MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_011004	CAC	2	6	669331	669336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289044
15502	NC_011004	CGG	2	6	669348	669353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289044
15503	NC_011004	GAA	3	9	669366	669374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289044
15504	NC_011004	ACG	2	6	669401	669406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289044
15505	NC_011004	CGT	2	6	669453	669458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289044
15506	NC_011004	CG	3	6	669477	669482	0 %	0 %	50 %	50 %	192289044
15507	NC_011004	GAT	2	6	669609	669614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289044
15508	NC_011004	GCT	2	6	669624	669629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289044
15509	NC_011004	CGA	2	6	669648	669653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289044
15510	NC_011004	CGC	2	6	669726	669731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289044
15511	NC_011004	CGA	2	6	669782	669787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289044
15512	NC_011004	GAG	2	6	669805	669810	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289044
15513	NC_011004	GC	3	6	669831	669836	0 %	0 %	50 %	50 %	192289044
15514	NC_011004	GTCG	2	8	669846	669853	0 %	25 %	50 %	25 %	192289044
15515	NC_011004	CCG	2	6	669854	669859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289044
15516	NC_011004	CGC	2	6	669882	669887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289044
15517	NC_011004	CTG	2	6	670071	670076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289045
15518	NC_011004	CGGG	2	8	670077	670084	0 %	0 %	75 %	25 %	192289045
15519	NC_011004	CCGCG	2	10	670181	670190	0 %	0 %	40 %	60 %	192289045
15520	NC_011004	TCG	2	6	670207	670212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289045
15521	NC_011004	GCC	2	6	670238	670243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289045
15522	NC_011004	GGC	2	6	670256	670261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289045
15523	NC_011004	GCC	2	6	670337	670342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289045
15524	NC_011004	GC	3	6	670490	670495	0 %	0 %	50 %	50 %	192289046
15525	NC_011004	CAG	2	6	670512	670517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289046
15526	NC_011004	TCG	2	6	670519	670524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289046
15527	NC_011004	CGC	2	6	670553	670558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289046
15528	NC_011004	AGCGC	2	10	670598	670607	20 %	0 %	40 %	40 %	192289046
15529	NC_011004	GCC	2	6	670647	670652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289046
15530	NC_011004	CTG	2	6	670719	670724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289046
15531	NC_011004	GTC	2	6	670728	670733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289046
15532	NC_011004	CTT	2	6	670797	670802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289046
15533	NC_011004	CAT	2	6	670814	670819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289046
15534	NC_011004	CGG	2	6	670829	670834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289046
15535	NC_011004	CAGAT	2	10	670858	670867	40 %	20 %	20 %	20 %	192289046
15536	NC_011004	CGC	2	6	670872	670877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289046
15537	NC_011004	CAG	2	6	670881	670886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289046
15538	NC_011004	ATCGAC	2	12	670911	670922	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	192289046
15539	NC_011004	CAC	2	6	670923	670928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289046
15540	NC_011004	GCG	2	6	670961	670966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289046
15541	NC_011004	AGC	2	6	670979	670984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289046
15542	NC_011004	AGC	2	6	671017	671022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289046
15543	NC_011004	CTT	2	6	671165	671170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289046
15544	NC_011004	CAGC	2	8	671171	671178	25 %	0 %	25 %	50 %	192289046
15545	NC_011004	GCC	2	6	671244	671249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289046
15546	NC_011004	CG	3	6	671254	671259	0 %	0 %	50 %	50 %	192289046
15547	NC_011004	GCC	2	6	671286	671291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289046
15548	NC_011004	TTG	2	6	671323	671328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289046
15549	NC_011004	CCAG	2	8	671434	671441	25 %	0 %	25 %	50 %	192289047
15550	NC_011004	GTCC	2	8	671488	671495	0 %	25 %	25 %	50 %	192289047
15551	NC_011004	GCC	2	6	671520	671525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289047
15552	NC_011004	ACC	2	6	671539	671544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289047
15553	NC_011004	GTC	2	6	671579	671584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289047
15554	NC_011004	ATC	2	6	671610	671615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289047
15555	NC_011004	CGA	2	6	671618	671623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289047
15556	NC_011004	GTA	2	6	671648	671653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289047
15557	NC_011004	CTC	2	6	671681	671686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289047
15558	NC_011004	CGG	2	6	671697	671702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289047
15559	NC_011004	GCT	2	6	671724	671729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289047
15560	NC_011004	CGA	2	6	671731	671736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289047
15561	NC_011004	CCGG	2	8	671760	671767	0 %	0 %	50 %	50 %	192289047
15562	NC_011004	GCCG	2	8	671779	671786	0 %	0 %	50 %	50 %	192289047
15563	NC_011004	CGC	2	6	671800	671805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289047
15564	NC_011004	CAC	2	6	671822	671827	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289047
15565	NC_011004	GCC	2	6	671882	671887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289047
15566	NC_011004	GCA	2	6	671992	671997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289047
15567	NC_011004	CCGG	2	8	672044	672051	0 %	0 %	50 %	50 %	192289047
