MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 6146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010996	AC	3	6	265530	265535	50 %	0 %	0 %	50 %	190894206
4002	NC_010996	CCGG	2	8	265627	265634	0 %	0 %	50 %	50 %	190894206
4003	NC_010996	CGC	2	6	265679	265684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894206
4004	NC_010996	GCA	2	6	265686	265691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894206
4005	NC_010996	ATCG	2	8	265701	265708	25 %	25 %	25 %	25 %	190894206
4006	NC_010996	GCT	2	6	265779	265784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894206
4007	NC_010996	ATC	2	6	265859	265864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894206
4008	NC_010996	TTCC	2	8	265951	265958	0 %	50 %	0 %	50 %	190894206
4009	NC_010996	GCT	2	6	266010	266015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894206
4010	NC_010996	ACG	2	6	266081	266086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894206
4011	NC_010996	GCA	2	6	266092	266097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894206
4012	NC_010996	TGC	2	6	266237	266242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894206
4013	NC_010996	TCG	2	6	266255	266260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894206
4014	NC_010996	ACG	2	6	266280	266285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894206
4015	NC_010996	GCG	2	6	266323	266328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894206
4016	NC_010996	TCC	2	6	266341	266346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894206
4017	NC_010996	GCC	2	6	266449	266454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894206
4018	NC_010996	GAC	2	6	266551	266556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894206
4019	NC_010996	GAG	2	6	266561	266566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894206
4020	NC_010996	TGC	2	6	266642	266647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894206
4021	NC_010996	CGA	2	6	267264	267269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894207
4022	NC_010996	CG	3	6	267851	267856	0 %	0 %	50 %	50 %	190894208
4023	NC_010996	AAGT	2	8	267872	267879	50 %	25 %	25 %	0 %	190894208
4024	NC_010996	ACT	2	6	267932	267937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894208
4025	NC_010996	AG	3	6	267942	267947	50 %	0 %	50 %	0 %	190894208
4026	NC_010996	CGC	2	6	268055	268060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894208
4027	NC_010996	GCA	2	6	268089	268094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4028	NC_010996	CCG	2	6	268166	268171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894208
4029	NC_010996	AGG	2	6	268318	268323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894208
4030	NC_010996	AGC	2	6	268341	268346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4031	NC_010996	ATT	2	6	268412	268417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894208
4032	NC_010996	AGG	2	6	268471	268476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894208
4033	NC_010996	GCC	2	6	268532	268537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894208
4034	NC_010996	AGGG	2	8	268672	268679	25 %	0 %	75 %	0 %	190894208
4035	NC_010996	CAG	2	6	268717	268722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4036	NC_010996	AGG	2	6	268736	268741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894208
4037	NC_010996	CCGAGG	2	12	268757	268768	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190894208
4038	NC_010996	CGA	2	6	268848	268853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4039	NC_010996	TGAT	2	8	268862	268869	25 %	50 %	25 %	0 %	190894208
4040	NC_010996	CGGAC	2	10	268899	268908	20 %	0 %	40 %	40 %	190894208
4041	NC_010996	TGA	2	6	269019	269024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894208
4042	NC_010996	GCA	2	6	269025	269030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4043	NC_010996	TAC	2	6	269061	269066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894208
4044	NC_010996	CGA	2	6	269157	269162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4045	NC_010996	TGAT	2	8	269171	269178	25 %	50 %	25 %	0 %	190894208
4046	NC_010996	CGGAC	2	10	269208	269217	20 %	0 %	40 %	40 %	190894208
4047	NC_010996	TGA	2	6	269328	269333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894208
4048	NC_010996	GCA	2	6	269334	269339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4049	NC_010996	TAC	2	6	269370	269375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894208
4050	NC_010996	CAT	2	6	269452	269457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894208
4051	NC_010996	CGA	2	6	269466	269471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4052	NC_010996	TGAT	2	8	269480	269487	25 %	50 %	25 %	0 %	190894208
4053	NC_010996	GTC	2	6	269545	269550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4054	NC_010996	CAG	2	6	269641	269646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4055	NC_010996	A	6	6	269659	269664	100 %	0 %	0 %	0 %	190894208
4056	NC_010996	AC	3	6	269697	269702	50 %	0 %	0 %	50 %	190894208
4057	NC_010996	CCGG	2	8	269794	269801	0 %	0 %	50 %	50 %	190894208
4058	NC_010996	CGC	2	6	269846	269851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894208
4059	NC_010996	GCA	2	6	269853	269858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4060	NC_010996	ATCG	2	8	269868	269875	25 %	25 %	25 %	25 %	190894208
4061	NC_010996	GCT	2	6	269946	269951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4062	NC_010996	ATC	2	6	270026	270031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894208
4063	NC_010996	TTCC	2	8	270118	270125	0 %	50 %	0 %	50 %	190894208
4064	NC_010996	GCT	2	6	270177	270182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4065	NC_010996	ACG	2	6	270248	270253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4066	NC_010996	GCA	2	6	270259	270264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4067	NC_010996	TGC	2	6	270404	270409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4068	NC_010996	TCG	2	6	270422	270427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4069	NC_010996	ACG	2	6	270447	270452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4070	NC_010996	GCG	2	6	270490	270495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894208
4071	NC_010996	TCC	2	6	270508	270513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894208
4072	NC_010996	GCC	2	6	270616	270621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894208
4073	NC_010996	GAC	2	6	270718	270723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894208
4074	NC_010996	GGA	2	6	270727	270732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894208
4075	NC_010996	CTGC	2	8	270784	270791	0 %	25 %	25 %	50 %	190894208
4076	NC_010996	TGC	2	6	270809	270814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894208
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4079	NC_010996	GCC	2	6	272997	273002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894209
4080	NC_010996	CTT	2	6	273040	273045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894209
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4082	NC_010996	CTT	2	6	273111	273116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894209
