MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
124001	NC_011004	CTGCAC	2	12	5435341	5435352	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	192293411
124002	NC_011004	AGCC	2	8	5435357	5435364	25 %	0 %	25 %	50 %	192293411
124003	NC_011004	ACC	2	6	5435399	5435404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293411
124004	NC_011004	CGC	2	6	5435416	5435421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293411
124005	NC_011004	CCGA	2	8	5435441	5435448	25 %	0 %	25 %	50 %	192293411
124006	NC_011004	GCC	2	6	5435449	5435454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293411
124007	NC_011004	CCG	2	6	5435516	5435521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293411
124008	NC_011004	TTG	2	6	5435531	5435536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192293411
124009	NC_011004	GTC	2	6	5435560	5435565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293411
124010	NC_011004	CG	3	6	5435592	5435597	0 %	0 %	50 %	50 %	192293411
124011	NC_011004	CCG	2	6	5435610	5435615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293411
124012	NC_011004	GCC	2	6	5435623	5435628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293411
124013	NC_011004	GTC	2	6	5435749	5435754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293411
124014	NC_011004	CGA	2	6	5435760	5435765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293411
124015	NC_011004	CGT	2	6	5435787	5435792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293411
124016	NC_011004	GTC	2	6	5435795	5435800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293411
124017	NC_011004	ATT	2	6	5435833	5435838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192293411
124018	NC_011004	CGG	2	6	5435856	5435861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293411
124019	NC_011004	TGA	2	6	5435862	5435867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293411
124020	NC_011004	ATC	2	6	5435891	5435896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293411
124021	NC_011004	CTG	2	6	5435950	5435955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293411
124022	NC_011004	GCG	2	6	5436015	5436020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293411
124023	NC_011004	TCG	3	9	5436032	5436040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293411
124024	NC_011004	CGG	2	6	5436099	5436104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293411
124025	NC_011004	GCC	2	6	5436178	5436183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293411
124026	NC_011004	CCA	3	9	5436189	5436197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293411
124027	NC_011004	GA	3	6	5436227	5436232	50 %	0 %	50 %	0 %	192293411
124028	NC_011004	CGC	2	6	5436233	5436238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293411
124029	NC_011004	GCG	2	6	5436570	5436575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293412
124030	NC_011004	CGAC	2	8	5436653	5436660	25 %	0 %	25 %	50 %	192293412
124031	NC_011004	TCC	2	6	5436681	5436686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192293412
124032	NC_011004	GCC	2	6	5436705	5436710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293412
124033	NC_011004	TCGCC	2	10	5436749	5436758	0 %	20 %	20 %	60 %	192293412
124034	NC_011004	GCC	2	6	5436777	5436782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293412
124035	NC_011004	TTC	2	6	5436786	5436791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293412
124036	NC_011004	CTG	2	6	5436843	5436848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293412
124037	NC_011004	GCC	4	12	5436858	5436869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293412
124038	NC_011004	ACG	2	6	5436878	5436883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293412
124039	NC_011004	AGC	3	9	5436997	5437005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293412
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124041	NC_011004	GCG	2	6	5437036	5437041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293412
124042	NC_011004	CGA	2	6	5437193	5437198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293413
124043	NC_011004	ACC	2	6	5437258	5437263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293413
124044	NC_011004	ACG	2	6	5437304	5437309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293413
124045	NC_011004	CGC	2	6	5437332	5437337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293413
124046	NC_011004	CG	3	6	5437375	5437380	0 %	0 %	50 %	50 %	192293413
124047	NC_011004	CGA	2	6	5437400	5437405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293413
124048	NC_011004	CGG	2	6	5437406	5437411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293413
124049	NC_011004	AGC	2	6	5437414	5437419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293413
124050	NC_011004	ATG	2	6	5437447	5437452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293413
124051	NC_011004	CG	3	6	5437631	5437636	0 %	0 %	50 %	50 %	192293414
124052	NC_011004	CGC	3	9	5437643	5437651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293414
124053	NC_011004	CGAT	2	8	5437706	5437713	25 %	25 %	25 %	25 %	192293414
124054	NC_011004	CGG	2	6	5437725	5437730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293414
124055	NC_011004	GCT	2	6	5437743	5437748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293414
124056	NC_011004	GCT	2	6	5437797	5437802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293414
124057	NC_011004	GAC	2	6	5437810	5437815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293414
124058	NC_011004	GAT	2	6	5437821	5437826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293414
124059	NC_011004	CGG	2	6	5437859	5437864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293414
124060	NC_011004	CGC	2	6	5437884	5437889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293414
124061	NC_011004	GCA	2	6	5437896	5437901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293414
124062	NC_011004	CGC	2	6	5437957	5437962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293414
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124065	NC_011004	GTCG	2	8	5438052	5438059	0 %	25 %	50 %	25 %	192293414
124066	NC_011004	CG	3	6	5438086	5438091	0 %	0 %	50 %	50 %	192293414
124067	NC_011004	CTG	2	6	5438092	5438097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293414
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124070	NC_011004	CG	3	6	5438200	5438205	0 %	0 %	50 %	50 %	192293414
124071	NC_011004	CTG	2	6	5438206	5438211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293414
124072	NC_011004	TC	3	6	5438216	5438221	0 %	50 %	0 %	50 %	192293414
124073	NC_011004	CGA	2	6	5438229	5438234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293414
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124076	NC_011004	CGT	2	6	5438280	5438285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293414
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124081	NC_011004	TC	3	6	5438454	5438459	0 %	50 %	0 %	50 %	192293414
124082	NC_011004	GCG	2	6	5438474	5438479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293414
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124089	NC_011004	GCGCT	2	10	5438756	5438765	0 %	20 %	40 %	40 %	192293414
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124098	NC_011004	GCG	2	6	5438981	5438986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293414
124099	NC_011004	CGA	2	6	5439015	5439020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293414
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124101	NC_011004	CGC	3	9	5439071	5439079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293414
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124103	NC_011004	AGCG	2	8	5439179	5439186	25 %	0 %	50 %	25 %	192293415
124104	NC_011004	CGC	2	6	5439210	5439215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293415
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124108	NC_011004	TGA	2	6	5439366	5439371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293415
124109	NC_011004	TGA	2	6	5439471	5439476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293415
124110	NC_011004	GCT	2	6	5439502	5439507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293415
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124113	NC_011004	CCG	2	6	5439672	5439677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293415
124114	NC_011004	CGA	2	6	5439690	5439695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293415
124115	NC_011004	CCG	2	6	5439696	5439701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293415
124116	NC_011004	CGCGGC	2	12	5439784	5439795	0 %	0 %	50 %	50 %	192293415
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124220	NC_011004	TGA	2	6	5444152	5444157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293419
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124223	NC_011004	CACCAG	2	12	5444195	5444206	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	192293419
124224	NC_011004	GC	3	6	5444263	5444268	0 %	0 %	50 %	50 %	192293419
124225	NC_011004	CAG	3	9	5444306	5444314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293419
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124227	NC_011004	GA	3	6	5444415	5444420	50 %	0 %	50 %	0 %	192293419
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124457	NC_011004	GCA	2	6	5454200	5454205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293426
124458	NC_011004	GGC	2	6	5454211	5454216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293426
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124460	NC_011004	GGC	2	6	5454255	5454260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293426
124461	NC_011004	GAT	2	6	5454291	5454296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293426
124462	NC_011004	GGC	2	6	5454310	5454315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293426
124463	NC_011004	GC	3	6	5454352	5454357	0 %	0 %	50 %	50 %	192293426
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