MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
120001	NC_011004	ACC	2	6	5258326	5258331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293249
120002	NC_011004	CGA	2	6	5258369	5258374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293249
120003	NC_011004	CGC	2	6	5258379	5258384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293249
120004	NC_011004	CCAT	2	8	5258402	5258409	25 %	25 %	0 %	50 %	192293249
120005	NC_011004	CAT	2	6	5258421	5258426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293249
120006	NC_011004	CG	4	8	5258457	5258464	0 %	0 %	50 %	50 %	192293250
120007	NC_011004	CGAA	2	8	5258474	5258481	50 %	0 %	25 %	25 %	192293250
120008	NC_011004	GC	3	6	5258493	5258498	0 %	0 %	50 %	50 %	192293250
120009	NC_011004	ATG	2	6	5258504	5258509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293250
120010	NC_011004	CGG	3	9	5258520	5258528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293250
120011	NC_011004	AGC	2	6	5258531	5258536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293250
120012	NC_011004	CGG	2	6	5258550	5258555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293250
120013	NC_011004	TCA	2	6	5258571	5258576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293250
120014	NC_011004	CCG	2	6	5258577	5258582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293250
120015	NC_011004	CAG	3	9	5258620	5258628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293250
120016	NC_011004	AGA	2	6	5258652	5258657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293250
120017	NC_011004	CGC	2	6	5258659	5258664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293250
120018	NC_011004	GAA	2	6	5258707	5258712	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293250
120019	NC_011004	TCG	2	6	5258747	5258752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293250
120020	NC_011004	GCGCCA	2	12	5258823	5258834	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192293250
120021	NC_011004	GAA	2	6	5258878	5258883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293250
120022	NC_011004	CGGC	2	8	5258901	5258908	0 %	0 %	50 %	50 %	192293250
120023	NC_011004	CAG	2	6	5258923	5258928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293250
120024	NC_011004	AGA	2	6	5258931	5258936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293250
120025	NC_011004	CGGC	2	8	5258982	5258989	0 %	0 %	50 %	50 %	192293250
120026	NC_011004	TGA	2	6	5259018	5259023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293250
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120028	NC_011004	GCG	2	6	5259217	5259222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293250
120029	NC_011004	CGC	2	6	5259262	5259267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293251
120030	NC_011004	TCA	2	6	5259284	5259289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293251
120031	NC_011004	ATG	2	6	5259316	5259321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293251
120032	NC_011004	TCGA	2	8	5259394	5259401	25 %	25 %	25 %	25 %	192293251
120033	NC_011004	GGT	2	6	5259408	5259413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293251
120034	NC_011004	CGC	2	6	5259428	5259433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293251
120035	NC_011004	GAC	2	6	5259438	5259443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293251
120036	NC_011004	GCA	3	9	5259482	5259490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293251
120037	NC_011004	CAG	2	6	5259498	5259503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293251
120038	NC_011004	GCC	2	6	5259571	5259576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293251
120039	NC_011004	ATA	2	6	5259579	5259584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192293251
120040	NC_011004	CAG	2	6	5259618	5259623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293251
120041	NC_011004	CCA	2	6	5259626	5259631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293251
120042	NC_011004	CATC	2	8	5259650	5259657	25 %	25 %	0 %	50 %	192293251
120043	NC_011004	ACC	3	9	5259658	5259666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293251
120044	NC_011004	GAT	2	6	5259716	5259721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293251
120045	NC_011004	CCA	2	6	5259866	5259871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293251
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120047	NC_011004	CAG	2	6	5259972	5259977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293251
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120051	NC_011004	TCA	2	6	5260055	5260060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293251
120052	NC_011004	GCA	2	6	5260100	5260105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293251
120053	NC_011004	GAC	2	6	5260128	5260133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293251
120054	NC_011004	CGA	2	6	5260171	5260176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293252
120055	NC_011004	CG	4	8	5260261	5260268	0 %	0 %	50 %	50 %	192293252
120056	NC_011004	TCG	2	6	5260320	5260325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293252
120057	NC_011004	TCA	2	6	5260345	5260350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293252
120058	NC_011004	CGATCT	2	12	5260396	5260407	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	192293252
120059	NC_011004	CGGC	2	8	5260486	5260493	0 %	0 %	50 %	50 %	192293252
120060	NC_011004	CGA	2	6	5260528	5260533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293252
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120064	NC_011004	ATC	2	6	5260656	5260661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293252
120065	NC_011004	GC	3	6	5260672	5260677	0 %	0 %	50 %	50 %	192293252
120066	NC_011004	TCG	2	6	5260743	5260748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293252
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120072	NC_011004	CG	3	6	5261050	5261055	0 %	0 %	50 %	50 %	192293252
120073	NC_011004	GAT	2	6	5261075	5261080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293252
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120075	NC_011004	AGC	2	6	5261118	5261123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293252
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120081	NC_011004	CGGCG	2	10	5261267	5261276	0 %	0 %	60 %	40 %	192293253
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120087	NC_011004	CGA	2	6	5261611	5261616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293253
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120093	NC_011004	GC	3	6	5261896	5261901	0 %	0 %	50 %	50 %	192293253
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120100	NC_011004	GC	3	6	5262015	5262020	0 %	0 %	50 %	50 %	192293253
120101	NC_011004	GCG	2	6	5262040	5262045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293253
120102	NC_011004	TGA	2	6	5262082	5262087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293253
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120111	NC_011004	CGGC	2	8	5262411	5262418	0 %	0 %	50 %	50 %	192293254
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120113	NC_011004	GTC	2	6	5262457	5262462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293254
120114	NC_011004	TCA	2	6	5262486	5262491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293254
120115	NC_011004	GCC	2	6	5262545	5262550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293254
120116	NC_011004	GCCGA	2	10	5262557	5262566	20 %	0 %	40 %	40 %	192293254
120117	NC_011004	GCA	2	6	5262642	5262647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293254
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120119	NC_011004	CGC	2	6	5262687	5262692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293254
120120	NC_011004	AGG	2	6	5262747	5262752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293254
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120125	NC_011004	CGC	2	6	5262868	5262873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293254
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120142	NC_011004	GCC	2	6	5263531	5263536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293254
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120153	NC_011004	GAT	2	6	5263843	5263848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293254
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120219	NC_011004	CGATCG	2	12	5267692	5267703	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192293259
120220	NC_011004	CTT	2	6	5267756	5267761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293259
120221	NC_011004	GAA	2	6	5267768	5267773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293259
120222	NC_011004	GCA	2	6	5267800	5267805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293259
120223	NC_011004	TCT	2	6	5267830	5267835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293259
120224	NC_011004	CCA	3	9	5267866	5267874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293259
120225	NC_011004	AGC	2	6	5267913	5267918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293259
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120227	NC_011004	CCG	2	6	5267946	5267951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293260
120228	NC_011004	CCG	3	9	5267981	5267989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293260
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120258	NC_011004	CGG	2	6	5269093	5269098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293260
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