MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011004	GCT	2	6	453367	453372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288853
10502	NC_011004	GC	3	6	453385	453390	0 %	0 %	50 %	50 %	192288853
10503	NC_011004	GCC	2	6	453412	453417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288853
10504	NC_011004	CGG	2	6	453453	453458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288853
10505	NC_011004	CCG	2	6	453492	453497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288853
10506	NC_011004	TCG	2	6	453519	453524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288853
10507	NC_011004	CGGC	2	8	453554	453561	0 %	0 %	50 %	50 %	192288853
10508	NC_011004	GCGCA	2	10	453587	453596	20 %	0 %	40 %	40 %	192288853
10509	NC_011004	CCGG	2	8	453605	453612	0 %	0 %	50 %	50 %	192288853
10510	NC_011004	GCA	2	6	453631	453636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288853
10511	NC_011004	TCAG	2	8	453705	453712	25 %	25 %	25 %	25 %	192288853
10512	NC_011004	GCG	3	9	453848	453856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288854
10513	NC_011004	CGG	2	6	453874	453879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288854
10514	NC_011004	CG	3	6	453892	453897	0 %	0 %	50 %	50 %	192288854
10515	NC_011004	GCA	2	6	453907	453912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288854
10516	NC_011004	GCA	2	6	453943	453948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288854
10517	NC_011004	TTG	2	6	453957	453962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288854
10518	NC_011004	TCA	2	6	453964	453969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288854
10519	NC_011004	CGG	2	6	453997	454002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288854
10520	NC_011004	CCGGG	2	10	454072	454081	0 %	0 %	60 %	40 %	192288854
10521	NC_011004	GTA	2	6	454166	454171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288854
10522	NC_011004	GCCGGG	2	12	454181	454192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288854
10523	NC_011004	GCC	2	6	454226	454231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288854
10524	NC_011004	GAT	2	6	454298	454303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288854
10525	NC_011004	GTT	2	6	454361	454366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288854
10526	NC_011004	CTCGAC	2	12	454376	454387	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	192288854
10527	NC_011004	GAT	2	6	454409	454414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288854
10528	NC_011004	GCC	2	6	454491	454496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288854
10529	NC_011004	CGC	2	6	454518	454523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288854
10530	NC_011004	CCA	2	6	454525	454530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288854
10531	NC_011004	GGC	2	6	454858	454863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288855
10532	NC_011004	GC	3	6	454946	454951	0 %	0 %	50 %	50 %	192288855
10533	NC_011004	CAC	2	6	454954	454959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288855
10534	NC_011004	CAT	2	6	455008	455013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288855
10535	NC_011004	CGA	2	6	455016	455021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288855
10536	NC_011004	AATG	2	8	455165	455172	50 %	25 %	25 %	0 %	192288855
10537	NC_011004	GCTTTT	2	12	455175	455186	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	192288855
10538	NC_011004	ATCG	2	8	455206	455213	25 %	25 %	25 %	25 %	192288855
10539	NC_011004	CAG	2	6	455227	455232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288855
10540	NC_011004	GGC	2	6	455239	455244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288855
10541	NC_011004	GCC	2	6	455254	455259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288855
10542	NC_011004	GTC	2	6	455260	455265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288855
10543	NC_011004	CGA	2	6	455295	455300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288855
10544	NC_011004	TGA	2	6	455307	455312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288855
10545	NC_011004	GCGA	2	8	455497	455504	25 %	0 %	50 %	25 %	192288856
10546	NC_011004	GTG	2	6	455514	455519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288856
10547	NC_011004	CGA	2	6	455575	455580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288856
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10549	NC_011004	GCA	2	6	455749	455754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288856
10550	NC_011004	CGT	2	6	455776	455781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288856
10551	NC_011004	GCT	2	6	455820	455825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288856
10552	NC_011004	TCG	2	6	455868	455873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288856
10553	NC_011004	CAG	2	6	455975	455980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288856
10554	NC_011004	GGCC	2	8	456019	456026	0 %	0 %	50 %	50 %	192288856
10555	NC_011004	TGG	2	6	456034	456039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288856
10556	NC_011004	GCC	2	6	456096	456101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288856
10557	NC_011004	CG	3	6	456121	456126	0 %	0 %	50 %	50 %	192288856
10558	NC_011004	GCCG	2	8	456146	456153	0 %	0 %	50 %	50 %	192288856
10559	NC_011004	CGCGC	2	10	456154	456163	0 %	0 %	40 %	60 %	192288856
10560	NC_011004	GC	4	8	456208	456215	0 %	0 %	50 %	50 %	192288856
10561	NC_011004	GCA	3	9	456247	456255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288856
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10563	NC_011004	CGTC	2	8	456442	456449	0 %	25 %	25 %	50 %	192288856
10564	NC_011004	CAG	2	6	456545	456550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288856
10565	NC_011004	GCA	2	6	456574	456579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288856
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10570	NC_011004	GA	3	6	456771	456776	50 %	0 %	50 %	0 %	192288856
10571	NC_011004	CGG	2	6	456800	456805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288856
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10583	NC_011004	GCC	2	6	457288	457293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288857
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10589	NC_011004	GAT	2	6	457505	457510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288857
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10595	NC_011004	CGG	2	6	457789	457794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288857
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10598	NC_011004	GCT	2	6	457852	457857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288857
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10601	NC_011004	TCGA	2	8	457920	457927	25 %	25 %	25 %	25 %	192288857
10602	NC_011004	GAC	3	9	457946	457954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288857
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10607	NC_011004	CGC	2	6	458516	458521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288858
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10614	NC_011004	ACG	3	9	458867	458875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288859
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10977	NC_011004	CTT	2	6	475329	475334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288871
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10979	NC_011004	CGG	2	6	475409	475414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288871
10980	NC_011004	CGGCG	2	10	475448	475457	0 %	0 %	60 %	40 %	192288871
10981	NC_011004	GCGG	2	8	475527	475534	0 %	0 %	75 %	25 %	192288871
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10984	NC_011004	CTG	3	9	475602	475610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288871
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10999	NC_011004	CGT	2	6	475965	475970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288872
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