MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
126001	NC_011004	CGC	2	6	5523580	5523585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293493
126002	NC_011004	CTT	2	6	5523586	5523591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293493
126003	NC_011004	ACG	2	6	5523636	5523641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293493
126004	NC_011004	CAT	2	6	5523787	5523792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293494
126005	NC_011004	TGCC	2	8	5523796	5523803	0 %	25 %	25 %	50 %	192293494
126006	NC_011004	TCT	2	6	5524053	5524058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293494
126007	NC_011004	ATC	2	6	5524064	5524069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293494
126008	NC_011004	CG	3	6	5524082	5524087	0 %	0 %	50 %	50 %	192293494
126009	NC_011004	CGG	2	6	5524113	5524118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293494
126010	NC_011004	GCG	2	6	5524119	5524124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293494
126011	NC_011004	GC	3	6	5524140	5524145	0 %	0 %	50 %	50 %	192293494
126012	NC_011004	ACGGC	2	10	5524158	5524167	20 %	0 %	40 %	40 %	192293494
126013	NC_011004	TGCGC	2	10	5524192	5524201	0 %	20 %	40 %	40 %	192293494
126014	NC_011004	CGC	2	6	5524205	5524210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293494
126015	NC_011004	GCCT	2	8	5524211	5524218	0 %	25 %	25 %	50 %	192293494
126016	NC_011004	CAC	2	6	5524226	5524231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293494
126017	NC_011004	TGGC	2	8	5524271	5524278	0 %	25 %	50 %	25 %	192293494
126018	NC_011004	CTGC	2	8	5524315	5524322	0 %	25 %	25 %	50 %	192293494
126019	NC_011004	CCG	2	6	5524334	5524339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293494
126020	NC_011004	CTG	2	6	5524340	5524345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293494
126021	NC_011004	CGA	3	9	5524348	5524356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293494
126022	NC_011004	ACG	2	6	5524476	5524481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293495
126023	NC_011004	CGGC	2	8	5524539	5524546	0 %	0 %	50 %	50 %	192293495
126024	NC_011004	GGC	3	9	5524544	5524552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293495
126025	NC_011004	CGG	2	6	5524593	5524598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293495
126026	NC_011004	GGT	2	6	5524606	5524611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293495
126027	NC_011004	CGA	2	6	5524663	5524668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293495
126028	NC_011004	GC	3	6	5524740	5524745	0 %	0 %	50 %	50 %	192293495
126029	NC_011004	TGC	2	6	5524794	5524799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293495
126030	NC_011004	CG	4	8	5524801	5524808	0 %	0 %	50 %	50 %	192293495
126031	NC_011004	GC	3	6	5524817	5524822	0 %	0 %	50 %	50 %	192293495
126032	NC_011004	GCA	2	6	5524860	5524865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293495
126033	NC_011004	TGC	2	6	5524869	5524874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293495
126034	NC_011004	CGG	2	6	5524879	5524884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293495
126035	NC_011004	GCT	2	6	5524894	5524899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293495
126036	NC_011004	CTG	2	6	5524928	5524933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293495
126037	NC_011004	ACG	2	6	5524961	5524966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293495
126038	NC_011004	GC	3	6	5524982	5524987	0 %	0 %	50 %	50 %	192293495
126039	NC_011004	CGCTGC	2	12	5524995	5525006	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192293495
126040	NC_011004	CTT	2	6	5525032	5525037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293495
126041	NC_011004	CGA	2	6	5525050	5525055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293495
126042	NC_011004	CGA	2	6	5525077	5525082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293495
126043	NC_011004	GTTC	2	8	5525154	5525161	0 %	50 %	25 %	25 %	192293495
126044	NC_011004	TGA	2	6	5525163	5525168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293495
126045	NC_011004	CG	3	6	5525169	5525174	0 %	0 %	50 %	50 %	192293495
126046	NC_011004	CGTG	2	8	5525212	5525219	0 %	25 %	50 %	25 %	192293495
126047	NC_011004	GCG	2	6	5525232	5525237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293495
126048	NC_011004	TCG	2	6	5525325	5525330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293495
126049	NC_011004	GAG	2	6	5525369	5525374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293495
126050	NC_011004	GTGC	2	8	5525402	5525409	0 %	25 %	50 %	25 %	192293495
126051	NC_011004	TCAT	2	8	5525463	5525470	25 %	50 %	0 %	25 %	192293496
126052	NC_011004	AGCC	2	8	5525495	5525502	25 %	0 %	25 %	50 %	192293496
126053	NC_011004	CGC	2	6	5525570	5525575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293496
126054	NC_011004	TGC	2	6	5525587	5525592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293496
126055	NC_011004	AGC	2	6	5525614	5525619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293496
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126057	NC_011004	GAT	2	6	5525753	5525758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293496
126058	NC_011004	CGA	2	6	5525759	5525764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293496
126059	NC_011004	GGT	2	6	5525834	5525839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293496
126060	NC_011004	GCG	2	6	5525855	5525860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293496
126061	NC_011004	CG	3	6	5525894	5525899	0 %	0 %	50 %	50 %	192293496
126062	NC_011004	CGG	2	6	5525903	5525908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293496
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126065	NC_011004	TCG	2	6	5525967	5525972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293496
126066	NC_011004	CGG	2	6	5525981	5525986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293496
126067	NC_011004	CAT	2	6	5526020	5526025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293496
126068	NC_011004	CAA	2	6	5526044	5526049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293496
126069	NC_011004	TCGGC	2	10	5526101	5526110	0 %	20 %	40 %	40 %	192293496
126070	NC_011004	CGT	2	6	5526122	5526127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293496
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126080	NC_011004	CTGG	2	8	5526577	5526584	0 %	25 %	50 %	25 %	192293497
126081	NC_011004	CG	3	6	5526607	5526612	0 %	0 %	50 %	50 %	192293497
126082	NC_011004	GGCGAT	2	12	5526616	5526627	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192293497
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126084	NC_011004	CCGG	2	8	5526789	5526796	0 %	0 %	50 %	50 %	192293497
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126086	NC_011004	GCC	2	6	5526830	5526835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293497
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126098	NC_011004	CGA	2	6	5527327	5527332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293498
126099	NC_011004	CCG	2	6	5527333	5527338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293498
126100	NC_011004	GC	3	6	5527345	5527350	0 %	0 %	50 %	50 %	192293498
126101	NC_011004	CGC	2	6	5527367	5527372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293498
126102	NC_011004	GC	3	6	5527385	5527390	0 %	0 %	50 %	50 %	192293498
126103	NC_011004	CAG	2	6	5527431	5527436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293498
126104	NC_011004	CTT	2	6	5527461	5527466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293498
126105	NC_011004	GCG	2	6	5527486	5527491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293498
126106	NC_011004	GTCG	2	8	5527581	5527588	0 %	25 %	50 %	25 %	192293498
126107	NC_011004	CTG	2	6	5527593	5527598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293498
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126110	NC_011004	CGAGGC	2	12	5527751	5527762	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192293498
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126112	NC_011004	GAT	2	6	5527796	5527801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293498
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126114	NC_011004	CCA	2	6	5534531	5534536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293499
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