MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pA

Total Repeats: 9258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010998	GCC	2	6	108891	108896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895414
2502	NC_010998	CG	4	8	108930	108937	0 %	0 %	50 %	50 %	190895414
2503	NC_010998	GAA	2	6	108993	108998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895414
2504	NC_010998	CCG	2	6	109007	109012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895414
2505	NC_010998	C	6	6	109021	109026	0 %	0 %	0 %	100 %	190895414
2506	NC_010998	CGGCGT	2	12	109083	109094	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190895414
2507	NC_010998	GGC	2	6	109123	109128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895414
2508	NC_010998	GGC	2	6	109174	109179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895414
2509	NC_010998	CGC	2	6	109217	109222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895414
2510	NC_010998	GC	3	6	109343	109348	0 %	0 %	50 %	50 %	190895414
2511	NC_010998	CGA	2	6	109359	109364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895414
2512	NC_010998	CAT	2	6	109365	109370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895414
2513	NC_010998	GAC	2	6	109381	109386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895414
2514	NC_010998	GATC	2	8	109392	109399	25 %	25 %	25 %	25 %	190895414
2515	NC_010998	CGC	2	6	109409	109414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895414
2516	NC_010998	CGG	2	6	109416	109421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895414
2517	NC_010998	ACG	2	6	109453	109458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895414
2518	NC_010998	GAA	2	6	109461	109466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895414
2519	NC_010998	CGA	2	6	109470	109475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895414
2520	NC_010998	AGG	2	6	109499	109504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895414
2521	NC_010998	GAA	2	6	109596	109601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895414
2522	NC_010998	CCG	2	6	109630	109635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895414
2523	NC_010998	CGA	2	6	109689	109694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895414
2524	NC_010998	CAT	2	6	109695	109700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895414
2525	NC_010998	CCG	2	6	109707	109712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895414
2526	NC_010998	CCG	2	6	109826	109831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895414
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2528	NC_010998	TCG	2	6	109862	109867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895414
2529	NC_010998	GC	3	6	109878	109883	0 %	0 %	50 %	50 %	190895414
2530	NC_010998	CGGG	2	8	110108	110115	0 %	0 %	75 %	25 %	190895414
2531	NC_010998	TCC	2	6	110119	110124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895414
2532	NC_010998	CTA	2	6	110157	110162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895414
2533	NC_010998	CGACGG	2	12	110220	110231	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190895414
2534	NC_010998	CGGC	2	8	110246	110253	0 %	0 %	50 %	50 %	190895414
2535	NC_010998	CGGC	2	8	110255	110262	0 %	0 %	50 %	50 %	190895414
2536	NC_010998	CAA	2	6	110292	110297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895414
2537	NC_010998	CGAC	2	8	110306	110313	25 %	0 %	25 %	50 %	190895414
2538	NC_010998	GTC	2	6	110332	110337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895414
2539	NC_010998	TCA	2	6	110369	110374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895414
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2541	NC_010998	GCCG	2	8	110413	110420	0 %	0 %	50 %	50 %	190895414
2542	NC_010998	GTC	2	6	110457	110462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895414
2543	NC_010998	GGT	2	6	110463	110468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895414
2544	NC_010998	AGC	2	6	110480	110485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895414
2545	NC_010998	GCA	2	6	110514	110519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895414
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2547	NC_010998	CGT	2	6	110577	110582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895414
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2549	NC_010998	CCAG	2	8	110597	110604	25 %	0 %	25 %	50 %	190895414
2550	NC_010998	TGA	2	6	110627	110632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895414
2551	NC_010998	AGA	2	6	110642	110647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895414
2552	NC_010998	GC	3	6	110693	110698	0 %	0 %	50 %	50 %	190895414
2553	NC_010998	ATC	2	6	110701	110706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895414
2554	NC_010998	GCC	2	6	110797	110802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895414
2555	NC_010998	AGC	2	6	110834	110839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895414
2556	NC_010998	GTG	2	6	111112	111117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190895415
2557	NC_010998	ATC	2	6	111127	111132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895415
2558	NC_010998	CCCG	2	8	111138	111145	0 %	0 %	25 %	75 %	190895415
2559	NC_010998	TA	3	6	111160	111165	50 %	50 %	0 %	0 %	190895415
2560	NC_010998	GCG	2	6	111188	111193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895415
2561	NC_010998	CCT	2	6	111194	111199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895415
2562	NC_010998	CGG	2	6	111285	111290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895415
2563	NC_010998	ACA	2	6	111329	111334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895415
2564	NC_010998	GCG	2	6	111439	111444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895415
2565	NC_010998	TCCT	2	8	111487	111494	0 %	50 %	0 %	50 %	190895415
2566	NC_010998	ATC	2	6	111529	111534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895415
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2579	NC_010998	ATC	2	6	111997	112002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895415
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2590	NC_010998	TCG	2	6	112389	112394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895416
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2592	NC_010998	CTT	2	6	112426	112431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895416
2593	NC_010998	CTT	2	6	112483	112488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895416
2594	NC_010998	CGAC	2	8	112494	112501	25 %	0 %	25 %	50 %	190895416
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2596	NC_010998	CAT	2	6	112561	112566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895416
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2601	NC_010998	TCG	2	6	112689	112694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895416
2602	NC_010998	TCA	2	6	112788	112793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895416
2603	NC_010998	GCG	2	6	112880	112885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895416
2604	NC_010998	CAT	3	9	112912	112920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895416
2605	NC_010998	TGA	2	6	112941	112946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895416
2606	NC_010998	TCG	2	6	112956	112961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895416
2607	NC_010998	CGT	2	6	112984	112989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895416
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2609	NC_010998	GCC	2	6	113032	113037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895416
