MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011004	GCA	2	6	476042	476047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288872
11002	NC_011004	GCG	2	6	476099	476104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288872
11003	NC_011004	TCG	2	6	476138	476143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288872
11004	NC_011004	CGG	2	6	476181	476186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288872
11005	NC_011004	ACC	2	6	476261	476266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288872
11006	NC_011004	GGCC	2	8	476268	476275	0 %	0 %	50 %	50 %	192288872
11007	NC_011004	GGC	2	6	476278	476283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288872
11008	NC_011004	GC	3	6	476308	476313	0 %	0 %	50 %	50 %	192288872
11009	NC_011004	CAG	2	6	476314	476319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288872
11010	NC_011004	CCG	2	6	476343	476348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288872
11011	NC_011004	CGG	2	6	476387	476392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288872
11012	NC_011004	CCGG	2	8	476480	476487	0 %	0 %	50 %	50 %	192288872
11013	NC_011004	ACCA	2	8	476488	476495	50 %	0 %	0 %	50 %	192288872
11014	NC_011004	CGT	2	6	476580	476585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288872
11015	NC_011004	GCA	2	6	476606	476611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288872
11016	NC_011004	CCG	2	6	476683	476688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288873
11017	NC_011004	TCG	2	6	476691	476696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288873
11018	NC_011004	TTC	3	9	476714	476722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288873
11019	NC_011004	TCG	2	6	476739	476744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288873
11020	NC_011004	CG	3	6	476794	476799	0 %	0 %	50 %	50 %	192288873
11021	NC_011004	TCG	2	6	476877	476882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288873
11022	NC_011004	CGT	2	6	476917	476922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288873
11023	NC_011004	CGG	3	9	477061	477069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288873
11024	NC_011004	TCG	2	6	477075	477080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288873
11025	NC_011004	TCGA	2	8	477087	477094	25 %	25 %	25 %	25 %	192288873
11026	NC_011004	CG	3	6	477103	477108	0 %	0 %	50 %	50 %	192288873
11027	NC_011004	TTC	2	6	477125	477130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288873
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11029	NC_011004	CGA	2	6	477166	477171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288873
11030	NC_011004	TCG	2	6	477174	477179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288873
11031	NC_011004	TCT	2	6	477211	477216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288873
11032	NC_011004	GGC	2	6	477229	477234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288873
11033	NC_011004	GATGTC	2	12	477260	477271	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192288873
11034	NC_011004	TCG	2	6	477381	477386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288873
11035	NC_011004	CGGC	2	8	477406	477413	0 %	0 %	50 %	50 %	192288873
11036	NC_011004	ATG	2	6	477459	477464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288873
11037	NC_011004	TCT	2	6	477469	477474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288873
11038	NC_011004	GTTC	2	8	477484	477491	0 %	50 %	25 %	25 %	192288873
11039	NC_011004	ACC	2	6	477492	477497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288873
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11041	NC_011004	GAG	2	6	477549	477554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288873
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11044	NC_011004	CGA	2	6	477616	477621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288873
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11049	NC_011004	CGG	2	6	477789	477794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288873
11050	NC_011004	CGC	2	6	477805	477810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288873
11051	NC_011004	CGA	2	6	477820	477825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288873
11052	NC_011004	GAC	2	6	477851	477856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288873
11053	NC_011004	GCG	2	6	477957	477962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288873
11054	NC_011004	GCG	2	6	477979	477984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288873
11055	NC_011004	GC	3	6	478015	478020	0 %	0 %	50 %	50 %	192288873
11056	NC_011004	GC	3	6	478029	478034	0 %	0 %	50 %	50 %	192288873
11057	NC_011004	ACC	2	6	478083	478088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288873
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11060	NC_011004	CGC	2	6	478199	478204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288873
11061	NC_011004	TGC	2	6	478213	478218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288873
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11064	NC_011004	CGG	2	6	478338	478343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288874
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11067	NC_011004	GCG	3	9	478452	478460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288874
11068	NC_011004	GCCGC	2	10	478510	478519	0 %	0 %	40 %	60 %	192288874
11069	NC_011004	TCG	2	6	478538	478543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288874
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11072	NC_011004	GAG	2	6	478775	478780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288874
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11089	NC_011004	CGC	3	9	479968	479976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288875
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11092	NC_011004	GAG	2	6	480213	480218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288875
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11111	NC_011004	CGCC	2	8	481196	481203	0 %	0 %	25 %	75 %	192288876
11112	NC_011004	GCA	2	6	481244	481249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288876
11113	NC_011004	CGG	2	6	481299	481304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288876
11114	NC_011004	CGATC	2	10	481364	481373	20 %	20 %	20 %	40 %	192288876
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11116	NC_011004	GC	4	8	481610	481617	0 %	0 %	50 %	50 %	192288877
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11118	NC_011004	CGC	2	6	481704	481709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288877
11119	NC_011004	CGC	2	6	481747	481752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288877
11120	NC_011004	GGAT	2	8	481768	481775	25 %	25 %	50 %	0 %	192288877
11121	NC_011004	GCCG	2	8	481797	481804	0 %	0 %	50 %	50 %	192288877
11122	NC_011004	CAG	2	6	481815	481820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288877
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11124	NC_011004	GCA	2	6	482072	482077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288877
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11236	NC_011004	GAT	2	6	486570	486575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288882
11237	NC_011004	CGC	2	6	486576	486581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288882
11238	NC_011004	G	6	6	486614	486619	0 %	0 %	100 %	0 %	192288882
11239	NC_011004	CGATTT	2	12	486620	486631	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	192288882
11240	NC_011004	GC	4	8	486644	486651	0 %	0 %	50 %	50 %	192288882
11241	NC_011004	CGA	2	6	486653	486658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288882
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11243	NC_011004	GTAA	2	8	486701	486708	50 %	25 %	25 %	0 %	192288882
11244	NC_011004	AGCCG	2	10	486743	486752	20 %	0 %	40 %	40 %	192288882
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11250	NC_011004	GCG	2	6	486919	486924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288882
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11254	NC_011004	CCA	3	9	487166	487174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288882
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11263	NC_011004	GCA	2	6	487454	487459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288883
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