MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_011004	GTG	2	6	648289	648294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289024
15002	NC_011004	CAG	2	6	648303	648308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15003	NC_011004	GTT	3	9	648360	648368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192289024
15004	NC_011004	GC	3	6	648397	648402	0 %	0 %	50 %	50 %	192289024
15005	NC_011004	TGC	2	6	648413	648418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15006	NC_011004	GCT	2	6	648420	648425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15007	NC_011004	CG	3	6	648426	648431	0 %	0 %	50 %	50 %	192289024
15008	NC_011004	GGCGC	2	10	648501	648510	0 %	0 %	60 %	40 %	192289024
15009	NC_011004	CTCGTC	2	12	648513	648524	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	192289024
15010	NC_011004	GC	3	6	648560	648565	0 %	0 %	50 %	50 %	192289024
15011	NC_011004	GTCG	2	8	648570	648577	0 %	25 %	50 %	25 %	192289024
15012	NC_011004	CGA	2	6	648596	648601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15013	NC_011004	TCG	2	6	648697	648702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15014	NC_011004	GGCC	2	8	648728	648735	0 %	0 %	50 %	50 %	192289024
15015	NC_011004	GC	3	6	648745	648750	0 %	0 %	50 %	50 %	192289024
15016	NC_011004	GGC	2	6	648858	648863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15017	NC_011004	GCGCG	2	10	648878	648887	0 %	0 %	60 %	40 %	192289024
15018	NC_011004	GCC	2	6	648918	648923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289024
15019	NC_011004	GTA	2	6	648945	648950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289024
15020	NC_011004	CGC	2	6	649001	649006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289024
15021	NC_011004	CGG	2	6	649013	649018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15022	NC_011004	ACC	2	6	649060	649065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289024
15023	NC_011004	GCG	2	6	649066	649071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15024	NC_011004	CG	3	6	649103	649108	0 %	0 %	50 %	50 %	192289024
15025	NC_011004	GCCAC	2	10	649148	649157	20 %	0 %	20 %	60 %	192289024
15026	NC_011004	CGG	2	6	649169	649174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15027	NC_011004	GCC	2	6	649199	649204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289024
15028	NC_011004	CGG	2	6	649220	649225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15029	NC_011004	GCA	3	9	649262	649270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15030	NC_011004	CGA	2	6	649323	649328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15031	NC_011004	CGC	2	6	649349	649354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289024
15032	NC_011004	CAT	2	6	649431	649436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289024
15033	NC_011004	CCG	2	6	649494	649499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289024
15034	NC_011004	CGA	2	6	649535	649540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15035	NC_011004	GCG	2	6	649574	649579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15036	NC_011004	CAGCGA	2	12	649584	649595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15037	NC_011004	TTC	2	6	649639	649644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192289024
15038	NC_011004	TCG	2	6	649738	649743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15039	NC_011004	CGG	2	6	649756	649761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15040	NC_011004	GGC	2	6	649767	649772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15041	NC_011004	CAT	2	6	649788	649793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289024
15042	NC_011004	GCGCCG	2	12	649802	649813	0 %	0 %	50 %	50 %	192289024
15043	NC_011004	CTG	2	6	649821	649826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15044	NC_011004	TCC	2	6	649828	649833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289024
15045	NC_011004	AGT	2	6	649886	649891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289024
15046	NC_011004	AGCCG	2	10	649937	649946	20 %	0 %	40 %	40 %	192289024
15047	NC_011004	GC	3	6	649990	649995	0 %	0 %	50 %	50 %	192289024
15048	NC_011004	GACC	2	8	650022	650029	25 %	0 %	25 %	50 %	192289024
15049	NC_011004	GCG	2	6	650046	650051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15050	NC_011004	CGC	2	6	650081	650086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289024
15051	NC_011004	GCG	2	6	650217	650222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15052	NC_011004	CTC	2	6	650229	650234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192289024
15053	NC_011004	GGC	2	6	650250	650255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15054	NC_011004	ACC	2	6	650281	650286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289024
15055	NC_011004	CCA	2	6	650303	650308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289024