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2611	NC_010998	CGCCC	2	10	113231	113240	0 %	0 %	20 %	80 %	190895417
2612	NC_010998	ATC	2	6	113277	113282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895417
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2614	NC_010998	TCCGGC	2	12	113394	113405	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190895417
2615	NC_010998	CG	3	6	113417	113422	0 %	0 %	50 %	50 %	190895417
2616	NC_010998	TGT	2	6	113437	113442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895417
2617	NC_010998	GC	3	6	113447	113452	0 %	0 %	50 %	50 %	190895417
2618	NC_010998	CGT	2	6	113453	113458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895417
2619	NC_010998	GCA	2	6	113488	113493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895417
2620	NC_010998	CGC	2	6	113520	113525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895417
2621	NC_010998	GCG	2	6	113533	113538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895417
2622	NC_010998	GAT	2	6	113549	113554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895417
2623	NC_010998	TCG	2	6	113608	113613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895417
2624	NC_010998	CGC	2	6	113702	113707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895417
2625	NC_010998	CGG	2	6	113738	113743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895417
2626	NC_010998	CCAGCG	2	12	113744	113755	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	190895417
2627	NC_010998	TGA	2	6	113758	113763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895417
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2629	NC_010998	CGA	2	6	113812	113817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895417
2630	NC_010998	TCA	2	6	113899	113904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895417
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2632	NC_010998	GCA	2	6	113954	113959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895417
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2635	NC_010998	ATC	2	6	114084	114089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895417
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2643	NC_010998	ATC	2	6	114420	114425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895417
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2724	NC_010998	CAA	2	6	119231	119236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895421
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2732	NC_010998	TCC	2	6	119877	119882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895422
2733	NC_010998	CGCT	2	8	119885	119892	0 %	25 %	25 %	50 %	190895422
2734	NC_010998	ATC	2	6	120050	120055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895422
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2736	NC_010998	GA	3	6	120263	120268	50 %	0 %	50 %	0 %	190895422
2737	NC_010998	GAC	2	6	120323	120328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895422
2738	NC_010998	CTG	2	6	120357	120362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895422
2739	NC_010998	ACG	2	6	120445	120450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895422
2740	NC_010998	A	6	6	120486	120491	100 %	0 %	0 %	0 %	190895422
2741	NC_010998	TGA	2	6	120519	120524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895422
2742	NC_010998	TCG	2	6	120546	120551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895422
2743	NC_010998	AT	3	6	120558	120563	50 %	50 %	0 %	0 %	190895422
2744	NC_010998	GCA	2	6	120601	120606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895422
2745	NC_010998	GAT	2	6	120620	120625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895422
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2747	NC_010998	AG	3	6	120735	120740	50 %	0 %	50 %	0 %	190895422
2748	NC_010998	TTACG	2	10	120757	120766	20 %	40 %	20 %	20 %	190895422
2749	NC_010998	GGC	2	6	120797	120802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895422
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2751	NC_010998	CCGAC	2	10	120888	120897	20 %	0 %	20 %	60 %	190895423
2752	NC_010998	CTG	2	6	120899	120904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895423
2753	NC_010998	CAA	2	6	120944	120949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895423
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2755	NC_010998	CGA	2	6	121049	121054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895423
2756	NC_010998	ATC	2	6	121126	121131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895423
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2759	NC_010998	GAGC	2	8	121217	121224	25 %	0 %	50 %	25 %	190895423
2760	NC_010998	TCG	2	6	121282	121287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895423
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2764	NC_010998	AAC	2	6	121608	121613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895423
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2767	NC_010998	CTTT	2	8	122136	122143	0 %	75 %	0 %	25 %	190895424
2768	NC_010998	T	6	6	122153	122158	0 %	100 %	0 %	0 %	190895424
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2775	NC_010998	CATC	2	8	122529	122536	25 %	25 %	0 %	50 %	190895424
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2863	NC_010998	CTG	2	6	128676	128681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895429
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2978	NC_010998	CAG	2	6	133758	133763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895435
2979	NC_010998	AGC	2	6	133768	133773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895435
2980	NC_010998	GCCGTC	2	12	133824	133835	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190895435
2981	NC_010998	CTC	2	6	133926	133931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895435
2982	NC_010998	AAGCCG	2	12	133951	133962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895435
2983	NC_010998	GAA	2	6	134025	134030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895435
2984	NC_010998	AAGG	2	8	134106	134113	50 %	0 %	50 %	0 %	190895435
2985	NC_010998	GCCCG	2	10	134121	134130	0 %	0 %	40 %	60 %	190895435
2986	NC_010998	CGGC	2	8	134162	134169	0 %	0 %	50 %	50 %	190895435
2987	NC_010998	GCA	2	6	134174	134179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895435
2988	NC_010998	CCG	2	6	134282	134287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895435
2989	NC_010998	CAC	2	6	134301	134306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895435
2990	NC_010998	AGG	2	6	134333	134338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190895435
2991	NC_010998	TGC	2	6	134427	134432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895435
2992	NC_010998	TAC	2	6	134479	134484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895436
2993	NC_010998	TGT	2	6	134513	134518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895436
2994	NC_010998	T	6	6	134574	134579	0 %	100 %	0 %	0 %	190895436
2995	NC_010998	TCGG	2	8	134595	134602	0 %	25 %	50 %	25 %	190895436
2996	NC_010998	GGCC	3	12	134687	134698	0 %	0 %	50 %	50 %	190895436
2997	NC_010998	GTT	2	6	134703	134708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190895436
2998	NC_010998	GCC	2	6	134713	134718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895436
2999	NC_010998	TGAAG	2	10	134747	134756	40 %	20 %	40 %	0 %	190895436
3000	NC_010998	TCGCA	2	10	134779	134788	20 %	20 %	20 %	40 %	190895436

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