MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 6146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010996	GGC	2	6	91	96	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893984
2	NC_010996	GCC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893984
3	NC_010996	TCA	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893984
4	NC_010996	GGC	2	6	286	291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893984
5	NC_010996	AAC	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190893984
6	NC_010996	CTG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893984
7	NC_010996	CGG	2	6	400	405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893984
8	NC_010996	TCA	2	6	429	434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893984
9	NC_010996	CAT	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893985
10	NC_010996	AAG	2	6	1577	1582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893985
11	NC_010996	CGG	2	6	1622	1627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
12	NC_010996	CGG	2	6	1631	1636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
13	NC_010996	G	9	9	1635	1643	0 %	0 %	100 %	0 %	190893985
14	NC_010996	GAA	2	6	1683	1688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893985
15	NC_010996	GGC	2	6	1719	1724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
16	NC_010996	CGAAG	2	10	1754	1763	40 %	0 %	40 %	20 %	190893985
17	NC_010996	TCG	2	6	1837	1842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893985
18	NC_010996	GGC	2	6	1865	1870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893985
19	NC_010996	CGT	2	6	1893	1898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893985
20	NC_010996	TCGC	2	8	1903	1910	0 %	25 %	25 %	50 %	190893985
21	NC_010996	GAT	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893985
22	NC_010996	TCG	2	6	4083	4088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893986
23	NC_010996	CGC	2	6	4146	4151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893986
24	NC_010996	CG	3	6	4166	4171	0 %	0 %	50 %	50 %	190893986
25	NC_010996	GGA	2	6	4238	4243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190893986
26	NC_010996	GCTGA	2	10	4271	4280	20 %	20 %	40 %	20 %	190893986
27	NC_010996	CAG	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893987
28	NC_010996	GGCAAT	2	12	4552	4563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190893987
29	NC_010996	GCC	2	6	4565	4570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893987
30	NC_010996	TCA	2	6	4578	4583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893987
31	NC_010996	CGA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893987
32	NC_010996	TGC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893987
33	NC_010996	CGT	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893987
34	NC_010996	CGC	2	6	4894	4899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893987
35	NC_010996	CGC	2	6	5031	5036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893987
36	NC_010996	TGAC	2	8	5069	5076	25 %	25 %	25 %	25 %	190893987
37	NC_010996	TCGA	2	8	5089	5096	25 %	25 %	25 %	25 %	190893987
38	NC_010996	TTG	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190893987
39	NC_010996	AGT	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893987
40	NC_010996	TAG	2	6	5417	5422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893988
41	NC_010996	GCC	2	6	5440	5445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893988
42	NC_010996	CG	3	6	5479	5484	0 %	0 %	50 %	50 %	190893988
43	NC_010996	AGC	2	6	5517	5522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893988
44	NC_010996	GAGAA	2	10	5541	5550	60 %	0 %	40 %	0 %	190893988
45	NC_010996	CTG	2	6	5553	5558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893988
46	NC_010996	GGC	2	6	8513	8518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893989
47	NC_010996	TGC	2	6	8552	8557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893989
48	NC_010996	GTTG	2	8	8561	8568	0 %	50 %	50 %	0 %	190893989
49	NC_010996	GC	3	6	8607	8612	0 %	0 %	50 %	50 %	190893989
50	NC_010996	GAGG	2	8	8637	8644	25 %	0 %	75 %	0 %	190893989
51	NC_010996	A	6	6	8823	8828	100 %	0 %	0 %	0 %	190893990
52	NC_010996	ATCT	2	8	8987	8994	25 %	50 %	0 %	25 %	190893990
53	NC_010996	TTC	2	6	8997	9002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
54	NC_010996	CGC	2	6	9003	9008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893990
55	NC_010996	GTGC	2	8	9044	9051	0 %	25 %	50 %	25 %	190893990
56	NC_010996	CCG	2	6	9058	9063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893990
57	NC_010996	GCG	2	6	9156	9161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
58	NC_010996	CGT	2	6	9202	9207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
59	NC_010996	CAT	2	6	9208	9213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893990
60	NC_010996	CGAA	2	8	9222	9229	50 %	0 %	25 %	25 %	190893990
61	NC_010996	CGA	2	6	9271	9276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893990
62	NC_010996	GA	3	6	9320	9325	50 %	0 %	50 %	0 %	190893990
63	NC_010996	GCCA	2	8	9376	9383	25 %	0 %	25 %	50 %	190893990
64	NC_010996	ATCG	2	8	9395	9402	25 %	25 %	25 %	25 %	190893990
65	NC_010996	GT	3	6	9441	9446	0 %	50 %	50 %	0 %	190893990
66	NC_010996	AGA	2	6	9463	9468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893990
67	NC_010996	GATC	2	8	9493	9500	25 %	25 %	25 %	25 %	190893990
68	NC_010996	GCGCT	2	10	9522	9531	0 %	20 %	40 %	40 %	190893990
69	NC_010996	CG	3	6	9618	9623	0 %	0 %	50 %	50 %	190893990
70	NC_010996	CAA	2	6	9626	9631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190893990
71	NC_010996	TGC	2	6	9700	9705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
72	NC_010996	TCTG	2	8	9728	9735	0 %	50 %	25 %	25 %	190893990
73	NC_010996	GCT	2	6	9736	9741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
