MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia pickettii 12J chromosome 1

Total Repeats: 86235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010682	TAACGA	2	12	317	328	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	187927113
2	NC_010682	GCG	2	6	346	351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927113
3	NC_010682	CGC	2	6	377	382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927113
4	NC_010682	CGC	2	6	413	418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927113
5	NC_010682	TCGC	2	8	514	521	0 %	25 %	25 %	50 %	187927113
6	NC_010682	ACT	2	6	527	532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927113
7	NC_010682	GGC	2	6	588	593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927113
8	NC_010682	GCCG	2	8	666	673	0 %	0 %	50 %	50 %	187927113
9	NC_010682	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927113
10	NC_010682	GCC	3	9	757	765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927113
11	NC_010682	CGC	2	6	789	794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927113
12	NC_010682	GCC	2	6	822	827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927113
13	NC_010682	GCC	2	6	861	866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927113
14	NC_010682	GC	4	8	961	968	0 %	0 %	50 %	50 %	187927113
15	NC_010682	CAA	2	6	987	992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187927113
16	NC_010682	CGG	2	6	1026	1031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927113
17	NC_010682	CG	5	10	1094	1103	0 %	0 %	50 %	50 %	187927113
18	NC_010682	TGA	2	6	1170	1175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187927113
19	NC_010682	CTA	2	6	1185	1190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927113
20	NC_010682	CTCG	2	8	1194	1201	0 %	25 %	25 %	50 %	187927113
21	NC_010682	CTG	3	9	1204	1212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927113
22	NC_010682	TTC	2	6	1228	1233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187927113
23	NC_010682	CGCA	2	8	1246	1253	25 %	0 %	25 %	50 %	187927113
24	NC_010682	GAA	2	6	1255	1260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927113
25	NC_010682	TTC	2	6	1261	1266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187927113
26	NC_010682	CG	3	6	1294	1299	0 %	0 %	50 %	50 %	187927113
27	NC_010682	TCA	3	9	1304	1312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927113
28	NC_010682	CGA	2	6	1347	1352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927113
29	NC_010682	GCC	2	6	1398	1403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927113
30	NC_010682	TGA	2	6	1430	1435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187927113
31	NC_010682	GCAG	2	8	1443	1450	25 %	0 %	50 %	25 %	187927113
32	NC_010682	CTT	2	6	1479	1484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187927113
33	NC_010682	CGTG	2	8	1509	1516	0 %	25 %	50 %	25 %	187927113
34	NC_010682	GC	3	6	1526	1531	0 %	0 %	50 %	50 %	187927113
35	NC_010682	CTG	2	6	1609	1614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927113
36	NC_010682	AGA	2	6	1652	1657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927113
37	NC_010682	ACA	2	6	1673	1678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187927113
38	NC_010682	AAG	2	6	1702	1707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927113
39	NC_010682	GGCC	2	8	1709	1716	0 %	0 %	50 %	50 %	187927113
40	NC_010682	CG	3	6	1722	1727	0 %	0 %	50 %	50 %	187927113
41	NC_010682	AGA	2	6	1769	1774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927113
42	NC_010682	CGG	2	6	1800	1805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927113
43	NC_010682	ACCAC	2	10	1811	1820	40 %	0 %	0 %	60 %	187927113
44	NC_010682	TGC	2	6	1823	1828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927113
45	NC_010682	CGA	2	6	1848	1853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927113
46	NC_010682	CTG	2	6	2224	2229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927114
47	NC_010682	AC	3	6	2268	2273	50 %	0 %	0 %	50 %	187927114
48	NC_010682	CTG	2	6	2293	2298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927114
49	NC_010682	CAAG	2	8	2304	2311	50 %	0 %	25 %	25 %	187927114
50	NC_010682	TCCT	2	8	2323	2330	0 %	50 %	0 %	50 %	187927114
51	NC_010682	CAC	2	6	2355	2360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927114
52	NC_010682	GCG	2	6	2372	2377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927114
53	NC_010682	CCA	2	6	2396	2401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927114
54	NC_010682	GCC	2	6	2407	2412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927114
55	NC_010682	GCC	2	6	2527	2532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927114
56	NC_010682	GAA	2	6	2533	2538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927114
57	NC_010682	AGA	2	6	2591	2596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927114
58	NC_010682	CTA	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927114
59	NC_010682	TGC	2	6	2669	2674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927114
60	NC_010682	TGG	3	9	2675	2683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187927114
61	NC_010682	GCAA	2	8	2687	2694	50 %	0 %	25 %	25 %	187927114
62	NC_010682	GCG	2	6	2735	2740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927114
63	NC_010682	CGG	2	6	2769	2774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927114
64	NC_010682	ATC	2	6	2788	2793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927114
65	NC_010682	CTG	2	6	2824	2829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927114
66	NC_010682	GCA	2	6	2997	3002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927114
67	NC_010682	ACC	2	6	3028	3033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927114
68	NC_010682	CCA	2	6	3089	3094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927114
69	NC_010682	GAA	2	6	3106	3111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927114
70	NC_010682	GAA	2	6	3118	3123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927114
71	NC_010682	ACCT	2	8	3172	3179	25 %	25 %	0 %	50 %	187927114
72	NC_010682	TCA	2	6	3251	3256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927114
73	NC_010682	CGA	3	9	3264	3272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927114
