MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_011004	CCG	2	6	520778	520783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288912
12002	NC_011004	CGATC	2	10	520794	520803	20 %	20 %	20 %	40 %	192288912
12003	NC_011004	GCC	2	6	520809	520814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288912
12004	NC_011004	GAA	2	6	520822	520827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288912
12005	NC_011004	CGC	2	6	520866	520871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288912
12006	NC_011004	CCG	2	6	520929	520934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288912
12007	NC_011004	TGGC	2	8	520947	520954	0 %	25 %	50 %	25 %	192288912
12008	NC_011004	GAA	2	6	520971	520976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288912
12009	NC_011004	CGG	2	6	520980	520985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288912
12010	NC_011004	CGT	2	6	521013	521018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288912
12011	NC_011004	TTC	2	6	521059	521064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288912
12012	NC_011004	TGC	2	6	521090	521095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288912
12013	NC_011004	GAGC	2	8	521175	521182	25 %	0 %	50 %	25 %	192288912
12014	NC_011004	GCC	2	6	521206	521211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288912
12015	NC_011004	CGG	2	6	521235	521240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288912
12016	NC_011004	ACC	2	6	521269	521274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288912
12017	NC_011004	CGC	2	6	521318	521323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288912
12018	NC_011004	CCA	2	6	521324	521329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288912
12019	NC_011004	CCG	2	6	521337	521342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288912
12020	NC_011004	GGT	2	6	521436	521441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288912
12021	NC_011004	CG	3	6	521584	521589	0 %	0 %	50 %	50 %	192288912
12022	NC_011004	CG	3	6	521609	521614	0 %	0 %	50 %	50 %	192288912
12023	NC_011004	TGG	2	6	521636	521641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288912
12024	NC_011004	GCG	2	6	521658	521663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288912
12025	NC_011004	TGTCGG	2	12	521666	521677	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	192288912
12026	NC_011004	TGC	2	6	521687	521692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288912
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12030	NC_011004	TCG	2	6	521792	521797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288912
12031	NC_011004	CGA	2	6	521826	521831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288912
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12033	NC_011004	CAC	2	6	521883	521888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288912
12034	NC_011004	TGC	2	6	521894	521899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288912
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12040	NC_011004	CTT	2	6	522045	522050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288913
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12043	NC_011004	GGC	2	6	522129	522134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288913
12044	NC_011004	CCGGC	2	10	522175	522184	0 %	0 %	40 %	60 %	192288913
12045	NC_011004	CGG	2	6	522197	522202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288913
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12050	NC_011004	CGG	3	9	522318	522326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288913
12051	NC_011004	CGG	2	6	522344	522349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288913
12052	NC_011004	AAC	2	6	522457	522462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288913
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12055	NC_011004	CGC	2	6	522599	522604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288913
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12059	NC_011004	CCA	2	6	522665	522670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288913
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12101	NC_011004	GCC	2	6	524356	524361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288915
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12104	NC_011004	GCGA	2	8	524679	524686	25 %	0 %	50 %	25 %	192288916
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12111	NC_011004	GTAG	2	8	524908	524915	25 %	25 %	50 %	0 %	192288916
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12118	NC_011004	GCA	2	6	525217	525222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288916
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12477	NC_011004	GTG	2	6	541060	541065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288927
12478	NC_011004	CGC	2	6	541088	541093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
12479	NC_011004	CGC	2	6	541131	541136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288927
12480	NC_011004	AGC	3	9	541177	541185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288927
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12482	NC_011004	GATC	2	8	541247	541254	25 %	25 %	25 %	25 %	192288927
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12484	NC_011004	CTT	2	6	541289	541294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288927
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