15056	NC_011004	TCG	2	6	650326	650331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15057	NC_011004	GC	4	8	650380	650387	0 %	0 %	50 %	50 %	192289024
15058	NC_011004	TCG	2	6	650401	650406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15059	NC_011004	CAG	2	6	650514	650519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15060	NC_011004	GCC	2	6	650559	650564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289024
15061	NC_011004	CCA	2	6	650570	650575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289024
15062	NC_011004	GCG	2	6	650629	650634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289024
15063	NC_011004	CAG	2	6	650640	650645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15064	NC_011004	GAT	2	6	650649	650654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289024
15065	NC_011004	GCCG	2	8	650690	650697	0 %	0 %	50 %	50 %	192289024
15066	NC_011004	GCA	2	6	650708	650713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15067	NC_011004	TCA	2	6	650756	650761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289024
15068	NC_011004	CGC	2	6	650784	650789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289024
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15071	NC_011004	TCG	2	6	650857	650862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289024
15072	NC_011004	GGGGC	2	10	650863	650872	0 %	0 %	80 %	20 %	192289024
15073	NC_011004	GAT	2	6	651170	651175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289025
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15084	NC_011004	GCCG	2	8	651455	651462	0 %	0 %	50 %	50 %	192289025
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15089	NC_011004	CGA	2	6	651700	651705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289025
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15091	NC_011004	CCTG	2	8	651745	651752	0 %	25 %	25 %	50 %	192289025
15092	NC_011004	GCT	2	6	651758	651763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289025
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15100	NC_011004	CGC	2	6	652060	652065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289025
15101	NC_011004	GTG	2	6	652110	652115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289025
15102	NC_011004	GCCG	2	8	652139	652146	0 %	0 %	50 %	50 %	192289025
15103	NC_011004	GC	4	8	652198	652205	0 %	0 %	50 %	50 %	192289025
15104	NC_011004	GAAG	2	8	652223	652230	50 %	0 %	50 %	0 %	192289025
15105	NC_011004	GAA	2	6	652244	652249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192289025
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15110	NC_011004	CGA	2	6	652540	652545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289026
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15113	NC_011004	CCGAT	2	10	652663	652672	20 %	20 %	20 %	40 %	192289026
15114	NC_011004	GCCG	2	8	652682	652689	0 %	0 %	50 %	50 %	192289026
15115	NC_011004	GGT	2	6	652778	652783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289026
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15119	NC_011004	AGC	2	6	652942	652947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289027
15120	NC_011004	CGG	2	6	652949	652954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289027
15121	NC_011004	CGG	2	6	652970	652975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289027
15122	NC_011004	GGC	2	6	653003	653008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289027
15123	NC_011004	CGA	2	6	653024	653029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289027
15124	NC_011004	GAAG	2	8	653048	653055	50 %	0 %	50 %	0 %	192289027
15125	NC_011004	GCCA	2	8	653079	653086	25 %	0 %	25 %	50 %	192289027
15126	NC_011004	CTG	2	6	653106	653111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289027
15127	NC_011004	CGG	2	6	653130	653135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289027
15128	NC_011004	CG	3	6	653155	653160	0 %	0 %	50 %	50 %	192289027
15129	NC_011004	CAA	2	6	653189	653194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192289027
15130	NC_011004	GCC	2	6	653213	653218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289027
15131	NC_011004	CGC	2	6	653239	653244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289027
15132	NC_011004	TGG	2	6	653460	653465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289028
15133	NC_011004	TGG	2	6	653471	653476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289028
15134	NC_011004	GCG	2	6	653477	653482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289028
15135	NC_011004	CGGCT	2	10	653666	653675	0 %	20 %	40 %	40 %	192289028
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15142	NC_011004	CGC	2	6	654024	654029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289028
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15144	NC_011004	CCA	2	6	654078	654083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289028
15145	NC_011004	CGT	2	6	654105	654110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289028
