MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011004	CGC	2	6	299464	299469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288712
7002	NC_011004	CG	3	6	299479	299484	0 %	0 %	50 %	50 %	192288712
7003	NC_011004	GCG	2	6	299549	299554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288712
7004	NC_011004	CGC	2	6	299563	299568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288712
7005	NC_011004	CGA	2	6	299635	299640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288712
7006	NC_011004	ATCT	2	8	299666	299673	25 %	50 %	0 %	25 %	192288712
7007	NC_011004	CG	3	6	299709	299714	0 %	0 %	50 %	50 %	192288712
7008	NC_011004	AGC	2	6	299733	299738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288712
7009	NC_011004	CGA	2	6	299770	299775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288712
7010	NC_011004	CGT	3	9	299848	299856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288712
7011	NC_011004	TCG	2	6	299907	299912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288712
7012	NC_011004	GCA	2	6	299986	299991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288712
7013	NC_011004	CGC	2	6	300001	300006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288712
7014	NC_011004	CGG	2	6	300038	300043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288712
7015	NC_011004	CGG	2	6	300112	300117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288712
7016	NC_011004	GGC	2	6	300149	300154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288712
7017	NC_011004	CGG	2	6	300187	300192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288712
7018	NC_011004	GTG	2	6	300200	300205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288712
7019	NC_011004	GCA	2	6	300240	300245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288712
7020	NC_011004	ACC	2	6	300293	300298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288712
7021	NC_011004	GAT	2	6	300333	300338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288712
7022	NC_011004	GCC	2	6	300398	300403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288713
7023	NC_011004	GC	3	6	300423	300428	0 %	0 %	50 %	50 %	192288713
7024	NC_011004	CGGCTT	2	12	300446	300457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288713
7025	NC_011004	CGC	2	6	300467	300472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288713
7026	NC_011004	GCCAC	2	10	300523	300532	20 %	0 %	20 %	60 %	192288713
7027	NC_011004	TTG	2	6	300621	300626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288713
7028	NC_011004	ACC	2	6	300661	300666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288713
7029	NC_011004	CGC	2	6	300722	300727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288713
7030	NC_011004	TCG	2	6	300738	300743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288713
7031	NC_011004	CGG	2	6	300782	300787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288713
7032	NC_011004	CGG	2	6	300905	300910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288713
7033	NC_011004	CG	3	6	300919	300924	0 %	0 %	50 %	50 %	192288713
7034	NC_011004	CGAAGA	2	12	300968	300979	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	192288713
7035	NC_011004	GGCT	2	8	301008	301015	0 %	25 %	50 %	25 %	192288713
7036	NC_011004	TGCA	2	8	301018	301025	25 %	25 %	25 %	25 %	192288713
7037	NC_011004	CTG	2	6	301026	301031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288713
7038	NC_011004	GGC	2	6	301051	301056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288713
7039	NC_011004	CAG	2	6	301085	301090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288713
7040	NC_011004	CGG	2	6	301139	301144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288713
7041	NC_011004	CGC	2	6	301153	301158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288713
7042	NC_011004	CAC	2	6	301179	301184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288713
7043	NC_011004	GAC	2	6	301185	301190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288713
7044	NC_011004	GAC	2	6	301227	301232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288713
7045	NC_011004	GAG	2	6	301233	301238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288713
7046	NC_011004	CG	3	6	301257	301262	0 %	0 %	50 %	50 %	192288713
7047	NC_011004	AAG	2	6	301269	301274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288713
7048	NC_011004	AAG	2	6	301296	301301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288713
7049	NC_011004	CG	4	8	301393	301400	0 %	0 %	50 %	50 %	192288713
7050	NC_011004	TGC	2	6	301411	301416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288713
7051	NC_011004	GCG	2	6	301432	301437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288713
7052	NC_011004	ATC	2	6	301440	301445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288713
7053	NC_011004	GGT	2	6	301463	301468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288713
7054	NC_011004	TCG	2	6	301506	301511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288713
7055	NC_011004	CG	3	6	301510	301515	0 %	0 %	50 %	50 %	192288713
7056	NC_011004	TC	3	6	301523	301528	0 %	50 %	0 %	50 %	192288713
7057	NC_011004	CGA	2	6	301529	301534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288713
7058	NC_011004	GC	3	6	301552	301557	0 %	0 %	50 %	50 %	192288713
7059	NC_011004	GC	3	6	301563	301568	0 %	0 %	50 %	50 %	192288713
7060	NC_011004	GTG	2	6	301575	301580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288713
7061	NC_011004	CGG	2	6	301712	301717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288713
7062	NC_011004	ATC	2	6	301725	301730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288713
7063	NC_011004	CTG	2	6	301755	301760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288713
