MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 131023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011004	GCC	2	6	276605	276610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288690
6502	NC_011004	GC	3	6	277313	277318	0 %	0 %	50 %	50 %	192288691
6503	NC_011004	CAGC	2	8	277342	277349	25 %	0 %	25 %	50 %	192288691
6504	NC_011004	CCGT	4	16	277380	277395	0 %	25 %	25 %	50 %	192288691
6505	NC_011004	ATCC	2	8	277435	277442	25 %	25 %	0 %	50 %	192288691
6506	NC_011004	CTG	2	6	277525	277530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288691
6507	NC_011004	CG	3	6	277547	277552	0 %	0 %	50 %	50 %	192288691
6508	NC_011004	AGGCG	2	10	277611	277620	20 %	0 %	60 %	20 %	192288691
6509	NC_011004	CG	3	6	277662	277667	0 %	0 %	50 %	50 %	192288691
6510	NC_011004	GACC	2	8	277686	277693	25 %	0 %	25 %	50 %	192288691
6511	NC_011004	AGC	3	9	277718	277726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288691
6512	NC_011004	AGC	2	6	277735	277740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288691
6513	NC_011004	ACC	2	6	277769	277774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288691
6514	NC_011004	ACC	2	6	277790	277795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288691
6515	NC_011004	ACG	2	6	277812	277817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288691
6516	NC_011004	CAC	2	6	277825	277830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288691
6517	NC_011004	CTG	2	6	277843	277848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288691
6518	NC_011004	CGA	2	6	277863	277868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288691
6519	NC_011004	TGC	2	6	277869	277874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288691
6520	NC_011004	CGCGG	2	10	277879	277888	0 %	0 %	60 %	40 %	192288691
6521	NC_011004	GCGAC	2	10	277932	277941	20 %	0 %	40 %	40 %	192288691
6522	NC_011004	TCT	2	6	278052	278057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288691
6523	NC_011004	GTGC	2	8	278933	278940	0 %	25 %	50 %	25 %	192288692
6524	NC_011004	TCG	2	6	278982	278987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288692
6525	NC_011004	CGG	2	6	279027	279032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288692
6526	NC_011004	CGT	2	6	279120	279125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288692
6527	NC_011004	GTT	2	6	279136	279141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288692
6528	NC_011004	ACCG	2	8	279157	279164	25 %	0 %	25 %	50 %	192288692
6529	NC_011004	TGT	2	6	279270	279275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288692
6530	NC_011004	TGC	2	6	279309	279314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288692
6531	NC_011004	GCT	2	6	279367	279372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288692
6532	NC_011004	GGTT	2	8	279446	279453	0 %	50 %	50 %	0 %	192288692
6533	NC_011004	GC	3	6	279535	279540	0 %	0 %	50 %	50 %	192288692
6534	NC_011004	GGT	2	6	279565	279570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288692
6535	NC_011004	TCG	2	6	279615	279620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288692
6536	NC_011004	CGC	2	6	279628	279633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288692
6537	NC_011004	CGG	2	6	279699	279704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288692
6538	NC_011004	GATCT	2	10	279718	279727	20 %	40 %	20 %	20 %	192288692
6539	NC_011004	CGAAA	2	10	279906	279915	60 %	0 %	20 %	20 %	192288693
6540	NC_011004	GAT	2	6	279939	279944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288693
6541	NC_011004	ACG	2	6	279950	279955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288693
6542	NC_011004	CGATGC	2	12	279983	279994	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288693
6543	NC_011004	CAC	2	6	280044	280049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288693
6544	NC_011004	GAT	2	6	280059	280064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288693
6545	NC_011004	ACG	2	6	280114	280119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288693
6546	NC_011004	TGC	2	6	280154	280159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288693
6547	NC_011004	CGC	2	6	280229	280234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288693
6548	NC_011004	CGC	2	6	280251	280256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288693
6549	NC_011004	TCAGC	2	10	280260	280269	20 %	20 %	20 %	40 %	192288693
6550	NC_011004	TCG	2	6	280280	280285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288693
6551	NC_011004	CGC	2	6	280305	280310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288693
6552	NC_011004	TCGCG	2	10	280329	280338	0 %	20 %	40 %	40 %	192288693
6553	NC_011004	GTG	2	6	280366	280371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288693
6554	NC_011004	CGC	2	6	280419	280424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288693
6555	NC_011004	GGC	2	6	280443	280448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288693
6556	NC_011004	CGC	2	6	280488	280493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288693
6557	NC_011004	GC	3	6	280517	280522	0 %	0 %	50 %	50 %	192288693
6558	NC_011004	CGA	2	6	280581	280586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288693
6559	NC_011004	TGG	2	6	280607	280612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288693
6560	NC_011004	GCA	2	6	280664	280669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288693
6561	NC_011004	GCCG	2	8	280675	280682	0 %	0 %	50 %	50 %	192288693
6562	NC_011004	GAT	2	6	280698	280703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288693
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6564	NC_011004	GTC	2	6	280731	280736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288693
6565	NC_011004	GCG	2	6	280747	280752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288693
6566	NC_011004	CG	3	6	280751	280756	0 %	0 %	50 %	50 %	192288693
6567	NC_011004	AGC	2	6	280870	280875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288693
