MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 6146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010996	GAC	2	6	303282	303287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894234
4502	NC_010996	GAC	2	6	303389	303394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894234
4503	NC_010996	TCGT	2	8	303406	303413	0 %	50 %	25 %	25 %	190894234
4504	NC_010996	ACCG	2	8	303444	303451	25 %	0 %	25 %	50 %	190894234
4505	NC_010996	GCT	2	6	303506	303511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894234
4506	NC_010996	TC	3	6	303661	303666	0 %	50 %	0 %	50 %	190894234
4507	NC_010996	CAA	2	6	303698	303703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894234
4508	NC_010996	TCGATC	2	12	303708	303719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190894234
4509	NC_010996	CAA	2	6	303751	303756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894234
4510	NC_010996	GCG	2	6	303843	303848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894234
4511	NC_010996	GGT	2	6	303864	303869	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894234
4512	NC_010996	GTC	3	9	303906	303914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894234
4513	NC_010996	TAA	2	6	303932	303937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190894234
4514	NC_010996	TCGT	2	8	304074	304081	0 %	50 %	25 %	25 %	190894234
4515	NC_010996	TGCC	2	8	304111	304118	0 %	25 %	25 %	50 %	190894234
4516	NC_010996	CTG	2	6	304119	304124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894234
4517	NC_010996	TTC	2	6	304143	304148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894234
4518	NC_010996	TCA	2	6	304246	304251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894234
4519	NC_010996	GC	4	8	304296	304303	0 %	0 %	50 %	50 %	190894234
4520	NC_010996	CGCAG	2	10	304862	304871	20 %	0 %	40 %	40 %	190894236
4521	NC_010996	ACTG	2	8	304896	304903	25 %	25 %	25 %	25 %	190894236
4522	NC_010996	CCCG	2	8	304906	304913	0 %	0 %	25 %	75 %	190894236
4523	NC_010996	CGT	2	6	304935	304940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894236
4524	NC_010996	CT	3	6	304948	304953	0 %	50 %	0 %	50 %	190894236
4525	NC_010996	GTT	2	6	304984	304989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190894236
4526	NC_010996	C	6	6	305034	305039	0 %	0 %	0 %	100 %	190894236
4527	NC_010996	CGA	2	6	305096	305101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894236
4528	NC_010996	ATT	2	6	305142	305147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894236
4529	NC_010996	AGC	2	6	305173	305178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894236
4530	NC_010996	ATA	2	6	305222	305227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190894236
4531	NC_010996	ATCG	3	12	305244	305255	25 %	25 %	25 %	25 %	190894236
4532	NC_010996	ACG	2	6	305264	305269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894236
4533	NC_010996	CGA	2	6	305286	305291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894236
4534	NC_010996	AG	3	6	305391	305396	50 %	0 %	50 %	0 %	190894236
4535	NC_010996	ATC	2	6	305410	305415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894236
4536	NC_010996	GC	3	6	305426	305431	0 %	0 %	50 %	50 %	190894236
4537	NC_010996	CAG	2	6	305488	305493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894236
4538	NC_010996	GGT	2	6	305511	305516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894236
4539	NC_010996	T	6	6	305572	305577	0 %	100 %	0 %	0 %	190894236
4540	NC_010996	GC	3	6	305715	305720	0 %	0 %	50 %	50 %	190894236
4541	NC_010996	CGCC	2	8	305780	305787	0 %	0 %	25 %	75 %	190894236
4542	NC_010996	CTG	2	6	305800	305805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894236
4543	NC_010996	GCC	2	6	305970	305975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894236
4544	NC_010996	CTT	2	6	306019	306024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894236
4545	NC_010996	CAA	2	6	306033	306038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894236
4546	NC_010996	TCG	3	9	306064	306072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894236
4547	NC_010996	TGCG	2	8	306130	306137	0 %	25 %	50 %	25 %	190894236
4548	NC_010996	TCG	2	6	306211	306216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894236
4549	NC_010996	CTC	2	6	306217	306222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894236
4550	NC_010996	CGG	2	6	306243	306248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894236
4551	NC_010996	CGC	2	6	306296	306301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894236
4552	NC_010996	CGGG	2	8	306305	306312	0 %	0 %	75 %	25 %	190894236
4553	NC_010996	GCATC	2	10	306507	306516	20 %	20 %	20 %	40 %	190894236
4554	NC_010996	GAT	2	6	306759	306764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894237
4555	NC_010996	ACC	2	6	306905	306910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894237
4556	NC_010996	AGA	2	6	306921	306926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894237
4557	NC_010996	ATT	2	6	306935	306940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894237
4558	NC_010996	CG	3	6	306942	306947	0 %	0 %	50 %	50 %	190894237
4559	NC_010996	CATG	2	8	306948	306955	25 %	25 %	25 %	25 %	190894237
4560	NC_010996	GCC	2	6	307025	307030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894237
4561	NC_010996	GTC	2	6	307036	307041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894237
4562	NC_010996	GAA	2	6	307155	307160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894237
4563	NC_010996	CCA	2	6	307220	307225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894237
4564	NC_010996	CGT	2	6	307354	307359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894237
