MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
113001	NC_011004	CG	3	6	4944572	4944577	0 %	0 %	50 %	50 %	192292951
113002	NC_011004	GCCCT	2	10	4944585	4944594	0 %	20 %	20 %	60 %	192292951
113003	NC_011004	CCG	2	6	4944595	4944600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292951
113004	NC_011004	CGAT	2	8	4944655	4944662	25 %	25 %	25 %	25 %	192292951
113005	NC_011004	CGC	3	9	4944700	4944708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292951
113006	NC_011004	GTTT	2	8	4944718	4944725	0 %	75 %	25 %	0 %	192292951
113007	NC_011004	CTG	2	6	4944774	4944779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292951
113008	NC_011004	CAT	2	6	4944788	4944793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192292951
113009	NC_011004	CGT	2	6	4944809	4944814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292951
113010	NC_011004	GTG	2	6	4944900	4944905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192292951
113011	NC_011004	CGG	2	6	4944914	4944919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292951
113012	NC_011004	CGC	2	6	4945046	4945051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292951
113013	NC_011004	CGT	2	6	4945079	4945084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292951
113014	NC_011004	GGC	2	6	4945095	4945100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292951
113015	NC_011004	GGT	2	6	4945126	4945131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192292951
113016	NC_011004	CTGG	2	8	4945268	4945275	0 %	25 %	50 %	25 %	192292951
113017	NC_011004	GCC	2	6	4945348	4945353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292951
113018	NC_011004	TGC	2	6	4945378	4945383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292951
113019	NC_011004	GC	3	6	4945389	4945394	0 %	0 %	50 %	50 %	192292951
113020	NC_011004	GACG	2	8	4945415	4945422	25 %	0 %	50 %	25 %	192292951
113021	NC_011004	GAT	2	6	4945436	4945441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192292951
113022	NC_011004	CGC	2	6	4945477	4945482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292951
113023	NC_011004	GTC	2	6	4945500	4945505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292951
113024	NC_011004	GAG	2	6	4945512	4945517	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192292951
113025	NC_011004	TGTTC	2	10	4945520	4945529	0 %	60 %	20 %	20 %	192292951
113026	NC_011004	GAC	2	6	4945584	4945589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192292951
113027	NC_011004	CAA	2	6	4945613	4945618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192292951
113028	NC_011004	CGA	2	6	4945631	4945636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192292951
113029	NC_011004	ACCGCG	2	12	4945645	4945656	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192292951
113030	NC_011004	TAC	2	6	4945677	4945682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192292951
113031	NC_011004	GGC	2	6	4945715	4945720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292951
113032	NC_011004	CGA	2	6	4945810	4945815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192292952
113033	NC_011004	CGGCG	2	10	4945858	4945867	0 %	0 %	60 %	40 %	192292952
113034	NC_011004	TCG	3	9	4945965	4945973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292952
113035	NC_011004	TAC	2	6	4946012	4946017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192292952
113036	NC_011004	TCGA	2	8	4946045	4946052	25 %	25 %	25 %	25 %	192292952
113037	NC_011004	CTT	2	6	4946107	4946112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192292952
113038	NC_011004	TCG	2	6	4946151	4946156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292952
113039	NC_011004	GCC	3	9	4946174	4946182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292952
113040	NC_011004	GC	6	12	4946189	4946200	0 %	0 %	50 %	50 %	192292952
113041	NC_011004	CCA	2	6	4946203	4946208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192292952
113042	NC_011004	CGT	2	6	4946269	4946274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292952
113043	NC_011004	GGCA	2	8	4946396	4946403	25 %	0 %	50 %	25 %	192292952
113044	NC_011004	GCC	2	6	4946425	4946430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292952
113045	NC_011004	TCACG	2	10	4946434	4946443	20 %	20 %	20 %	40 %	192292952
113046	NC_011004	GGC	2	6	4946455	4946460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292952
113047	NC_011004	CGC	2	6	4946467	4946472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292952
113048	NC_011004	CGA	2	6	4946550	4946555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192292952
113049	NC_011004	TCG	2	6	4946583	4946588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292952
113050	NC_011004	CGG	2	6	4946617	4946622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292952
113051	NC_011004	TGGC	2	8	4946636	4946643	0 %	25 %	50 %	25 %	192292952
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113053	NC_011004	CGG	2	6	4946686	4946691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292952
113054	NC_011004	CG	3	6	4946710	4946715	0 %	0 %	50 %	50 %	192292952
113055	NC_011004	AGCC	2	8	4946722	4946729	25 %	0 %	25 %	50 %	192292952
113056	NC_011004	CGC	2	6	4946737	4946742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292952
113057	NC_011004	GACGC	2	10	4946748	4946757	20 %	0 %	40 %	40 %	192292952
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113059	NC_011004	GGC	3	9	4946833	4946841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292952
113060	NC_011004	GTCG	2	8	4946884	4946891	0 %	25 %	50 %	25 %	192292952
113061	NC_011004	CCG	2	6	4946922	4946927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292952
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113064	NC_011004	CG	4	8	4947072	4947079	0 %	0 %	50 %	50 %	192292952
113065	NC_011004	GCC	2	6	4947147	4947152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292953
113066	NC_011004	GCTC	2	8	4947161	4947168	0 %	25 %	25 %	50 %	192292953
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113068	NC_011004	CTG	2	6	4947192	4947197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292953
113069	NC_011004	GTTCTT	2	12	4947323	4947334	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	192292953
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113072	NC_011004	GC	3	6	4947367	4947372	0 %	0 %	50 %	50 %	192292953
113073	NC_011004	CAA	2	6	4947383	4947388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192292953
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113081	NC_011004	CTG	2	6	4947555	4947560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292953
113082	NC_011004	CTG	2	6	4947573	4947578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292953
113083	NC_011004	TGA	2	6	4947592	4947597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192292953
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113085	NC_011004	TGC	2	6	4947637	4947642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292953
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113097	NC_011004	ATC	2	6	4948364	4948369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192292954
113098	NC_011004	TCG	2	6	4948482	4948487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292954
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113100	NC_011004	CG	3	6	4948552	4948557	0 %	0 %	50 %	50 %	192292954
113101	NC_011004	GCG	2	6	4948560	4948565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292954
113102	NC_011004	TG	3	6	4948611	4948616	0 %	50 %	50 %	0 %	192292954
113103	NC_011004	TGGA	2	8	4948653	4948660	25 %	25 %	50 %	0 %	192292954
113104	NC_011004	TCG	2	6	4948671	4948676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292954
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113107	NC_011004	CGA	2	6	4948755	4948760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192292954
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113112	NC_011004	CGC	2	6	4948987	4948992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292954
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113484	NC_011004	GTC	2	6	4968883	4968888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292969
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