MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_011004	TCG	2	6	497915	497920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288893
11502	NC_011004	CGAGG	2	10	498024	498033	20 %	0 %	60 %	20 %	192288893
11503	NC_011004	CG	3	6	498108	498113	0 %	0 %	50 %	50 %	192288893
11504	NC_011004	CGA	2	6	498116	498121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288893
11505	NC_011004	GTT	2	6	498129	498134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288893
11506	NC_011004	TGT	2	6	498140	498145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288893
11507	NC_011004	GCGTCA	2	12	498149	498160	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288893
11508	NC_011004	GGT	2	6	498177	498182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288893
11509	NC_011004	TCG	2	6	498211	498216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288893
11510	NC_011004	GGC	2	6	498237	498242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288893
11511	NC_011004	CG	3	6	498259	498264	0 %	0 %	50 %	50 %	192288893
11512	NC_011004	TCG	2	6	498283	498288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288893
11513	NC_011004	CCG	2	6	498316	498321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288893
11514	NC_011004	GC	3	6	498365	498370	0 %	0 %	50 %	50 %	192288893
11515	NC_011004	GCG	2	6	498374	498379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288893
11516	NC_011004	GCG	2	6	498457	498462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288893
11517	NC_011004	GGC	3	9	498543	498551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288893
11518	NC_011004	TG	3	6	498556	498561	0 %	50 %	50 %	0 %	192288893
11519	NC_011004	CCGG	2	8	498572	498579	0 %	0 %	50 %	50 %	192288893
11520	NC_011004	CG	3	6	498655	498660	0 %	0 %	50 %	50 %	192288893
11521	NC_011004	CG	3	6	498735	498740	0 %	0 %	50 %	50 %	192288893
11522	NC_011004	AGC	2	6	498769	498774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288893
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11524	NC_011004	CTGC	2	8	498956	498963	0 %	25 %	25 %	50 %	192288894
11525	NC_011004	CGC	2	6	498989	498994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288894
11526	NC_011004	GCA	2	6	499040	499045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288894
11527	NC_011004	GATC	2	8	499082	499089	25 %	25 %	25 %	25 %	192288894
11528	NC_011004	TCT	2	6	499151	499156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288894
11529	NC_011004	CTT	2	6	499185	499190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288894
11530	NC_011004	CGT	2	6	499214	499219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288894
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11532	NC_011004	CAT	2	6	499284	499289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288894
11533	NC_011004	GTTGCC	2	12	499317	499328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288894
11534	NC_011004	TTG	2	6	499336	499341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288894
11535	NC_011004	ATC	2	6	499345	499350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288894
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11540	NC_011004	GAT	2	6	499547	499552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288894
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11542	NC_011004	GAT	2	6	499689	499694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288894
11543	NC_011004	TGCCG	2	10	499703	499712	0 %	20 %	40 %	40 %	192288894
11544	NC_011004	CGG	2	6	499760	499765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288894
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11549	NC_011004	CGA	2	6	499916	499921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288894
11550	NC_011004	TGC	2	6	499929	499934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288894
11551	NC_011004	GGT	2	6	499983	499988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288894
11552	NC_011004	CCT	2	6	500042	500047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288894
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11554	NC_011004	CGCT	2	8	500089	500096	0 %	25 %	25 %	50 %	192288894
11555	NC_011004	GATC	2	8	500114	500121	25 %	25 %	25 %	25 %	192288894
11556	NC_011004	TGC	2	6	500126	500131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288894
11557	NC_011004	GAT	2	6	500378	500383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288895
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11560	NC_011004	CG	3	6	500554	500559	0 %	0 %	50 %	50 %	192288895
11561	NC_011004	CGC	2	6	500577	500582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288895
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11602	NC_011004	CGG	3	9	502457	502465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288897
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11606	NC_011004	GCA	2	6	502744	502749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288897
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11608	NC_011004	TCC	2	6	502815	502820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288897
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11611	NC_011004	GTA	2	6	502868	502873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288897
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11615	NC_011004	CCGG	2	8	503136	503143	0 %	0 %	50 %	50 %	192288897
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11976	NC_011004	TCG	3	9	519702	519710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288911
11977	NC_011004	GGA	2	6	519838	519843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288911
11978	NC_011004	CGG	2	6	519847	519852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288911
11979	NC_011004	CGC	2	6	519892	519897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288911
11980	NC_011004	GGCT	2	8	519944	519951	0 %	25 %	50 %	25 %	192288911
11981	NC_011004	CGC	2	6	519970	519975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288911
11982	NC_011004	CG	4	8	520055	520062	0 %	0 %	50 %	50 %	192288911
11983	NC_011004	TTGGCG	2	12	520173	520184	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	192288911
11984	NC_011004	CGC	2	6	520242	520247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288911
11985	NC_011004	GCTGAT	2	12	520267	520278	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192288911
11986	NC_011004	GC	3	6	520311	520316	0 %	0 %	50 %	50 %	192288911
11987	NC_011004	GCT	2	6	520324	520329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288911
11988	NC_011004	AACG	2	8	520352	520359	50 %	0 %	25 %	25 %	192288911
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11997	NC_011004	CGA	2	6	520648	520653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288911
11998	NC_011004	TGG	2	6	520695	520700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288911
11999	NC_011004	GCG	2	6	520707	520712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288911
12000	NC_011004	TGA	2	6	520714	520719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288911

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