7064	NC_011004	ACC	2	6	301770	301775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288713
7065	NC_011004	GTCG	2	8	301787	301794	0 %	25 %	50 %	25 %	192288713
7066	NC_011004	CTG	2	6	301908	301913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288713
7067	NC_011004	CGT	2	6	301919	301924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288713
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7069	NC_011004	ACA	2	6	302029	302034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288713
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7072	NC_011004	TCG	2	6	302170	302175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288713
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7079	NC_011004	GGC	3	9	302439	302447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288713
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7091	NC_011004	ATC	2	6	303023	303028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288714
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7094	NC_011004	GCC	2	6	303104	303109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288714
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7099	NC_011004	GGTC	2	8	303310	303317	0 %	25 %	50 %	25 %	192288714
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7102	NC_011004	CCGG	2	8	303360	303367	0 %	0 %	50 %	50 %	192288714
7103	NC_011004	GAC	2	6	303383	303388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288714
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7109	NC_011004	CAT	3	9	303568	303576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288714
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7118	NC_011004	TCTCGG	2	12	304344	304355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288715
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7120	NC_011004	CCGG	2	8	304406	304413	0 %	0 %	50 %	50 %	192288715
7121	NC_011004	CGA	2	6	304471	304476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288715
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7232	NC_011004	CGG	2	6	309098	309103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288720
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7234	NC_011004	CTGC	2	8	309134	309141	0 %	25 %	25 %	50 %	192288720
7235	NC_011004	TGC	3	9	309139	309147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288720
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7238	NC_011004	GCC	2	6	309315	309320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288720
7239	NC_011004	CAA	2	6	309356	309361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288720
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7241	NC_011004	AACG	2	8	309631	309638	50 %	0 %	25 %	25 %	192288721
7242	NC_011004	ACG	2	6	309710	309715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288721
7243	NC_011004	CGT	2	6	309807	309812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288721
7244	NC_011004	CG	3	6	309813	309818	0 %	0 %	50 %	50 %	192288721
7245	NC_011004	GC	3	6	309829	309834	0 %	0 %	50 %	50 %	192288721
7246	NC_011004	TGC	2	6	309845	309850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288721
7247	NC_011004	GATGG	2	10	309855	309864	20 %	20 %	60 %	0 %	192288721
7248	NC_011004	GCCG	2	8	309879	309886	0 %	0 %	50 %	50 %	192288721
7249	NC_011004	GAA	2	6	309951	309956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288721
7250	NC_011004	CTA	2	6	310020	310025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288721
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7255	NC_011004	CAC	2	6	310380	310385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288721
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7273	NC_011004	CG	3	6	311172	311177	0 %	0 %	50 %	50 %	192288721
7274	NC_011004	CGT	2	6	311220	311225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288721
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7354	NC_011004	TGCGC	2	10	314753	314762	0 %	20 %	40 %	40 %	192288724
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7480	NC_011004	TCG	2	6	320947	320952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288729
7481	NC_011004	TCACC	2	10	320966	320975	20 %	20 %	0 %	60 %	192288729
7482	NC_011004	CTT	2	6	321002	321007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288729
7483	NC_011004	TCG	2	6	321016	321021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288729
7484	NC_011004	CAG	2	6	321024	321029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288729
7485	NC_011004	GCG	3	9	321107	321115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288729
7486	NC_011004	CGA	2	6	321116	321121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288729
7487	NC_011004	GC	3	6	321127	321132	0 %	0 %	50 %	50 %	192288729
7488	NC_011004	CGA	2	6	321152	321157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288729
7489	NC_011004	TCG	2	6	321196	321201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288729
7490	NC_011004	GCG	2	6	321233	321238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288729
7491	NC_011004	AGC	2	6	321307	321312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288729
7492	NC_011004	CCTT	2	8	321328	321335	0 %	50 %	0 %	50 %	192288729
7493	NC_011004	GCG	2	6	321384	321389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288729
7494	NC_011004	GTC	2	6	321414	321419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288729
7495	NC_011004	AAG	2	6	321454	321459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288729
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7498	NC_011004	AGGC	2	8	321532	321539	25 %	0 %	50 %	25 %	192288729
7499	NC_011004	CGGC	2	8	321611	321618	0 %	0 %	50 %	50 %	192288729
7500	NC_011004	CCG	2	6	321945	321950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288730

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