MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
121001	NC_011004	GC	3	6	5307664	5307669	0 %	0 %	50 %	50 %	192293285
121002	NC_011004	ATG	2	6	5307679	5307684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293285
121003	NC_011004	ATC	2	6	5307751	5307756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293285
121004	NC_011004	CCGC	2	8	5307833	5307840	0 %	0 %	25 %	75 %	192293285
121005	NC_011004	CGG	2	6	5307890	5307895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293285
121006	NC_011004	GTG	2	6	5307960	5307965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293285
121007	NC_011004	GC	3	6	5307986	5307991	0 %	0 %	50 %	50 %	192293285
121008	NC_011004	ATC	2	6	5307997	5308002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293285
121009	NC_011004	ACC	2	6	5308031	5308036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293285
121010	NC_011004	CCG	2	6	5308037	5308042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293285
121011	NC_011004	GTG	2	6	5308057	5308062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293285
121012	NC_011004	CGC	2	6	5308154	5308159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293285
121013	NC_011004	CGT	2	6	5308167	5308172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293285
121014	NC_011004	GCT	2	6	5308206	5308211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293285
121015	NC_011004	CGG	2	6	5308230	5308235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293285
121016	NC_011004	GATCA	2	10	5308240	5308249	40 %	20 %	20 %	20 %	192293285
121017	NC_011004	CCTC	2	8	5308274	5308281	0 %	25 %	0 %	75 %	192293285
121018	NC_011004	TCG	2	6	5308285	5308290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293285
121019	NC_011004	TCG	2	6	5308295	5308300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293285
121020	NC_011004	CGC	2	6	5308520	5308525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293286
121021	NC_011004	GCG	2	6	5308549	5308554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293286
121022	NC_011004	ATC	2	6	5308556	5308561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293286
121023	NC_011004	CAT	2	6	5308638	5308643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293286
121024	NC_011004	GCG	2	6	5308646	5308651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293286
121025	NC_011004	CTG	2	6	5308675	5308680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293286
121026	NC_011004	CGA	2	6	5308704	5308709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293286
121027	NC_011004	GAA	2	6	5308791	5308796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293286
121028	NC_011004	ACC	2	6	5308801	5308806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293286
121029	NC_011004	GGC	2	6	5308824	5308829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293286
121030	NC_011004	CGA	2	6	5308899	5308904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293286
121031	NC_011004	CGC	2	6	5308956	5308961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293286
121032	NC_011004	TGA	2	6	5308976	5308981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293286
121033	NC_011004	ACC	2	6	5309017	5309022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293286
121034	NC_011004	CGC	2	6	5309067	5309072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293286
121035	NC_011004	CGGCC	2	10	5309094	5309103	0 %	0 %	40 %	60 %	192293286
121036	NC_011004	TCG	2	6	5309108	5309113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293286
121037	NC_011004	CG	3	6	5309210	5309215	0 %	0 %	50 %	50 %	192293286
121038	NC_011004	ACC	2	6	5309317	5309322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293286
121039	NC_011004	TGC	2	6	5309375	5309380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293286
121040	NC_011004	CAA	2	6	5309388	5309393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293286
121041	NC_011004	TGCGC	2	10	5309409	5309418	0 %	20 %	40 %	40 %	192293286
121042	NC_011004	CGA	2	6	5309433	5309438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293286
121043	NC_011004	GATC	2	8	5309545	5309552	25 %	25 %	25 %	25 %	192293287
121044	NC_011004	CAC	2	6	5309594	5309599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293287
121045	NC_011004	CG	3	6	5309600	5309605	0 %	0 %	50 %	50 %	192293287
121046	NC_011004	TCG	2	6	5309644	5309649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293287
121047	NC_011004	GCC	2	6	5309676	5309681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293287
121048	NC_011004	GCG	2	6	5309725	5309730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293287
121049	NC_011004	CGC	2	6	5309749	5309754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293287
121050	NC_011004	GGT	2	6	5309804	5309809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293287
121051	NC_011004	GGA	2	6	5309834	5309839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293287
121052	NC_011004	TCA	2	6	5309914	5309919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293287
121053	NC_011004	CGC	2	6	5309938	5309943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293287
121054	NC_011004	CGC	2	6	5309978	5309983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293287
121055	NC_011004	GC	4	8	5309990	5309997	0 %	0 %	50 %	50 %	192293287
121056	NC_011004	CAC	2	6	5310030	5310035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293287
121057	NC_011004	CCG	2	6	5310097	5310102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293287
121058	NC_011004	CCG	2	6	5310145	5310150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293287
121059	NC_011004	CGC	2	6	5310176	5310181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293287
121060	NC_011004	TCCGA	2	10	5310183	5310192	20 %	20 %	20 %	40 %	192293287
121061	NC_011004	CAA	2	6	5310218	5310223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293287
121062	NC_011004	CCG	2	6	5310287	5310292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293287
121063	NC_011004	CACCCG	2	12	5310323	5310334	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	192293287
121064	NC_011004	CCG	2	6	5310341	5310346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293287
121065	NC_011004	AGC	2	6	5310403	5310408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293287