74	NC_010682	CGT	2	6	3285	3290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927114
75	NC_010682	CCG	2	6	3469	3474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
76	NC_010682	CGC	2	6	3491	3496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
77	NC_010682	CAC	2	6	3582	3587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927115
78	NC_010682	CGA	2	6	3617	3622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927115
79	NC_010682	GAC	2	6	3726	3731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927115
80	NC_010682	AGCGC	2	10	3745	3754	20 %	0 %	40 %	40 %	187927115
81	NC_010682	GGC	2	6	3822	3827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927115
82	NC_010682	GGCGTG	2	12	3834	3845	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	187927115
83	NC_010682	CGTG	2	8	3847	3854	0 %	25 %	50 %	25 %	187927115
84	NC_010682	TGG	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187927115
85	NC_010682	CGC	2	6	3991	3996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
86	NC_010682	CAC	2	6	4010	4015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927115
87	NC_010682	CGA	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927115
88	NC_010682	AAC	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187927115
89	NC_010682	GAA	2	6	4170	4175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927115
90	NC_010682	GCG	2	6	4192	4197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927115
91	NC_010682	CAA	2	6	4220	4225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187927115
92	NC_010682	TGC	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927115
93	NC_010682	TCT	2	6	4252	4257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187927115
94	NC_010682	ACG	2	6	4309	4314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927115
95	NC_010682	CAA	2	6	4343	4348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187927115
96	NC_010682	CGG	2	6	4364	4369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927115
97	NC_010682	CACC	2	8	4370	4377	25 %	0 %	0 %	75 %	187927115
98	NC_010682	GC	3	6	4388	4393	0 %	0 %	50 %	50 %	187927115
99	NC_010682	CG	3	6	4402	4407	0 %	0 %	50 %	50 %	187927115
100	NC_010682	TCA	2	6	4408	4413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927115
101	NC_010682	CGA	2	6	4469	4474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927115
102	NC_010682	CTCGT	2	10	4551	4560	0 %	40 %	20 %	40 %	187927115
103	NC_010682	GAA	2	6	4581	4586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927115
104	NC_010682	GTC	2	6	4587	4592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927115
105	NC_010682	CTG	2	6	4614	4619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927115
106	NC_010682	ATC	2	6	4641	4646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927115
107	NC_010682	CG	4	8	4671	4678	0 %	0 %	50 %	50 %	187927115
108	NC_010682	GCC	2	6	4683	4688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
109	NC_010682	CGC	2	6	4710	4715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
110	NC_010682	TCG	2	6	4798	4803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927115
111	NC_010682	GC	5	10	4895	4904	0 %	0 %	50 %	50 %	187927115
112	NC_010682	CCAG	2	8	4921	4928	25 %	0 %	25 %	50 %	187927115
113	NC_010682	TCA	2	6	4942	4947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927115
114	NC_010682	GAC	2	6	4974	4979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927115
115	NC_010682	ACC	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927115
116	NC_010682	CAT	4	12	5009	5020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927115
117	NC_010682	GCT	3	9	5057	5065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927115
118	NC_010682	TTC	2	6	5070	5075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187927115
119	NC_010682	ATC	2	6	5094	5099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927115
120	NC_010682	GCC	2	6	5126	5131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
121	NC_010682	GCC	2	6	5190	5195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
122	NC_010682	CCG	2	6	5221	5226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
123	NC_010682	GACGCC	2	12	5334	5345	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187927115
124	NC_010682	GC	3	6	5348	5353	0 %	0 %	50 %	50 %	187927115
125	NC_010682	CTG	2	6	5430	5435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927115
126	NC_010682	CAG	2	6	5453	5458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927115
127	NC_010682	CGG	2	6	5465	5470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927115
128	NC_010682	ACG	2	6	5497	5502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927115
129	NC_010682	AGA	2	6	5503	5508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927115
130	NC_010682	CAT	2	6	5522	5527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927115
131	NC_010682	GTC	2	6	5529	5534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927115
132	NC_010682	CGC	2	6	5535	5540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
133	NC_010682	CCG	2	6	5617	5622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
134	NC_010682	CGC	2	6	5711	5716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
135	NC_010682	GCT	2	6	5726	5731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927115
136	NC_010682	GCG	2	6	5746	5751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927115
137	NC_010682	GCC	2	6	5755	5760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
138	NC_010682	AGC	2	6	5794	5799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927115
139	NC_010682	ACC	2	6	5808	5813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927115
140	NC_010682	GCC	2	6	5830	5835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927115
141	NC_010682	TGC	2	6	5836	5841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927115
142	NC_010682	CAC	2	6	5882	5887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927115
143	NC_010682	CGA	2	6	5897	5902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927115
144	NC_010682	TGG	2	6	5941	5946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187927115
145	NC_010682	GCTC	2	8	6299	6306	0 %	25 %	25 %	50 %	187927116
146	NC_010682	AGC	2	6	6325	6330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927116