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6569	NC_011004	GCG	2	6	280938	280943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288693
6570	NC_011004	CCG	2	6	281018	281023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288694
6571	NC_011004	GCC	2	6	281039	281044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288694
6572	NC_011004	TGGC	2	8	281054	281061	0 %	25 %	50 %	25 %	192288694
6573	NC_011004	CGGC	2	8	281130	281137	0 %	0 %	50 %	50 %	192288694
6574	NC_011004	CGC	2	6	281157	281162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288694
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6577	NC_011004	CAGG	2	8	281281	281288	25 %	0 %	50 %	25 %	192288694
6578	NC_011004	TCA	2	6	281322	281327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288694
6579	NC_011004	TCA	2	6	281388	281393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288694
6580	NC_011004	GCA	2	6	281481	281486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288694
6581	NC_011004	GC	3	6	281529	281534	0 %	0 %	50 %	50 %	192288694
6582	NC_011004	GAC	2	6	281545	281550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288694
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6585	NC_011004	ACG	2	6	281638	281643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288694
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6588	NC_011004	TCG	2	6	281708	281713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288694
6589	NC_011004	GCG	2	6	281772	281777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288694
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6591	NC_011004	GAA	2	6	281941	281946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288694
6592	NC_011004	CGC	2	6	281955	281960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288694
6593	NC_011004	GGCA	2	8	282027	282034	25 %	0 %	50 %	25 %	192288694
6594	NC_011004	CGC	2	6	282042	282047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288694
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6601	NC_011004	CG	3	6	282204	282209	0 %	0 %	50 %	50 %	192288694
6602	NC_011004	TCGAAA	2	12	282224	282235	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	192288694
6603	NC_011004	GTCGAG	2	12	282253	282264	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192288694
6604	NC_011004	GC	3	6	282269	282274	0 %	0 %	50 %	50 %	192288694
6605	NC_011004	GTC	2	6	282295	282300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288694
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6608	NC_011004	CG	3	6	282459	282464	0 %	0 %	50 %	50 %	192288695
6609	NC_011004	GAA	2	6	282481	282486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288695
6610	NC_011004	CGA	2	6	282541	282546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288695
6611	NC_011004	CGTTGA	2	12	282687	282698	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192288695
6612	NC_011004	GTG	2	6	282707	282712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288695
6613	NC_011004	GCAG	2	8	282714	282721	25 %	0 %	50 %	25 %	192288695
6614	NC_011004	GCG	2	6	282766	282771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288695
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6616	NC_011004	GC	3	6	283107	283112	0 %	0 %	50 %	50 %	192288696
6617	NC_011004	TGC	2	6	283121	283126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288696
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6619	NC_011004	CGG	2	6	283151	283156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288696
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6621	NC_011004	TTC	2	6	283189	283194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288696
6622	NC_011004	ATC	2	6	283222	283227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288696
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6624	NC_011004	GCT	3	9	283302	283310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288696
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6980	NC_011004	CGG	2	6	298411	298416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288710
6981	NC_011004	GATCGA	2	12	298479	298490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	192288710
6982	NC_011004	CGT	2	6	298569	298574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288710
6983	NC_011004	CCGT	2	8	298594	298601	0 %	25 %	25 %	50 %	192288710
6984	NC_011004	ATC	2	6	298770	298775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288711
6985	NC_011004	CGC	2	6	298788	298793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288711
6986	NC_011004	CGC	2	6	298886	298891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288711
6987	NC_011004	GAT	2	6	298895	298900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288711
6988	NC_011004	TGG	2	6	298942	298947	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288711
6989	NC_011004	CGA	2	6	298967	298972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288711
6990	NC_011004	CGGC	2	8	299145	299152	0 %	0 %	50 %	50 %	192288712
6991	NC_011004	AGCG	2	8	299174	299181	25 %	0 %	50 %	25 %	192288712
6992	NC_011004	CG	3	6	299191	299196	0 %	0 %	50 %	50 %	192288712
6993	NC_011004	CTG	2	6	299207	299212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288712
6994	NC_011004	GTCG	2	8	299248	299255	0 %	25 %	50 %	25 %	192288712
6995	NC_011004	GCA	2	6	299263	299268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288712
6996	NC_011004	TCG	2	6	299283	299288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288712
6997	NC_011004	G	7	7	299288	299294	0 %	0 %	100 %	0 %	192288712
6998	NC_011004	CCG	2	6	299310	299315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288712
6999	NC_011004	GGTGCT	2	12	299425	299436	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	192288712
7000	NC_011004	GTT	2	6	299455	299460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288712

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