MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_011004	AGAAC	2	10	563407	563416	60 %	0 %	20 %	20 %	192288945
13002	NC_011004	CGC	2	6	563443	563448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288945
13003	NC_011004	CGA	2	6	563449	563454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288945
13004	NC_011004	GGT	2	6	563498	563503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288945
13005	NC_011004	GAA	2	6	563516	563521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288945
13006	NC_011004	GTA	2	6	563522	563527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288945
13007	NC_011004	ACC	2	6	563535	563540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288945
13008	NC_011004	GAT	3	9	563555	563563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288945
13009	NC_011004	CGC	2	6	563593	563598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288945
13010	NC_011004	GAA	2	6	563744	563749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288945
13011	NC_011004	TCAG	2	8	563772	563779	25 %	25 %	25 %	25 %	192288945
13012	NC_011004	CGAG	2	8	563788	563795	25 %	0 %	50 %	25 %	192288945
13013	NC_011004	CAT	2	6	563813	563818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288945
13014	NC_011004	GC	3	6	563850	563855	0 %	0 %	50 %	50 %	192288945
13015	NC_011004	GCG	2	6	563907	563912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288945
13016	NC_011004	AGC	2	6	563928	563933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288945
13017	NC_011004	ACC	2	6	563940	563945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288945
13018	NC_011004	GAT	2	6	564008	564013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288945
13019	NC_011004	CGG	2	6	564073	564078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288945
13020	NC_011004	CGA	2	6	564079	564084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288945
13021	NC_011004	AGG	2	6	564088	564093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288945
13022	NC_011004	GTG	2	6	564168	564173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288945
13023	NC_011004	CGCC	2	8	564259	564266	0 %	0 %	25 %	75 %	192288945
13024	NC_011004	GCG	2	6	564297	564302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288946
13025	NC_011004	GGCC	2	8	564319	564326	0 %	0 %	50 %	50 %	192288946
13026	NC_011004	AACG	2	8	564327	564334	50 %	0 %	25 %	25 %	192288946
13027	NC_011004	GGT	2	6	564337	564342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288946
13028	NC_011004	ATC	2	6	564390	564395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288946
13029	NC_011004	TCG	2	6	564405	564410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13030	NC_011004	GCG	2	6	564469	564474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288946
13031	NC_011004	GCA	2	6	564475	564480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13032	NC_011004	GC	3	6	564490	564495	0 %	0 %	50 %	50 %	192288946
13033	NC_011004	CGA	2	6	564512	564517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13034	NC_011004	TGA	2	6	564534	564539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288946
13035	NC_011004	GTG	2	6	564633	564638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288946
13036	NC_011004	CGG	2	6	564664	564669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288946
13037	NC_011004	CGA	2	6	564670	564675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13038	NC_011004	TGT	2	6	564691	564696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288946
13039	NC_011004	CGT	2	6	564760	564765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13040	NC_011004	GCC	2	6	564771	564776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288946
13041	NC_011004	CTG	3	9	564851	564859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13042	NC_011004	AGCTGC	2	12	564867	564878	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13043	NC_011004	GCG	2	6	564897	564902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288946
13044	NC_011004	GTCGAG	2	12	564911	564922	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192288946
13045	NC_011004	GCT	2	6	564973	564978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13046	NC_011004	GGCCTG	2	12	565076	565087	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192288946
13047	NC_011004	GATC	2	8	565114	565121	25 %	25 %	25 %	25 %	192288946
13048	NC_011004	CCTT	2	8	565155	565162	0 %	50 %	0 %	50 %	192288946
13049	NC_011004	CGA	2	6	565174	565179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13050	NC_011004	CGT	2	6	565231	565236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13051	NC_011004	GGT	2	6	565238	565243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288946
13052	NC_011004	GCC	2	6	565253	565258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288946
13053	NC_011004	CGC	2	6	565276	565281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288946
13054	NC_011004	CCA	2	6	565291	565296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288946
13055	NC_011004	CAG	3	9	565310	565318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13056	NC_011004	GCC	2	6	565321	565326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288946
13057	NC_011004	GCC	2	6	565343	565348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288946
13058	NC_011004	CGCGG	2	10	565354	565363	0 %	0 %	60 %	40 %	192288946