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15149	NC_011004	CCG	2	6	654252	654257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289028
15150	NC_011004	GC	3	6	654298	654303	0 %	0 %	50 %	50 %	192289028
15151	NC_011004	C	6	6	654303	654308	0 %	0 %	0 %	100 %	192289028
15152	NC_011004	CGC	2	6	654352	654357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289028
15153	NC_011004	GCC	2	6	654384	654389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289028
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15155	NC_011004	GTC	2	6	654446	654451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289028
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15157	NC_011004	CCG	2	6	654466	654471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289028
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15193	NC_011004	GGC	2	6	656061	656066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289031
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15199	NC_011004	CTG	2	6	656404	656409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289031
15200	NC_011004	GTGCCG	2	12	656410	656421	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192289031
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15202	NC_011004	AGCG	2	8	656566	656573	25 %	0 %	50 %	25 %	192289031
15203	NC_011004	GCC	2	6	656575	656580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289031
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15209	NC_011004	GCC	2	6	656872	656877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289032
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15212	NC_011004	ACG	2	6	656918	656923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289032
15213	NC_011004	GC	3	6	656961	656966	0 %	0 %	50 %	50 %	192289032
15214	NC_011004	CGG	2	6	657015	657020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289032
15215	NC_011004	TGA	2	6	657024	657029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289032
15216	NC_011004	GCT	2	6	657066	657071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289032
15217	NC_011004	CGA	2	6	657075	657080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289032
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15220	NC_011004	ATG	2	6	657240	657245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289033
15221	NC_011004	GAC	2	6	657288	657293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289033
15222	NC_011004	CATC	2	8	657338	657345	25 %	25 %	0 %	50 %	192289033
15223	NC_011004	GC	3	6	657368	657373	0 %	0 %	50 %	50 %	192289033
15224	NC_011004	CG	3	6	657597	657602	0 %	0 %	50 %	50 %	192289033
15225	NC_011004	CGT	2	6	657619	657624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289033
15226	NC_011004	CGG	2	6	657637	657642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289033
15227	NC_011004	TGC	3	9	657679	657687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289033
15228	NC_011004	GC	3	6	657686	657691	0 %	0 %	50 %	50 %	192289033
15229	NC_011004	GCT	2	6	657709	657714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289033
15230	NC_011004	CGC	2	6	657722	657727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289033
15231	NC_011004	ATC	2	6	657780	657785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289033
15232	NC_011004	GGC	2	6	657813	657818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289033
15233	NC_011004	GATC	2	8	657845	657852	25 %	25 %	25 %	25 %	192289033
15234	NC_011004	GC	3	6	657870	657875	0 %	0 %	50 %	50 %	192289033
15235	NC_011004	GCA	2	6	657893	657898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289033
15236	NC_011004	CGGC	2	8	657899	657906	0 %	0 %	50 %	50 %	192289033
15237	NC_011004	CCGGCC	2	12	657931	657942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289033
15238	NC_011004	CTGCG	2	10	657980	657989	0 %	20 %	40 %	40 %	192289034
15239	NC_011004	TCG	2	6	658025	658030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289034
15240	NC_011004	TCG	2	6	658119	658124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289034
15241	NC_011004	GGCCGC	2	12	658133	658144	0 %	0 %	50 %	50 %	192289034
15242	NC_011004	GC	3	6	658143	658148	0 %	0 %	50 %	50 %	192289034
15243	NC_011004	GCC	2	6	658160	658165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289034
15244	NC_011004	CGC	2	6	658171	658176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289034
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15248	NC_011004	CCG	2	6	658290	658295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289034
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15250	NC_011004	CCGA	2	8	658382	658389	25 %	0 %	25 %	50 %	192289034
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15256	NC_011004	CGG	2	6	658833	658838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289035
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15268	NC_011004	GCT	2	6	659190	659195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289036