147	NC_010682	GTC	2	6	6395	6400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927116
148	NC_010682	TGC	2	6	6598	6603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927116
149	NC_010682	ACG	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927116
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151	NC_010682	TTC	2	6	6831	6836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187927116
152	NC_010682	GCT	2	6	6913	6918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927116
153	NC_010682	TGG	2	6	6927	6932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187927116
154	NC_010682	CAA	2	6	6985	6990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187927116
155	NC_010682	TCG	2	6	7009	7014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187927116
156	NC_010682	ACC	2	6	7054	7059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927116
157	NC_010682	GCA	2	6	7091	7096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927116
158	NC_010682	TCT	2	6	7185	7190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187927116
159	NC_010682	AGG	2	6	7315	7320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187927116
160	NC_010682	CTT	2	6	7321	7326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187927116
161	NC_010682	GCG	2	6	7331	7336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927116
162	NC_010682	GA	3	6	7376	7381	50 %	0 %	50 %	0 %	187927116
163	NC_010682	ATC	2	6	7417	7422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927116
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165	NC_010682	TAG	2	6	7479	7484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187927116
166	NC_010682	GAG	2	6	7574	7579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187927116
167	NC_010682	CCA	2	6	7604	7609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927116
168	NC_010682	AAG	2	6	7619	7624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187927116
169	NC_010682	CT	3	6	7683	7688	0 %	50 %	0 %	50 %	187927116
170	NC_010682	TGTC	2	8	7707	7714	0 %	50 %	25 %	25 %	187927116
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173	NC_010682	GTT	2	6	7781	7786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187927116
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176	NC_010682	ATG	2	6	7899	7904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187927116
177	NC_010682	TGCCAG	2	12	7932	7943	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187927116
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179	NC_010682	GCG	2	6	8219	8224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927116
180	NC_010682	GGCG	2	8	8311	8318	0 %	0 %	75 %	25 %	187927116
181	NC_010682	G	6	6	8345	8350	0 %	0 %	100 %	0 %	187927116
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183	NC_010682	GAT	2	6	8502	8507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187927117
184	NC_010682	GCG	2	6	8536	8541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927117
185	NC_010682	CTA	2	6	8609	8614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927117
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189	NC_010682	CCA	2	6	8777	8782	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927117
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191	NC_010682	C	6	6	9076	9081	0 %	0 %	0 %	100 %	187927118
192	NC_010682	CGC	2	6	9101	9106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927118
193	NC_010682	GCCA	2	8	9134	9141	25 %	0 %	25 %	50 %	187927118
194	NC_010682	TCA	2	6	9175	9180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927118
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203	NC_010682	CGCAG	2	10	10504	10513	20 %	0 %	40 %	40 %	187927119
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222	NC_010682	CGA	2	6	11334	11339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927120
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239	NC_010682	GC	3	6	12097	12102	0 %	0 %	50 %	50 %	187927121
240	NC_010682	GTT	2	6	12132	12137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187927121
241	NC_010682	GTG	2	6	12710	12715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187927122
242	NC_010682	GCG	2	6	12728	12733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927122
243	NC_010682	GACC	2	8	12957	12964	25 %	0 %	25 %	50 %	187927122
244	NC_010682	TCA	2	6	12966	12971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187927122
245	NC_010682	TTC	2	6	13057	13062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187927122
246	NC_010682	AAC	2	6	13114	13119	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187927122
247	NC_010682	ATTCA	2	10	13125	13134	40 %	40 %	0 %	20 %	187927122
248	NC_010682	GAAG	2	8	13217	13224	50 %	0 %	50 %	0 %	187927122
249	NC_010682	GAC	2	6	13328	13333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927122
250	NC_010682	ACA	2	6	13347	13352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187927122
251	NC_010682	CCG	2	6	13419	13424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927122
252	NC_010682	CGG	2	6	13525	13530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927122
253	NC_010682	CTTAGG	2	12	13683	13694	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187927123
254	NC_010682	GCC	3	9	13707	13715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927123
255	NC_010682	TGT	2	6	13775	13780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187927123
256	NC_010682	GCC	2	6	13782	13787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927123
257	NC_010682	GCC	2	6	13845	13850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927123
258	NC_010682	CTGT	2	8	13852	13859	0 %	50 %	25 %	25 %	187927123
259	NC_010682	GCC	2	6	13860	13865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927123
260	NC_010682	CGC	2	6	13889	13894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187927123
261	NC_010682	CAC	2	6	13895	13900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187927123
262	NC_010682	GCG	2	6	13981	13986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187927123
263	NC_010682	CAG	2	6	13998	14003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187927123
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