MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
128001	NC_011004	CAT	2	6	5614179	5614184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293562
128002	NC_011004	CAC	2	6	5614335	5614340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293562
128003	NC_011004	GC	3	6	5614410	5614415	0 %	0 %	50 %	50 %	192293562
128004	NC_011004	CCG	3	9	5614442	5614450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293562
128005	NC_011004	CAT	2	6	5614452	5614457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293562
128006	NC_011004	CCG	2	6	5614458	5614463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293562
128007	NC_011004	GGA	2	6	5614479	5614484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293562
128008	NC_011004	GAA	2	6	5614497	5614502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293562
128009	NC_011004	TGC	3	9	5614517	5614525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293562
128010	NC_011004	ACG	2	6	5614532	5614537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293562
128011	NC_011004	GGT	2	6	5614584	5614589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293562
128012	NC_011004	CGG	2	6	5614619	5614624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293562
128013	NC_011004	GCGG	2	8	5614656	5614663	0 %	0 %	75 %	25 %	192293562
128014	NC_011004	CGCC	2	8	5615028	5615035	0 %	0 %	25 %	75 %	192293563
128015	NC_011004	CAT	2	6	5615043	5615048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293563
128016	NC_011004	CGTT	2	8	5615056	5615063	0 %	50 %	25 %	25 %	192293563
128017	NC_011004	GA	3	6	5615072	5615077	50 %	0 %	50 %	0 %	192293563
128018	NC_011004	CGA	2	6	5615126	5615131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293563
128019	NC_011004	GCG	2	6	5615149	5615154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293563
128020	NC_011004	CTG	2	6	5615155	5615160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293563
128021	NC_011004	CGA	2	6	5615187	5615192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293563
128022	NC_011004	CGG	2	6	5615208	5615213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293563
128023	NC_011004	GAA	2	6	5615268	5615273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293563
128024	NC_011004	TTC	2	6	5615290	5615295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293563
128025	NC_011004	AAG	2	6	5615302	5615307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293563
128026	NC_011004	GTCG	2	8	5615331	5615338	0 %	25 %	50 %	25 %	192293563
128027	NC_011004	TCG	2	6	5615384	5615389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293563
128028	NC_011004	CAC	3	9	5615397	5615405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293563
128029	NC_011004	CGG	2	6	5615406	5615411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293563
128030	NC_011004	GTGCTG	2	12	5615461	5615472	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	192293563
128031	NC_011004	TGG	2	6	5615477	5615482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293563
128032	NC_011004	GAA	2	6	5615488	5615493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293563
128033	NC_011004	CGC	2	6	5615511	5615516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293563
128034	NC_011004	GAT	2	6	5615745	5615750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293564
128035	NC_011004	CGC	2	6	5615751	5615756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293564
128036	NC_011004	CTG	2	6	5615782	5615787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293564
128037	NC_011004	CGG	2	6	5615799	5615804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293564
128038	NC_011004	TTC	2	6	5615854	5615859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293564
128039	NC_011004	CAG	2	6	5615890	5615895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293564
128040	NC_011004	CCGCAA	2	12	5615896	5615907	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	192293564
128041	NC_011004	CCG	2	6	5615918	5615923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293564
128042	NC_011004	GCG	2	6	5615924	5615929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293564
128043	NC_011004	CGGC	2	8	5616026	5616033	0 %	0 %	50 %	50 %	192293564
128044	NC_011004	CGC	2	6	5616075	5616080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293564
128045	NC_011004	AGG	2	6	5616137	5616142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293564
128046	NC_011004	CGG	2	6	5616167	5616172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293564
128047	NC_011004	GC	3	6	5616210	5616215	0 %	0 %	50 %	50 %	192293564
128048	NC_011004	TCG	2	6	5616224	5616229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293564
128049	NC_011004	TCG	2	6	5616245	5616250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293564
128050	NC_011004	GC	3	6	5616333	5616338	0 %	0 %	50 %	50 %	192293564
128051	NC_011004	C	6	6	5616394	5616399	0 %	0 %	0 %	100 %	192293564
128052	NC_011004	GCC	2	6	5616455	5616460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293564
128053	NC_011004	AGT	2	6	5616473	5616478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293564
128054	NC_011004	CGA	2	6	5616759	5616764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293565