15568	NC_011004	AGCGCC	2	12	672144	672155	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192289047
15569	NC_011004	GCC	2	6	672182	672187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289047
15570	NC_011004	ACG	2	6	672222	672227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289047
15571	NC_011004	CGC	2	6	672241	672246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289047
15572	NC_011004	CTC	2	6	672248	672253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289047
15573	NC_011004	CGT	2	6	672271	672276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289047
15574	NC_011004	GGCT	2	8	672320	672327	0 %	25 %	50 %	25 %	192289047
15575	NC_011004	GCTCA	2	10	672355	672364	20 %	20 %	20 %	40 %	192289048
15576	NC_011004	GCG	2	6	672375	672380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289048
15577	NC_011004	TGA	2	6	672389	672394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289048
15578	NC_011004	CTG	2	6	672396	672401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289048
15579	NC_011004	GCG	2	6	672425	672430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289048
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15581	NC_011004	ATG	2	6	672484	672489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289048
15582	NC_011004	TCA	2	6	672590	672595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289048
15583	NC_011004	CTGCGC	2	12	672597	672608	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192289048
15584	NC_011004	TCG	2	6	672613	672618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289048
15585	NC_011004	GAT	2	6	672624	672629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289048
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15587	NC_011004	CGC	2	6	673273	673278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289049
15588	NC_011004	GCT	2	6	673281	673286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289049
15589	NC_011004	AGC	2	6	673291	673296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289049
15590	NC_011004	AGCGCG	2	12	673302	673313	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192289049
15591	NC_011004	CCGG	2	8	673314	673321	0 %	0 %	50 %	50 %	192289049
15592	NC_011004	CGA	2	6	673364	673369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289049
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15594	NC_011004	CGGA	2	8	673421	673428	25 %	0 %	50 %	25 %	192289049
15595	NC_011004	ACC	3	9	673473	673481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289049
15596	NC_011004	GC	3	6	673482	673487	0 %	0 %	50 %	50 %	192289049
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15599	NC_011004	CG	3	6	673688	673693	0 %	0 %	50 %	50 %	192289049
15600	NC_011004	CAT	2	6	673706	673711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289049
15601	NC_011004	CGA	2	6	673712	673717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289049
15602	NC_011004	CGG	2	6	673735	673740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289049
15603	NC_011004	GAG	2	6	673767	673772	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289049
15604	NC_011004	CCG	2	6	673773	673778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289049
15605	NC_011004	CCA	2	6	673801	673806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289049
15606	NC_011004	TGA	2	6	673885	673890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289049
15607	NC_011004	GAAG	2	8	673913	673920	50 %	0 %	50 %	0 %	192289049
15608	NC_011004	GTCGAG	2	12	673923	673934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192289049
15609	NC_011004	TCG	2	6	673951	673956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289049
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15613	NC_011004	GC	3	6	674106	674111	0 %	0 %	50 %	50 %	192289049
15614	NC_011004	GCC	2	6	674124	674129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289049
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15618	NC_011004	CCCG	2	8	674371	674378	0 %	0 %	25 %	75 %	192289049
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15975	NC_011004	TGA	2	6	689478	689483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289066
15976	NC_011004	CCG	2	6	689546	689551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289066
15977	NC_011004	ACC	2	6	689579	689584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289066
15978	NC_011004	GCC	2	6	689632	689637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289066
15979	NC_011004	GGT	2	6	689680	689685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289066
15980	NC_011004	TTG	2	6	689699	689704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289066
15981	NC_011004	GCA	2	6	689742	689747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289066
15982	NC_011004	AGCC	2	8	689780	689787	25 %	0 %	25 %	50 %	192289066
15983	NC_011004	CCGA	2	8	689804	689811	25 %	0 %	25 %	50 %	192289066
15984	NC_011004	GCTGTA	2	12	689830	689841	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192289066
15985	NC_011004	GTA	2	6	689893	689898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289066
15986	NC_011004	CGT	2	6	689979	689984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289066
15987	NC_011004	GTC	2	6	690007	690012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289066
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15989	NC_011004	CGG	2	6	690147	690152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289066
15990	NC_011004	CGG	2	6	690217	690222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289066
15991	NC_011004	TCG	2	6	690266	690271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289066
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15994	NC_011004	CTG	3	9	690379	690387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289066
15995	NC_011004	GCG	3	9	690431	690439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289066
15996	NC_011004	CTG	2	6	690472	690477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289066
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15998	NC_011004	CTG	3	9	690487	690495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289066
15999	NC_011004	CTG	2	6	690499	690504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289066
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