819120	25 %	0 %	25 %	50 %	192289211
19018	NC_011004	GCG	2	6	819128	819133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289211
19019	NC_011004	TGC	2	6	819143	819148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289211
19020	NC_011004	GCC	2	6	819154	819159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289211
19021	NC_011004	CGC	2	6	819168	819173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289211
19022	NC_011004	CTT	3	9	819174	819182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289211
19023	NC_011004	GCG	2	6	819233	819238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289211
19024	NC_011004	GCA	3	9	819254	819262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289211
19025	NC_011004	GC	4	8	819334	819341	0 %	0 %	50 %	50 %	192289211
19026	NC_011004	CG	3	6	819398	819403	0 %	0 %	50 %	50 %	192289211
19027	NC_011004	CGG	2	6	819464	819469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289211
19028	NC_011004	TCA	2	6	819551	819556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289211
19029	NC_011004	CTT	2	6	819596	819601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289211
19030	NC_011004	GC	3	6	819649	819654	0 %	0 %	50 %	50 %	192289211
19031	NC_011004	GGC	2	6	819655	819660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289211
19032	NC_011004	CGAG	2	8	819710	819717	25 %	0 %	50 %	25 %	192289211
19033	NC_011004	GCT	2	6	819757	819762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289211
19034	NC_011004	GGC	2	6	819793	819798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289211
19035	NC_011004	GTCG	2	8	819816	819823	0 %	25 %	50 %	25 %	192289211
19036	NC_011004	C	6	6	820244	820249	0 %	0 %	0 %	100 %	192289212
19037	NC_011004	CCG	2	6	820268	820273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289212
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19039	NC_011004	TGC	2	6	820278	820283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289212
19040	NC_011004	GC	3	6	820287	820292	0 %	0 %	50 %	50 %	192289212
19041	NC_011004	CAC	2	6	820312	820317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289212
19042	NC_011004	CCGCG	2	10	820369	820378	0 %	0 %	40 %	60 %	192289212
19043	NC_011004	GC	3	6	820405	820410	0 %	0 %	50 %	50 %	192289212
19044	NC_011004	GC	3	6	820435	820440	0 %	0 %	50 %	50 %	192289212
19045	NC_011004	CG	3	6	820499	820504	0 %	0 %	50 %	50 %	192289212
19046	NC_011004	GGC	2	6	820572	820577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289212
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19049	NC_011004	GGGC	2	8	820646	820653	0 %	0 %	75 %	25 %	192289212
19050	NC_011004	GC	3	6	820664	820669	0 %	0 %	50 %	50 %	192289213
19051	NC_011004	CGG	2	6	820689	820694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289213
19052	NC_011004	CG	3	6	820695	820700	0 %	0 %	50 %	50 %	192289213
19053	NC_011004	ATCT	2	8	820756	820763	25 %	50 %	0 %	25 %	192289213
19054	NC_011004	CGCGAC	2	12	820764	820775	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192289213
19055	NC_011004	CGA	3	9	820782	820790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289213
19056	NC_011004	ATCGC	2	10	820799	820808	20 %	20 %	20 %	40 %	192289213
19057	NC_011004	CGT	2	6	820822	820827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289213
19058	NC_011004	GAG	2	6	820849	820854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289213
19059	NC_011004	CTCA	2	8	820876	820883	25 %	25 %	0 %	50 %	192289213
19060	NC_011004	GCCG	2	8	820888	820895	0 %	0 %	50 %	50 %	192289213
19061	NC_011004	GCCG	2	8	820951	820958	0 %	0 %	50 %	50 %	192289213
19062	NC_011004	GGC	2	6	820979	820984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289213
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19070	NC_011004	TGCG	2	8	821258	821265	0 %	25 %	50 %	25 %	192289214
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19072	NC_011004	GTC	2	6	821285	821290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289214
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19075	NC_011004	TCG	2	6	821384	821389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289214
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19086	NC_011004	CGATC	2	10	821667	821676	20 %	20 %	20 %	40 %	192289214
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19101	NC_011004	GCA	2	6	822392	822397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289215
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19108	NC_011004	GC	3	6	822708	822713	0 %	0 %	50 %	50 %	192289215