4083	NC_010996	GC	3	6	273184	273189	0 %	0 %	50 %	50 %	190894209
4084	NC_010996	TGG	2	6	273196	273201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894209
4085	NC_010996	TCT	2	6	273216	273221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894209
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4088	NC_010996	GCG	2	6	273357	273362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894209
4089	NC_010996	GCTG	2	8	273368	273375	0 %	25 %	50 %	25 %	190894209
4090	NC_010996	CTT	2	6	273409	273414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894209
4091	NC_010996	CGC	2	6	273437	273442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894209
4092	NC_010996	GCCT	2	8	273451	273458	0 %	25 %	25 %	50 %	190894209
4093	NC_010996	TCG	2	6	275248	275253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894210
4094	NC_010996	CG	3	6	275285	275290	0 %	0 %	50 %	50 %	190894210
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4100	NC_010996	TCG	2	6	276393	276398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894211
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4102	NC_010996	TAT	2	6	276653	276658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894211
4103	NC_010996	CGA	2	6	279860	279865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894212
4104	NC_010996	GAT	2	6	280033	280038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894212
4105	NC_010996	TTG	2	6	280060	280065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894212
4106	NC_010996	GGAATG	2	12	280127	280138	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	190894212
4107	NC_010996	AAG	2	6	280197	280202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894212
4108	NC_010996	TGAA	2	8	280208	280215	50 %	25 %	25 %	0 %	190894212
4109	NC_010996	CGA	2	6	280233	280238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894212
4110	NC_010996	CGG	2	6	280257	280262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894212
4111	NC_010996	TGG	2	6	280341	280346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894212
4112	NC_010996	ACG	2	6	280364	280369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894212
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4115	NC_010996	CGAA	2	8	280644	280651	50 %	0 %	25 %	25 %	190894212
4116	NC_010996	AGG	2	6	280688	280693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894212
4117	NC_010996	TTTGC	2	10	280987	280996	0 %	60 %	20 %	20 %	190894213
4118	NC_010996	ATG	2	6	281016	281021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894213
4119	NC_010996	CGC	3	9	281072	281080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894213
4120	NC_010996	CCA	2	6	281095	281100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894213
4121	NC_010996	TCA	2	6	281134	281139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894213
4122	NC_010996	GCG	2	6	281167	281172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894213
4123	NC_010996	TGA	2	6	281242	281247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894213
4124	NC_010996	TCTAG	2	10	281309	281318	20 %	40 %	20 %	20 %	190894214
4125	NC_010996	GAT	2	6	281320	281325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894214
4126	NC_010996	TCG	2	6	281330	281335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894214
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4131	NC_010996	GAC	2	6	281495	281500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894214
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4149	NC_010996	GA	3	6	282662	282667	50 %	0 %	50 %	0 %	190894216
4150	NC_010996	CGA	2	6	282759	282764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894216
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4154	NC_010996	GC	4	8	282822	282829	0 %	0 %	50 %	50 %	190894217
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4156	NC_010996	GCTG	2	8	282903	282910	0 %	25 %	50 %	25 %	190894217
4157	NC_010996	GTCG	2	8	282915	282922	0 %	25 %	50 %	25 %	190894217
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4162	NC_010996	GTG	2	6	283097	283102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894217
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4228	NC_010996	TGC	2	6	286350	286355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894219
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4230	NC_010996	GTAC	2	8	286427	286434	25 %	25 %	25 %	25 %	190894219
4231	NC_010996	CAT	2	6	286493	286498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894219
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4236	NC_010996	AGGC	2	8	286663	286670	25 %	0 %	50 %	25 %	190894219
4237	NC_010996	GACC	2	8	286703	286710	25 %	0 %	25 %	50 %	190894219
4238	NC_010996	GTC	2	6	286745	286750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894219
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4242	NC_010996	TTC	2	6	286839	286844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894219
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4245	NC_010996	TCC	2	6	286866	286871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894219
4246	NC_010996	CCG	2	6	286888	286893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894219
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4343	NC_010996	GGGA	2	8	292392	292399	25 %	0 %	75 %	0 %	190894224
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4350	NC_010996	CT	3	6	292664	292669	0 %	50 %	0 %	50 %	190894224
4351	NC_010996	CGCA	2	8	293473	293480	25 %	0 %	25 %	50 %	190894225
4352	NC_010996	CGT	2	6	293539	293544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894225
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4357	NC_010996	CAG	2	6	293711	293716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894225
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4484	NC_010996	AAT	2	6	302487	302492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190894233
4485	NC_010996	GAT	2	6	302525	302530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894233
4486	NC_010996	CGGCGA	2	12	302581	302592	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190894233
4487	NC_010996	CGT	2	6	302609	302614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894233
4488	NC_010996	GAA	2	6	302663	302668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894233
4489	NC_010996	CG	3	6	302672	302677	0 %	0 %	50 %	50 %	190894233
4490	NC_010996	CTG	2	6	302734	302739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894233
4491	NC_010996	AGC	2	6	302789	302794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894233
4492	NC_010996	CGT	2	6	302903	302908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894233
4493	NC_010996	CGC	2	6	302965	302970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894233
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4496	NC_010996	CAT	2	6	303149	303154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894234
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4500	NC_010996	GAC	2	6	303246	303251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894234

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