13059	NC_011004	CCG	2	6	565390	565395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288946
13060	NC_011004	CTG	2	6	565403	565408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288946
13061	NC_011004	TCGG	2	8	565410	565417	0 %	25 %	50 %	25 %	192288946
13062	NC_011004	CTC	2	6	565446	565451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288947
13063	NC_011004	CGT	2	6	565453	565458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288947
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13065	NC_011004	GTG	2	6	565476	565481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288947
13066	NC_011004	TGA	2	6	565508	565513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288947
13067	NC_011004	TCC	2	6	565543	565548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288947
13068	NC_011004	AGC	2	6	565609	565614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288947
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13070	NC_011004	GTC	2	6	565662	565667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288947
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13072	NC_011004	CCAG	2	8	565679	565686	25 %	0 %	25 %	50 %	192288947
13073	NC_011004	GC	3	6	565777	565782	0 %	0 %	50 %	50 %	192288947
13074	NC_011004	TGCCG	2	10	565820	565829	0 %	20 %	40 %	40 %	192288947
13075	NC_011004	GC	3	6	565852	565857	0 %	0 %	50 %	50 %	192288947
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13079	NC_011004	GCCG	2	8	566208	566215	0 %	0 %	50 %	50 %	192288948
13080	NC_011004	CCG	2	6	566237	566242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288948
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13083	NC_011004	CTG	2	6	566259	566264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288948
13084	NC_011004	CGGC	2	8	566325	566332	0 %	0 %	50 %	50 %	192288948
13085	NC_011004	TGC	2	6	566469	566474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288948
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13090	NC_011004	TGC	2	6	566859	566864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288949
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13092	NC_011004	CGGC	2	8	566901	566908	0 %	0 %	50 %	50 %	192288949
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13101	NC_011004	CGGCG	2	10	567364	567373	0 %	0 %	60 %	40 %	192288949
13102	NC_011004	CTG	2	6	567374	567379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288949
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13119	NC_011004	GCT	2	6	568292	568297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288950
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13121	NC_011004	GAA	2	6	568331	568336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288950
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13475	NC_011004	CAT	2	6	582740	582745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288964
13476	NC_011004	CTG	2	6	582782	582787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288964
13477	NC_011004	TCG	2	6	582846	582851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288964
13478	NC_011004	CGG	2	6	582887	582892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288964
13479	NC_011004	AGTGC	2	10	582896	582905	20 %	20 %	40 %	20 %	192288964
13480	NC_011004	GCT	2	6	582943	582948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288964
13481	NC_011004	TCG	2	6	583017	583022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288964
13482	NC_011004	GCG	2	6	583046	583051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288964
13483	NC_011004	CCT	2	6	583107	583112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288964
13484	NC_011004	CGC	2	6	583119	583124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288964
13485	NC_011004	GCG	2	6	583187	583192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288964
13486	NC_011004	GGC	3	9	583205	583213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288964
13487	NC_011004	CGC	2	6	583219	583224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288964
13488	NC_011004	TCG	2	6	583360	583365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288965
13489	NC_011004	GCC	2	6	583401	583406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288965
13490	NC_011004	GC	6	12	583425	583436	0 %	0 %	50 %	50 %	192288965
13491	NC_011004	CGC	2	6	583481	583486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288965
13492	NC_011004	CGC	2	6	583509	583514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288965
13493	NC_011004	ACC	2	6	583534	583539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288965
13494	NC_011004	CG	3	6	583607	583612	0 %	0 %	50 %	50 %	192288965
13495	NC_011004	GATGCT	2	12	583623	583634	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192288965
13496	NC_011004	GCC	2	6	583660	583665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288965
13497	NC_011004	GGC	2	6	583686	583691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288965
13498	NC_011004	CAC	2	6	583752	583757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288965
13499	NC_011004	GCG	2	6	583765	583770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288965
13500	NC_011004	ATG	2	6	583777	583782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288965

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