121066	NC_011004	GTC	2	6	5311055	5311060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293288
121067	NC_011004	CAT	2	6	5311090	5311095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293288
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121070	NC_011004	CGA	2	6	5311208	5311213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293289
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121074	NC_011004	TCA	2	6	5311252	5311257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293289
121075	NC_011004	GCC	2	6	5311264	5311269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293289
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121080	NC_011004	GAA	2	6	5311524	5311529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293290
121081	NC_011004	GCA	2	6	5311538	5311543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293290
121082	NC_011004	CAG	2	6	5311551	5311556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293290
121083	NC_011004	CAT	2	6	5311557	5311562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293290
121084	NC_011004	TGC	2	6	5311585	5311590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293290
121085	NC_011004	CGG	2	6	5311647	5311652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293290
121086	NC_011004	ACG	2	6	5311660	5311665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293290
121087	NC_011004	TGA	2	6	5311685	5311690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293290
121088	NC_011004	TGT	2	6	5311691	5311696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192293290
121089	NC_011004	GAC	2	6	5311710	5311715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293290
121090	NC_011004	GCATC	2	10	5311721	5311730	20 %	20 %	20 %	40 %	192293290
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121096	NC_011004	CGGCGC	2	12	5312021	5312032	0 %	0 %	50 %	50 %	192293290
121097	NC_011004	CTG	2	6	5312098	5312103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293290
121098	NC_011004	ACC	2	6	5312137	5312142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293290
121099	NC_011004	TCG	2	6	5312158	5312163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293290
121100	NC_011004	CGG	2	6	5312182	5312187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293290
121101	NC_011004	GGT	2	6	5312226	5312231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293290
121102	NC_011004	GATCTC	2	12	5312298	5312309	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	192293290
121103	NC_011004	TCG	2	6	5312368	5312373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293290
121104	NC_011004	CCAC	2	8	5312393	5312400	25 %	0 %	0 %	75 %	192293290
121105	NC_011004	TCC	2	6	5312428	5312433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192293290
121106	NC_011004	GC	3	6	5312440	5312445	0 %	0 %	50 %	50 %	192293290
121107	NC_011004	CGG	2	6	5312459	5312464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293290
121108	NC_011004	GAA	2	6	5312469	5312474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293290
121109	NC_011004	AGCA	2	8	5312475	5312482	50 %	0 %	25 %	25 %	192293290
121110	NC_011004	GAACG	2	10	5312838	5312847	40 %	0 %	40 %	20 %	192293291
121111	NC_011004	CTG	2	6	5312857	5312862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293291
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121113	NC_011004	TGCA	2	8	5312890	5312897	25 %	25 %	25 %	25 %	192293291
121114	NC_011004	GAC	2	6	5312898	5312903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293291
121115	NC_011004	GCC	2	6	5312911	5312916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293291
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121149	NC_011004	GTCA	2	8	5314337	5314344	25 %	25 %	25 %	25 %	192293292
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121343	NC_011004	GAA	2	6	5322472	5322477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293300
121344	NC_011004	GGC	2	6	5322486	5322491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293300
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121346	NC_011004	CTG	2	6	5322547	5322552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293300
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121433	NC_011004	GCT	2	6	5325302	5325307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293302
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121448	NC_011004	GCGTC	2	10	5326011	5326020	0 %	20 %	40 %	40 %	192293302
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121450	NC_011004	GC	3	6	5326105	5326110	0 %	0 %	50 %	50 %	192293303
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121452	NC_011004	CCCG	2	8	5326186	5326193	0 %	0 %	25 %	75 %	192293303
121453	NC_011004	CGC	2	6	5326236	5326241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293303
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121456	NC_011004	GCG	2	6	5326389	5326394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293303
121457	NC_011004	GCTG	2	8	5326437	5326444	0 %	25 %	50 %	25 %	192293303
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121459	NC_011004	TCG	2	6	5326496	5326501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293303
121460	NC_011004	CG	3	6	5326528	5326533	0 %	0 %	50 %	50 %	192293303
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121483	NC_011004	TCG	3	9	5327331	5327339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293303
121484	NC_011004	TCC	2	6	5327369	5327374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192293303
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121487	NC_011004	ACC	2	6	5327418	5327423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293303
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121489	NC_011004	TGG	2	6	5327451	5327456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293303
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121491	NC_011004	TGGC	2	8	5327799	5327806	0 %	25 %	50 %	25 %	192293304
121492	NC_011004	CCG	2	6	5327816	5327821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293304
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121494	NC_011004	CGG	2	6	5328048	5328053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293304
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