128055	NC_011004	GCG	2	6	5616785	5616790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293565
128056	NC_011004	TTC	2	6	5616799	5616804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293565
128057	NC_011004	GCGG	2	8	5616814	5616821	0 %	0 %	75 %	25 %	192293565
128058	NC_011004	CGG	2	6	5616834	5616839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293565
128059	NC_011004	ATC	2	6	5616866	5616871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293565
128060	NC_011004	CCA	2	6	5616883	5616888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293565
128061	NC_011004	GTC	2	6	5616907	5616912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293565
128062	NC_011004	CG	3	6	5616947	5616952	0 %	0 %	50 %	50 %	192293565
128063	NC_011004	CAG	2	6	5616987	5616992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293565
128064	NC_011004	TCG	2	6	5617004	5617009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293565
128065	NC_011004	AC	5	10	5617041	5617050	50 %	0 %	0 %	50 %	192293565
128066	NC_011004	CGG	2	6	5617094	5617099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293565
128067	NC_011004	TGG	2	6	5617173	5617178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293565
128068	NC_011004	A	6	6	5617521	5617526	100 %	0 %	0 %	0 %	192293566
128069	NC_011004	TCC	2	6	5617529	5617534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192293566
128070	NC_011004	GCTG	2	8	5617689	5617696	0 %	25 %	50 %	25 %	192293566
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128073	NC_011004	CTG	2	6	5617802	5617807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293566
128074	NC_011004	CGC	2	6	5617819	5617824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293566
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128078	NC_011004	CTACGG	2	12	5617954	5617965	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192293566
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128081	NC_011004	CGA	2	6	5618029	5618034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293566
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128083	NC_011004	CGG	2	6	5618098	5618103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293566
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128085	NC_011004	TCG	2	6	5618196	5618201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293566
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128087	NC_011004	GC	5	10	5618243	5618252	0 %	0 %	50 %	50 %	192293566
128088	NC_011004	GC	4	8	5618315	5618322	0 %	0 %	50 %	50 %	192293566
128089	NC_011004	ACG	2	6	5618352	5618357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293566
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128094	NC_011004	CATC	2	8	5618504	5618511	25 %	25 %	0 %	50 %	192293566
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128096	NC_011004	ACCA	2	8	5618606	5618613	50 %	0 %	0 %	50 %	192293566
128097	NC_011004	GCT	2	6	5618617	5618622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293566
128098	NC_011004	ATC	2	6	5618687	5618692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293566
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128100	NC_011004	CGA	2	6	5618776	5618781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293566
128101	NC_011004	GGCC	2	8	5618785	5618792	0 %	0 %	50 %	50 %	192293566
128102	NC_011004	TGA	2	6	5618868	5618873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293566
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128104	NC_011004	GCTG	2	8	5618952	5618959	0 %	25 %	50 %	25 %	192293566
128105	NC_011004	CGA	2	6	5619007	5619012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293566
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128110	NC_011004	GC	3	6	5619162	5619167	0 %	0 %	50 %	50 %	192293566
128111	NC_011004	GCT	2	6	5619211	5619216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293566
128112	NC_011004	CG	3	6	5619282	5619287	0 %	0 %	50 %	50 %	192293566
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128114	NC_011004	ACG	2	6	5619354	5619359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293566
128115	NC_011004	GGT	2	6	5619367	5619372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293566
128116	NC_011004	AAC	2	6	5619374	5619379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293566
128117	NC_011004	CGG	2	6	5619391	5619396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293566
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128219	NC_011004	GGC	2	6	5624011	5624016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293570
128220	NC_011004	TGC	2	6	5624069	5624074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293570
128221	NC_011004	CGA	2	6	5624076	5624081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293570
128222	NC_011004	CTGG	2	8	5624115	5624122	0 %	25 %	50 %	25 %	192293570
128223	NC_011004	GCT	2	6	5624151	5624156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293570
128224	NC_011004	CAA	2	6	5624196	5624201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293570
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128452	NC_011004	GCT	2	6	5633134	5633139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293579
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