MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_011004	ATC	2	6	321953	321958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288730
7502	NC_011004	AGA	2	6	321959	321964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288730
7503	NC_011004	ATA	2	6	321980	321985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	192288730
7504	NC_011004	CGG	2	6	322017	322022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288730
7505	NC_011004	AGC	2	6	322046	322051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288730
7506	NC_011004	TCA	2	6	322065	322070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288730
7507	NC_011004	CCA	2	6	322155	322160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288730
7508	NC_011004	CGG	2	6	322239	322244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288730
7509	NC_011004	CCA	2	6	322305	322310	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288730
7510	NC_011004	AGC	2	6	322956	322961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288731
7511	NC_011004	TGC	2	6	322971	322976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288731
7512	NC_011004	GAA	2	6	322985	322990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288731
7513	NC_011004	GCT	2	6	323014	323019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288731
7514	NC_011004	CGAAG	2	10	323044	323053	40 %	0 %	40 %	20 %	192288731
7515	NC_011004	GTT	2	6	323104	323109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288731
7516	NC_011004	CGA	2	6	323130	323135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288731
7517	NC_011004	GCA	2	6	323152	323157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288731
7518	NC_011004	ACT	2	6	323199	323204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288731
7519	NC_011004	GAT	2	6	323206	323211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288731
7520	NC_011004	ACG	3	9	323214	323222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288731
7521	NC_011004	GAA	2	6	323243	323248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288731
7522	NC_011004	GTG	2	6	323255	323260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288731
7523	NC_011004	ATCT	2	8	323300	323307	25 %	50 %	0 %	25 %	192288731
7524	NC_011004	ATTCCG	2	12	323354	323365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	192288731
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7526	NC_011004	TGG	2	6	323394	323399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288731
7527	NC_011004	TGC	2	6	323517	323522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288731
7528	NC_011004	GCT	2	6	323557	323562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288731
7529	NC_011004	CGG	2	6	323573	323578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288731
7530	NC_011004	TCGA	2	8	323579	323586	25 %	25 %	25 %	25 %	192288731
7531	NC_011004	CTG	2	6	323592	323597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288731
7532	NC_011004	CGA	2	6	323757	323762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288732
7533	NC_011004	GC	3	6	323792	323797	0 %	0 %	50 %	50 %	192288732
7534	NC_011004	GCA	2	6	323823	323828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288732
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7541	NC_011004	CGG	2	6	323987	323992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288732
7542	NC_011004	CG	3	6	324039	324044	0 %	0 %	50 %	50 %	192288732
7543	NC_011004	GTC	2	6	324094	324099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288732
7544	NC_011004	CCA	3	9	324110	324118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288732
7545	NC_011004	CTG	2	6	324241	324246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288732
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7550	NC_011004	CGG	2	6	324519	324524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288733
7551	NC_011004	CG	3	6	324535	324540	0 %	0 %	50 %	50 %	192288733
7552	NC_011004	CTG	2	6	324541	324546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288733
7553	NC_011004	GGT	2	6	324555	324560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288733
7554	NC_011004	TGC	2	6	324608	324613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288733
7555	NC_011004	GC	3	6	324612	324617	0 %	0 %	50 %	50 %	192288733
7556	NC_011004	TCA	2	6	324618	324623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288733
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7558	NC_011004	CGA	2	6	324636	324641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288733
7559	NC_011004	ATC	2	6	324648	324653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288733
7560	NC_011004	GC	3	6	324656	324661	0 %	0 %	50 %	50 %	192288733
7561	NC_011004	GCT	2	6	324684	324689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288733
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7563	NC_011004	GTC	2	6	324724	324729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288733
7564	NC_011004	GTG	2	6	324730	324735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288733
7565	NC_011004	CGAA	2	8	324759	324766	50 %	0 %	25 %	25 %	192288733
7566	NC_011004	CG	4	8	324771	324778	0 %	0 %	50 %	50 %	192288733
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7569	NC_011004	GTG	2	6	324859	324864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288733
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7571	NC_011004	CGG	2	6	324937	324942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288733
7572	NC_011004	ACC	2	6	325014	325019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288734
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7588	NC_011004	GCG	2	6	325845	325850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288735
7589	NC_011004	CCG	2	6	325856	325861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288735
7590	NC_011004	CGCAC	2	10	325865	325874	20 %	0 %	20 %	60 %	192288735
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7595	NC_011004	GTT	2	6	326071	326076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288735
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7603	NC_011004	GTG	2	6	326909	326914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288736
7604	NC_011004	TCG	2	6	326996	327001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288736
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7606	NC_011004	GAT	2	6	327046	327051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288736
7607	NC_011004	TCG	2	6	327076	327081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288736
7608	NC_011004	CTG	2	6	327095	327100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288736
7609	NC_011004	CGAG	2	8	327102	327109	25 %	0 %	50 %	25 %	192288736
7610	NC_011004	TCGA	2	8	327182	327189	25 %	25 %	25 %	25 %	192288736
7611	NC_011004	GAT	2	6	327259	327264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288736
7612	NC_011004	GGT	2	6	327292	327297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288736
7613	NC_011004	CG	3	6	327363	327368	0 %	0 %	50 %	50 %	192288736
7614	NC_011004	GC	4	8	327418	327425	0 %	0 %	50 %	50 %	192288737
7615	NC_011004	CGC	2	6	327428	327433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288737
7616	NC_011004	CTGT	2	8	327465	327472	0 %	50 %	25 %	25 %	192288737
7617	NC_011004	GC	3	6	327489	327494	0 %	0 %	50 %	50 %	192288737
7618	NC_011004	GGC	2	6	327588	327593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288737
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7620	NC_011004	GTC	2	6	327679	327684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288737
7621	NC_011004	GGC	2	6	327692	327697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288737
7622	NC_011004	CGAC	2	8	327712	327719	25 %	0 %	25 %	50 %	192288737
7623	NC_011004	CGG	2	6	327728	327733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288737
7624	NC_011004	GCG	2	6	327756	327761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288737
7625	NC_011004	GAC	2	6	327776	327781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288737
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7647	NC_011004	CG	4	8	328676	328683	0 %	0 %	50 %	50 %	192288737
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7652	NC_011004	CCG	2	6	328901	328906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288738
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7984	NC_011004	CCA	2	6	342578	342583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288753
7985	NC_011004	CCA	2	6	342594	342599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288753
7986	NC_011004	GCC	2	6	342658	342663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288753
7987	NC_011004	GC	3	6	342679	342684	0 %	0 %	50 %	50 %	192288753
7988	NC_011004	GCC	2	6	342687	342692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288753
7989	NC_011004	CGC	2	6	342698	342703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288753
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