4565	NC_010996	TGG	2	6	307403	307408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894237
4566	NC_010996	CAT	2	6	307434	307439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894237
4567	NC_010996	TGA	2	6	307457	307462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894237
4568	NC_010996	ACG	2	6	307475	307480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894237
4569	NC_010996	TAAA	2	8	307496	307503	75 %	25 %	0 %	0 %	190894237
4570	NC_010996	G	6	6	307517	307522	0 %	0 %	100 %	0 %	190894237
4571	NC_010996	CTA	2	6	307572	307577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894237
4572	NC_010996	GGC	2	6	307642	307647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894237
4573	NC_010996	GAT	2	6	307705	307710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894237
4574	NC_010996	GA	3	6	307745	307750	50 %	0 %	50 %	0 %	190894237
4575	NC_010996	AGC	2	6	307851	307856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894237
4576	NC_010996	GTCGCG	2	12	307876	307887	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190894237
4577	NC_010996	TCG	2	6	307954	307959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894237
4578	NC_010996	CAT	2	6	308040	308045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894237
4579	NC_010996	CGT	2	6	308067	308072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894237
4580	NC_010996	CGC	2	6	308184	308189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894237
4581	NC_010996	GCG	2	6	308212	308217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894237
4582	NC_010996	GCA	2	6	308404	308409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894238
4583	NC_010996	CGC	2	6	308449	308454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894238
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4585	NC_010996	A	7	7	308643	308649	100 %	0 %	0 %	0 %	190894239
4586	NC_010996	CGA	2	6	308675	308680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894239
4587	NC_010996	CAG	2	6	308712	308717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894239
4588	NC_010996	TCG	2	6	308758	308763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894239
4589	NC_010996	CGC	2	6	308798	308803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894239
4590	NC_010996	GCG	2	6	308809	308814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894239
4591	NC_010996	CTG	2	6	308815	308820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894239
4592	NC_010996	AAAG	2	8	308904	308911	75 %	0 %	25 %	0 %	190894240
4593	NC_010996	TGA	2	6	308943	308948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894240
4594	NC_010996	GGC	2	6	308956	308961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894240
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4596	NC_010996	GCT	2	6	309165	309170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894241
4597	NC_010996	CGGAT	2	10	309188	309197	20 %	20 %	40 %	20 %	190894241
4598	NC_010996	ACC	2	6	309243	309248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894241
4599	NC_010996	AACG	2	8	309286	309293	50 %	0 %	25 %	25 %	190894241
4600	NC_010996	GCA	2	6	309317	309322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894241
4601	NC_010996	TCG	2	6	309461	309466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894241
4602	NC_010996	ACG	2	6	309476	309481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894241
4603	NC_010996	TGCG	2	8	309488	309495	0 %	25 %	50 %	25 %	190894241
4604	NC_010996	GTC	2	6	309523	309528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894241
4605	NC_010996	CGG	3	9	309555	309563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894241
4606	NC_010996	GA	3	6	309597	309602	50 %	0 %	50 %	0 %	190894241
4607	NC_010996	TCCGAT	2	12	309682	309693	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	190894241
4608	NC_010996	TTTTC	2	10	309771	309780	0 %	80 %	0 %	20 %	190894241
4609	NC_010996	ATC	2	6	309829	309834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894241
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4612	NC_010996	ATG	2	6	310508	310513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894242
4613	NC_010996	GGC	2	6	310519	310524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894242
4614	NC_010996	CCA	2	6	310639	310644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894242
4615	NC_010996	TG	3	6	310687	310692	0 %	50 %	50 %	0 %	190894242
4616	NC_010996	AT	3	6	310757	310762	50 %	50 %	0 %	0 %	190894242
4617	NC_010996	TCG	2	6	310772	310777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894242
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4619	NC_010996	CCA	2	6	311013	311018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894242
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4621	NC_010996	CAG	2	6	311101	311106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894242
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4988	NC_010996	AAG	2	6	341279	341284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894264
4989	NC_010996	GCG	2	6	341304	341309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894264
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4991	NC_010996	CGT	2	6	341482	341487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894265
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4993	NC_010996	TGA	2	6	341615	341620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894265
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5000	NC_010996	CGT	2	6	341999	342004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894265

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