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15304	NC_011004	CGA	2	6	660355	660360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289037
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15350	NC_011004	GGTC	2	8	662929	662936	0 %	25 %	50 %	25 %	192289039
15351	NC_011004	CGC	2	6	662955	662960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289039
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15354	NC_011004	TGG	2	6	663081	663086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289039
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15358	NC_011004	CGGTG	2	10	663241	663250	0 %	20 %	60 %	20 %	192289039
15359	NC_011004	CGT	2	6	663277	663282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289039
15360	NC_011004	CG	3	6	663294	663299	0 %	0 %	50 %	50 %	192289039
15361	NC_011004	TCA	2	6	663303	663308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192289039
15362	NC_011004	CCG	2	6	663516	663521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289039
15363	NC_011004	TCG	2	6	663642	663647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289039
15364	NC_011004	CG	3	6	663666	663671	0 %	0 %	50 %	50 %	192289039
15365	NC_011004	CG	3	6	663700	663705	0 %	0 %	50 %	50 %	192289039
15366	NC_011004	GCG	2	6	663719	663724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289039
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15373	NC_011004	TGA	2	6	664035	664040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192289039
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15391	NC_011004	GC	3	6	664555	664560	0 %	0 %	50 %	50 %	192289039
15392	NC_011004	GCG	2	6	664728	664733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289039
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15462	NC_011004	CCGCAG	2	12	667876	667887	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192289042
15463	NC_011004	CG	3	6	667895	667900	0 %	0 %	50 %	50 %	192289042
15464	NC_011004	AGC	2	6	667901	667906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289042
15465	NC_011004	CGG	3	9	667913	667921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289042
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15471	NC_011004	CG	3	6	668039	668044	0 %	0 %	50 %	50 %	192289042
15472	NC_011004	GCG	2	6	668056	668061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289042
15473	NC_011004	GCCGGC	2	12	668095	668106	0 %	0 %	50 %	50 %	192289042
15474	NC_011004	GCA	2	6	668220	668225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289043
15475	NC_011004	GCG	3	9	668226	668234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192289043
15476	NC_011004	TCG	2	6	668243	668248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289043
15477	NC_011004	ACC	2	6	668336	668341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192289043
15478	NC_011004	TGG	2	6	668346	668351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192289043
15479	NC_011004	GCA	2	6	668424	668429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289043
15480	NC_011004	AGG	2	6	668446	668451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192289043
15481	NC_011004	CGC	2	6	668495	668500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289043
15482	NC_011004	CGGC	2	8	668530	668537	0 %	0 %	50 %	50 %	192289043
15483	NC_011004	CGC	2	6	668574	668579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289043
15484	NC_011004	AGC	2	6	668600	668605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289043
15485	NC_011004	CCGG	2	8	668609	668616	0 %	0 %	50 %	50 %	192289043
15486	NC_011004	GCA	2	6	668640	668645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289043
15487	NC_011004	TCG	2	6	668657	668662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289043
15488	NC_011004	CAG	2	6	668683	668688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289043
15489	NC_011004	TCG	2	6	668729	668734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289043
15490	NC_011004	CG	3	6	668756	668761	0 %	0 %	50 %	50 %	192289043
15491	NC_011004	GCC	2	6	668786	668791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289043
15492	NC_011004	AGCCGA	2	12	668853	668864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289043
15493	NC_011004	CGC	2	6	668874	668879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192289043
15494	NC_011004	GC	3	6	668878	668883	0 %	0 %	50 %	50 %	192289043
15495	NC_011004	CGT	2	6	668921	668926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289043
15496	NC_011004	ACG	2	6	668969	668974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192289043
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15498	NC_011004	TCGA	2	8	669247	669254	25 %	25 %	25 %	25 %	192289044
15499	NC_011004	GCT	2	6	669265	669270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192289044
15500	NC_011004	AAGG	2	8	669292	669299	50 %	0 %	50 %	0 %	192289044

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