MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 21949

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010997	GCC	2	6	318977	318982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894632
6502	NC_010997	GCT	2	6	319003	319008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894632
6503	NC_010997	GGC	3	9	319019	319027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894632
6504	NC_010997	ATC	2	6	319032	319037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894632
6505	NC_010997	AGA	2	6	319042	319047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894632
6506	NC_010997	GCC	2	6	319127	319132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894632
6507	NC_010997	CGA	2	6	319153	319158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894632
6508	NC_010997	GC	3	6	319186	319191	0 %	0 %	50 %	50 %	190894632
6509	NC_010997	GGA	2	6	319193	319198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894632
6510	NC_010997	GGC	2	6	319221	319226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894632
6511	NC_010997	AGA	2	6	319245	319250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894632
6512	NC_010997	CG	3	6	319267	319272	0 %	0 %	50 %	50 %	190894632
6513	NC_010997	GCC	2	6	319298	319303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894632
6514	NC_010997	GCA	2	6	319372	319377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894632
6515	NC_010997	CGA	2	6	319417	319422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894632
6516	NC_010997	GCTG	2	8	319444	319451	0 %	25 %	50 %	25 %	190894632
6517	NC_010997	TTC	2	6	319492	319497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894633
6518	NC_010997	CGA	2	6	319554	319559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894633
6519	NC_010997	ATA	2	6	319670	319675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190894633
6520	NC_010997	AAG	2	6	319711	319716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894633
6521	NC_010997	CGC	2	6	319841	319846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894633
6522	NC_010997	ATC	2	6	319865	319870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894633
6523	NC_010997	GGC	2	6	319871	319876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894633
6524	NC_010997	TCG	2	6	320075	320080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894633
6525	NC_010997	TCA	2	6	320102	320107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894633
6526	NC_010997	ATG	2	6	320143	320148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894633
6527	NC_010997	GCC	2	6	320154	320159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894633
6528	NC_010997	GCC	2	6	320179	320184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894633
6529	NC_010997	GGA	2	6	320221	320226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894633
6530	NC_010997	CGA	3	9	320229	320237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894633
6531	NC_010997	ATC	2	6	320258	320263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894633
6532	NC_010997	AGC	2	6	320270	320275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894633
6533	NC_010997	ATTG	2	8	320324	320331	25 %	50 %	25 %	0 %	190894633
6534	NC_010997	CGG	2	6	320346	320351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894633
6535	NC_010997	GATG	2	8	320355	320362	25 %	25 %	50 %	0 %	190894633
6536	NC_010997	CG	3	6	320386	320391	0 %	0 %	50 %	50 %	190894633
6537	NC_010997	CAT	2	6	320499	320504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894633
6538	NC_010997	GCA	2	6	320525	320530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894633
6539	NC_010997	GGC	2	6	320535	320540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894633
6540	NC_010997	CACC	2	8	320552	320559	25 %	0 %	0 %	75 %	190894633
6541	NC_010997	ATT	2	6	320576	320581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894633
6542	NC_010997	GCG	2	6	320892	320897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894634
6543	NC_010997	CCGA	2	8	320948	320955	25 %	0 %	25 %	50 %	190894634
6544	NC_010997	CGG	2	6	320959	320964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894634
6545	NC_010997	TGG	2	6	321001	321006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894634
6546	NC_010997	CGC	2	6	321040	321045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894634
6547	NC_010997	CACG	2	8	321067	321074	25 %	0 %	25 %	50 %	190894634
6548	NC_010997	GCC	2	6	321086	321091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894634
6549	NC_010997	CCT	2	6	321232	321237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894634
6550	NC_010997	CGC	2	6	321247	321252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894634
6551	NC_010997	CGG	2	6	321255	321260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894634
6552	NC_010997	CGG	2	6	321284	321289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894634
6553	NC_010997	AGG	2	6	321311	321316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894634
6554	NC_010997	CAT	2	6	321358	321363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894634
6555	NC_010997	GGCG	2	8	321445	321452	0 %	0 %	75 %	25 %	190894634
6556	NC_010997	TCA	2	6	321552	321557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894634
6557	NC_010997	CGAT	2	8	321606	321613	25 %	25 %	25 %	25 %	190894634
6558	NC_010997	AATG	2	8	321744	321751	50 %	25 %	25 %	0 %	190894634
6559	NC_010997	GGC	2	6	321768	321773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894635
6560	NC_010997	TCGG	2	8	321821	321828	0 %	25 %	50 %	25 %	190894635
6561	NC_010997	CGC	2	6	321939	321944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894635
6562	NC_010997	GGA	2	6	321951	321956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894635
6563	NC_010997	CGT	2	6	321981	321986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894635
