MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
117001	NC_011004	TGG	2	6	5125702	5125707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293120
117002	NC_011004	GCC	2	6	5125718	5125723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293120
117003	NC_011004	GAA	2	6	5125724	5125729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293120
117004	NC_011004	GCG	2	6	5125795	5125800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293120
117005	NC_011004	GCC	2	6	5125811	5125816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293120
117006	NC_011004	AGC	2	6	5125818	5125823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293120
117007	NC_011004	TGG	2	6	5125942	5125947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293120
117008	NC_011004	CCG	2	6	5125952	5125957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293120
117009	NC_011004	CGA	2	6	5126005	5126010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293120
117010	NC_011004	TCG	2	6	5126013	5126018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293120
117011	NC_011004	GGC	2	6	5126019	5126024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293120
117012	NC_011004	AGCCGC	2	12	5126025	5126036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192293120
117013	NC_011004	CGAC	2	8	5126128	5126135	25 %	0 %	25 %	50 %	192293120
117014	NC_011004	TCGG	2	8	5126172	5126179	0 %	25 %	50 %	25 %	192293120
117015	NC_011004	CAT	2	6	5126753	5126758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293121
117016	NC_011004	CTG	2	6	5126826	5126831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293121
117017	NC_011004	CCGA	2	8	5126931	5126938	25 %	0 %	25 %	50 %	192293121
117018	NC_011004	GCG	2	6	5126940	5126945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293121
117019	NC_011004	CG	3	6	5126951	5126956	0 %	0 %	50 %	50 %	192293121
117020	NC_011004	CGG	2	6	5126998	5127003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293121
117021	NC_011004	CGG	2	6	5127026	5127031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293121
117022	NC_011004	GGC	2	6	5127039	5127044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293121
117023	NC_011004	CGG	3	9	5127118	5127126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293121
117024	NC_011004	CTG	2	6	5127156	5127161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293121
117025	NC_011004	ACG	2	6	5127279	5127284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293121
117026	NC_011004	GGT	2	6	5127344	5127349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293121
117027	NC_011004	GCG	2	6	5127363	5127368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293121
117028	NC_011004	TCG	2	6	5127382	5127387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293121
117029	NC_011004	GCC	2	6	5127395	5127400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293121
117030	NC_011004	ACCA	2	8	5127426	5127433	50 %	0 %	0 %	50 %	192293121
117031	NC_011004	ACGCTC	2	12	5127507	5127518	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	192293121
117032	NC_011004	GCG	2	6	5127544	5127549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293121
117033	NC_011004	GAT	2	6	5127551	5127556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293121
117034	NC_011004	AGC	2	6	5127666	5127671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293121
117035	NC_011004	GCA	2	6	5127748	5127753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293121
117036	NC_011004	ATG	2	6	5127765	5127770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293121
117037	NC_011004	GTC	2	6	5127813	5127818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293121
117038	NC_011004	CGC	2	6	5127893	5127898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293121
117039	NC_011004	TGA	2	6	5128114	5128119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293122
117040	NC_011004	CGC	2	6	5128224	5128229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293122
117041	NC_011004	AAC	2	6	5128230	5128235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293122
117042	NC_011004	CTT	2	6	5128277	5128282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293122
117043	NC_011004	CG	3	6	5128303	5128308	0 %	0 %	50 %	50 %	192293122
117044	NC_011004	CAA	2	6	5128355	5128360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293122
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117047	NC_011004	CGA	2	6	5128490	5128495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293122
117048	NC_011004	ACG	2	6	5128537	5128542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293122
117049	NC_011004	GCG	2	6	5128648	5128653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293123
117050	NC_011004	CGGC	2	8	5128666	5128673	0 %	0 %	50 %	50 %	192293123
117051	NC_011004	GCG	2	6	5128681	5128686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293123
117052	NC_011004	TCA	2	6	5128688	5128693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293123
117053	NC_011004	CG	3	6	5128699	5128704	0 %	0 %	50 %	50 %	192293123
117054	NC_011004	GCCG	2	8	5128742	5128749	0 %	0 %	50 %	50 %	192293123
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117056	NC_011004	TGC	2	6	5128784	5128789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293123
117057	NC_011004	CAG	2	6	5128806	5128811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293123
117058	NC_011004	GCC	2	6	5128841	5128846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293123
117059	NC_011004	CGGT	2	8	5128897	5128904	0 %	25 %	50 %	25 %	192293123
117060	NC_011004	GCG	2	6	5128923	5128928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293123
117061	NC_011004	GTCG	2	8	5128935	5128942	0 %	25 %	50 %	25 %	192293123
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117067	NC_011004	CGC	3	9	5129262	5129270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293123
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117072	NC_011004	CTG	2	6	5129367	5129372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293123
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117089	NC_011004	AAG	2	6	5130110	5130115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293124
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117099	NC_011004	CG	3	6	5130725	5130730	0 %	0 %	50 %	50 %	192293125
117100	NC_011004	TTC	2	6	5130788	5130793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293125
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117103	NC_011004	CGG	3	9	5130982	5130990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293126
117104	NC_011004	TGGA	2	8	5131001	5131008	25 %	25 %	50 %	0 %	192293126
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117107	NC_011004	CTCGC	2	10	5131070	5131079	0 %	20 %	20 %	60 %	192293126
117108	NC_011004	CG	4	8	5131092	5131099	0 %	0 %	50 %	50 %	192293126
117109	NC_011004	TAC	2	6	5131178	5131183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293126
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117111	NC_011004	GCT	2	6	5131258	5131263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293126
117112	NC_011004	GCG	2	6	5131295	5131300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293126
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117114	NC_011004	TCG	2	6	5131338	5131343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293126
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117343	NC_011004	CCGC	2	8	5142590	5142597	0 %	0 %	25 %	75 %	192293139
117344	NC_011004	CTG	2	6	5142638	5142643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293139
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