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19117	NC_011004	GGCC	2	8	822868	822875	0 %	0 %	50 %	50 %	192289215
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19120	NC_011004	CGC	2	6	822897	822902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289215
19121	NC_011004	GC	3	6	822901	822906	0 %	0 %	50 %	50 %	192289215
19122	NC_011004	TCT	2	6	822913	822918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289215
19123	NC_011004	GGC	2	6	822929	822934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289215
19124	NC_011004	CCGC	2	8	822979	822986	0 %	0 %	25 %	75 %	192289215
19125	NC_011004	GATC	2	8	823033	823040	25 %	25 %	25 %	25 %	192289215
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19128	NC_011004	CGA	2	6	823121	823126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289215
19129	NC_011004	CG	3	6	823186	823191	0 %	0 %	50 %	50 %	192289215
19130	NC_011004	CG	3	6	823225	823230	0 %	0 %	50 %	50 %	192289215
19131	NC_011004	CATG	2	8	823238	823245	25 %	25 %	25 %	25 %	192289215
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19142	NC_011004	GGA	2	6	823730	823735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289215
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19144	NC_011004	CGAT	2	8	823825	823832	25 %	25 %	25 %	25 %	192289215
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19235	NC_011004	GCG	2	6	827364	827369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289217
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19358	NC_011004	TCG	2	6	831440	831445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289221
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19361	NC_011004	GC	3	6	831566	831571	0 %	0 %	50 %	50 %	192289221
19362	NC_011004	GCG	2	6	831591	831596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289221
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19377	NC_011004	GCA	3	9	832106	832114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289222
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19474	NC_011004	CAG	2	6	836254	836259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289226
19475	NC_011004	TGC	2	6	836297	836302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289226
19476	NC_011004	CCGGGC	2	12	836383	836394	0 %	0 %	50 %	50 %	192289226
19477	NC_011004	CTGC	2	8	836400	836407	0 %	25 %	25 %	50 %	192289226
19478	NC_011004	CAG	2	6	836434	836439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289226
19479	NC_011004	GC	3	6	836442	836447	0 %	0 %	50 %	50 %	192289226
19480	NC_011004	TCC	2	6	836531	836536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289226
19481	NC_011004	CG	3	6	836572	836577	0 %	0 %	50 %	50 %	192289226
19482	NC_011004	CCGCA	2	10	836628	836637	20 %	0 %	20 %	60 %	192289226
19483	NC_011004	GCA	2	6	836679	836684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289226
19484	NC_011004	CGACCG	2	12	836724	836735	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192289226
19485	NC_011004	GGC	2	6	836749	836754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289226
19486	NC_011004	GTCG	2	8	836771	836778	0 %	25 %	50 %	25 %	192289226
19487	NC_011004	CGGG	2	8	836779	836786	0 %	0 %	75 %	25 %	192289226
19488	NC_011004	TGT	2	6	837361	837366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289227
19489	NC_011004	TTCG	2	8	837372	837379	0 %	50 %	25 %	25 %	192289227
19490	NC_011004	TGA	2	6	837418	837423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289227
19491	NC_011004	CAT	2	6	837428	837433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289227
19492	NC_011004	AAG	2	6	837477	837482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289227
19493	NC_011004	CGC	3	9	837494	837502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289227
19494	NC_011004	GCC	2	6	837510	837515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289227
19495	NC_011004	GCCGAC	2	12	837629	837640	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192289227
19496	NC_011004	CGC	2	6	837692	837697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289227
19497	NC_011004	GCT	2	6	837719	837724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289227
19498	NC_011004	GC	3	6	837778	837783	0 %	0 %	50 %	50 %	192289227
19499	NC_011004	GATG	2	8	837806	837813	25 %	25 %	50 %	0 %	192289227
19500	NC_011004	TGCGAC	2	12	837836	837847	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192289227

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