74	NC_010996	ATCTC	2	10	9772	9781	20 %	40 %	0 %	40 %	190893990
75	NC_010996	GGA	2	6	9804	9809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190893990
76	NC_010996	GCG	2	6	9814	9819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
77	NC_010996	TGA	2	6	9837	9842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893990
78	NC_010996	GTT	2	6	9872	9877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190893990
79	NC_010996	GTGCG	2	10	10012	10021	0 %	20 %	60 %	20 %	190893990
80	NC_010996	AGC	2	6	10026	10031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893990
81	NC_010996	TCA	2	6	10098	10103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893990
82	NC_010996	TGC	2	6	10146	10151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
83	NC_010996	TGG	2	6	10263	10268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190893990
84	NC_010996	GACG	2	8	10304	10311	25 %	0 %	50 %	25 %	190893990
85	NC_010996	CTT	2	6	10334	10339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
86	NC_010996	GAGC	2	8	10394	10401	25 %	0 %	50 %	25 %	190893990
87	NC_010996	CGGC	2	8	10402	10409	0 %	0 %	50 %	50 %	190893990
88	NC_010996	GCA	2	6	10508	10513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893990
89	NC_010996	GGGA	2	8	10518	10525	25 %	0 %	75 %	0 %	190893990
90	NC_010996	TCA	2	6	10608	10613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893990
91	NC_010996	T	6	6	10615	10620	0 %	100 %	0 %	0 %	190893990
92	NC_010996	CGG	2	6	10631	10636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
93	NC_010996	TGC	2	6	10656	10661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
94	NC_010996	GCT	2	6	10682	10687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
95	NC_010996	GGC	2	6	10774	10779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
96	NC_010996	CGT	2	6	10829	10834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
97	NC_010996	GA	3	6	10885	10890	50 %	0 %	50 %	0 %	190893990
98	NC_010996	GCC	2	6	10907	10912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893990
99	NC_010996	TCT	2	6	10966	10971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
100	NC_010996	GGC	2	6	11044	11049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
101	NC_010996	GCT	2	6	11209	11214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
102	NC_010996	TCT	2	6	11226	11231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
103	NC_010996	GGCG	2	8	11389	11396	0 %	0 %	75 %	25 %	190893990
104	NC_010996	CGA	2	6	11419	11424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893990
105	NC_010996	GAA	2	6	11461	11466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190893990
106	NC_010996	ATAG	2	8	11483	11490	50 %	25 %	25 %	0 %	190893990
107	NC_010996	GGAA	2	8	11555	11562	50 %	0 %	50 %	0 %	190893990
108	NC_010996	TGG	2	6	11695	11700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190893990
109	NC_010996	TGA	2	6	11803	11808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893990
110	NC_010996	TC	3	6	11831	11836	0 %	50 %	0 %	50 %	190893990
111	NC_010996	ACTC	2	8	11881	11888	25 %	25 %	0 %	50 %	190893990
112	NC_010996	GCC	2	6	11893	11898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190893990
113	NC_010996	TCG	2	6	11925	11930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190893990
114	NC_010996	TCGA	2	8	11981	11988	25 %	25 %	25 %	25 %	190893990
115	NC_010996	AGT	2	6	12140	12145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893990
116	NC_010996	GAT	2	6	12224	12229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190893990
117	NC_010996	TCA	2	6	12232	12237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893990
118	NC_010996	TGG	2	6	12258	12263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190893990
119	NC_010996	CTT	2	6	12266	12271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
120	NC_010996	ATA	2	6	12273	12278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190893990
121	NC_010996	TTTG	2	8	12296	12303	0 %	75 %	25 %	0 %	190893990
122	NC_010996	CGG	2	6	12307	12312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
123	NC_010996	GCG	3	9	12336	12344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893990
124	NC_010996	GGCGC	2	10	12355	12364	0 %	0 %	60 %	40 %	190893990
125	NC_010996	TTC	2	6	12447	12452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190893990
126	NC_010996	TCATG	2	10	12485	12494	20 %	40 %	20 %	20 %	190893990
127	NC_010996	GCTGTT	2	12	12744	12755	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	190893991
128	NC_010996	CGTT	2	8	12892	12899	0 %	50 %	25 %	25 %	190893991
129	NC_010996	CTA	2	6	12998	13003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893991
130	NC_010996	TAA	2	6	13121	13126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190893991
131	NC_010996	GTT	2	6	13500	13505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190893992
132	NC_010996	ACG	2	6	13556	13561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190893992
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260	NC_010996	GAAA	2	8	22415	22422	75 %	0 %	25 %	0 %	190893999
261	NC_010996	GCG	2	6	22430	22435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190893999
262	NC_010996	ATC	2	6	22450	22455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190893999
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264	NC_010996	TCC	2	6	22589	22594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190893999
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302	NC_010996	CCAG	2	8	24655	24662	25 %	0 %	25 %	50 %	190894000
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382	NC_010996	AT	3	6	30151	30156	50 %	50 %	0 %	0 %	190894004
383	NC_010996	GAC	2	6	30270	30275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894004
384	NC_010996	TGG	2	6	30295	30300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894004
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