6564	NC_010997	CG	3	6	322027	322032	0 %	0 %	50 %	50 %	190894635
6565	NC_010997	CGT	2	6	322098	322103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894635
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6567	NC_010997	CGG	2	6	322220	322225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894635
6568	NC_010997	CGG	3	9	322287	322295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894635
6569	NC_010997	CAC	2	6	322362	322367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894635
6570	NC_010997	CGAG	2	8	322373	322380	25 %	0 %	50 %	25 %	190894635
6571	NC_010997	GC	3	6	322383	322388	0 %	0 %	50 %	50 %	190894635
6572	NC_010997	ACGCTC	2	12	322441	322452	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190894635
6573	NC_010997	GGC	2	6	322487	322492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894635
6574	NC_010997	CTT	2	6	322527	322532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894635
6575	NC_010997	TTCA	2	8	322551	322558	25 %	50 %	0 %	25 %	190894635
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6577	NC_010997	CG	3	6	322613	322618	0 %	0 %	50 %	50 %	190894635
6578	NC_010997	CCG	2	6	322633	322638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894635
6579	NC_010997	GGC	2	6	322648	322653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894635
6580	NC_010997	GCC	2	6	322657	322662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894635
6581	NC_010997	CTCG	2	8	322681	322688	0 %	25 %	25 %	50 %	190894635
6582	NC_010997	TCG	2	6	322721	322726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894635
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6584	NC_010997	TCG	2	6	323170	323175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894636
6585	NC_010997	TCG	2	6	323191	323196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894636
6586	NC_010997	GCA	2	6	323207	323212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894636
6587	NC_010997	GTC	2	6	323268	323273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894636
6588	NC_010997	GTTTC	2	10	323302	323311	0 %	60 %	20 %	20 %	190894636
6589	NC_010997	CGA	2	6	323550	323555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894637
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6591	NC_010997	TGA	2	6	323598	323603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894637
6592	NC_010997	CGG	2	6	323634	323639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894637
6593	NC_010997	CGTT	2	8	323646	323653	0 %	50 %	25 %	25 %	190894637
6594	NC_010997	TCG	2	6	323697	323702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894637
6595	NC_010997	GTCGAA	2	12	323825	323836	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190894637
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6597	NC_010997	TCC	2	6	323897	323902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894637
6598	NC_010997	CTGGT	2	10	323996	324005	0 %	40 %	40 %	20 %	190894637
6599	NC_010997	CGAT	2	8	324081	324088	25 %	25 %	25 %	25 %	190894637
6600	NC_010997	GCT	2	6	324097	324102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894637
6601	NC_010997	CCGA	2	8	324167	324174	25 %	0 %	25 %	50 %	190894637
6602	NC_010997	GCTG	2	8	324192	324199	0 %	25 %	50 %	25 %	190894637
6603	NC_010997	GGA	2	6	324202	324207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894637
6604	NC_010997	GCTGCC	2	12	324238	324249	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190894637
6605	NC_010997	CGGA	2	8	324268	324275	25 %	0 %	50 %	25 %	190894637
6606	NC_010997	CGG	2	6	324331	324336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894637
6607	NC_010997	GATG	2	8	324371	324378	25 %	25 %	50 %	0 %	190894638
6608	NC_010997	TGC	2	6	324401	324406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894638
6609	NC_010997	TC	3	6	324469	324474	0 %	50 %	0 %	50 %	190894638
6610	NC_010997	AGG	2	6	324529	324534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894638
6611	NC_010997	TTGC	2	8	324540	324547	0 %	50 %	25 %	25 %	190894638
6612	NC_010997	CGG	2	6	324722	324727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894638
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6619	NC_010997	CCGC	2	8	325129	325136	0 %	0 %	25 %	75 %	190894639
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6983	NC_010997	GCC	2	6	340374	340379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894654
6984	NC_010997	GAG	2	6	340384	340389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894654
6985	NC_010997	CGG	2	6	340401	340406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894654
6986	NC_010997	GAG	2	6	340426	340431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894654
6987	NC_010997	CG	3	6	340439	340444	0 %	0 %	50 %	50 %	190894654
6988	NC_010997	CGGG	2	8	340458	340465	0 %	0 %	75 %	25 %	190894654
6989	NC_010997	TCG	2	6	340474	340479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894654
6990	NC_010997	CGA	2	6	340493	340498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894654
6991	NC_010997	CGA	2	6	340529	340534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894654
6992	NC_010997	GAC	2	6	340569	340574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894654
6993	NC_010997	GC	3	6	340591	340596	0 %	0 %	50 %	50 %	190894654
6994	NC_010997	CGA	2	6	340613	340618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894654
6995	NC_010997	TCG	2	6	340657	340662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894654
6996	NC_010997	ATC	2	6	340702	340707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894654
6997	NC_010997	GCC	2	6	340722	340727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894654
6998	NC_010997	GGCGCG	2	12	340800	340811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894654
6999	NC_010997	GAT	2	6	340835	340840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894654
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