MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
112501	NC_011004	CAT	2	6	4921629	4921634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192292934
112502	NC_011004	CTA	2	6	4921644	4921649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192292934
112503	NC_011004	CCA	2	6	4921680	4921685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192292934
112504	NC_011004	TTC	2	6	4921756	4921761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192292934
112505	NC_011004	GCC	2	6	4921788	4921793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292934
112506	NC_011004	TGC	2	6	4921823	4921828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292934
112507	NC_011004	GGC	2	6	4921831	4921836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292934
112508	NC_011004	TGA	2	6	4921880	4921885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192292934
112509	NC_011004	CG	3	6	4921908	4921913	0 %	0 %	50 %	50 %	192292934
112510	NC_011004	TCG	2	6	4921922	4921927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292934
112511	NC_011004	CTG	2	6	4921942	4921947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292934
112512	NC_011004	GCC	2	6	4921948	4921953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292934
112513	NC_011004	GCGGTG	2	12	4921954	4921965	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	192292934
112514	NC_011004	CCG	2	6	4921973	4921978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292934
112515	NC_011004	TCC	2	6	4921991	4921996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192292934
112516	NC_011004	GC	3	6	4922067	4922072	0 %	0 %	50 %	50 %	192292934
112517	NC_011004	AAGCC	2	10	4922075	4922084	40 %	0 %	20 %	40 %	192292934
112518	NC_011004	GGC	2	6	4922102	4922107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292934
112519	NC_011004	GTT	2	6	4922130	4922135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192292934
112520	NC_011004	GCT	2	6	4922160	4922165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292934
112521	NC_011004	CGC	2	6	4922171	4922176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292934
112522	NC_011004	GCG	2	6	4922239	4922244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292934
112523	NC_011004	CCG	2	6	4922273	4922278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292934
112524	NC_011004	CGCTG	2	10	4922298	4922307	0 %	20 %	40 %	40 %	192292934
112525	NC_011004	CCG	2	6	4922386	4922391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292934
112526	NC_011004	GAC	2	6	4922400	4922405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192292934
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112528	NC_011004	TGG	2	6	4922431	4922436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192292934
112529	NC_011004	CCGCG	2	10	4922457	4922466	0 %	0 %	40 %	60 %	192292934
112530	NC_011004	GCC	2	6	4922485	4922490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292934
112531	NC_011004	CTG	2	6	4922539	4922544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292934
112532	NC_011004	CAA	2	6	4922586	4922591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192292934
112533	NC_011004	TGGC	2	8	4922671	4922678	0 %	25 %	50 %	25 %	192292934
112534	NC_011004	GCA	2	6	4922796	4922801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192292934
112535	NC_011004	GCT	2	6	4922868	4922873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292934
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112537	NC_011004	CCA	2	6	4922933	4922938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192292934
112538	NC_011004	TGC	2	6	4922939	4922944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292934
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112540	NC_011004	GC	3	6	4923059	4923064	0 %	0 %	50 %	50 %	192292934
112541	NC_011004	CG	3	6	4923179	4923184	0 %	0 %	50 %	50 %	192292934
112542	NC_011004	TGA	2	6	4923200	4923205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192292934
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112545	NC_011004	ATC	2	6	4923244	4923249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192292934
112546	NC_011004	CGA	2	6	4923267	4923272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192292934
112547	NC_011004	TCG	2	6	4923314	4923319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292934
112548	NC_011004	GCA	2	6	4923350	4923355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192292934
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112550	NC_011004	TGC	2	6	4923630	4923635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192292935
112551	NC_011004	GCCG	2	8	4923663	4923670	0 %	0 %	50 %	50 %	192292935
112552	NC_011004	GGA	2	6	4923678	4923683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192292935
112553	NC_011004	CGG	2	6	4923733	4923738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192292935
112554	NC_011004	CG	3	6	4923743	4923748	0 %	0 %	50 %	50 %	192292935
112555	NC_011004	CG	3	6	4923917	4923922	0 %	0 %	50 %	50 %	192292935
112556	NC_011004	GTT	2	6	4923958	4923963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192292935
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112565	NC_011004	CGA	2	6	4924219	4924224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192292935
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112568	NC_011004	GGT	2	6	4924306	4924311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192292935
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112573	NC_011004	GC	3	6	4924432	4924437	0 %	0 %	50 %	50 %	192292935
112574	NC_011004	CGA	2	6	4924474	4924479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192292935
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112587	NC_011004	CGACG	2	10	4925061	4925070	20 %	0 %	40 %	40 %	192292936
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112599	NC_011004	CGGCT	2	10	4925530	4925539	0 %	20 %	40 %	40 %	192292936
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112609	NC_011004	CGC	2	6	4925951	4925956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192292936
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