MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_010263	CAG	2	6	1014991	1014996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933656
19503	NC_010263	CAA	2	6	1015117	1015122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933656
19504	NC_010263	AGA	2	6	1015155	1015160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933656
19505	NC_010263	TTA	2	6	1015161	1015166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933656
19506	NC_010263	TGC	2	6	1015169	1015174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933656
19507	NC_010263	TGT	2	6	1015196	1015201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933656
19508	NC_010263	TTA	2	6	1015288	1015293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933656
19509	NC_010263	AGC	2	6	1015307	1015312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933656
19510	NC_010263	CAC	2	6	1015393	1015398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165933656
19511	NC_010263	GTT	2	6	1015479	1015484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933656
19512	NC_010263	AGT	2	6	1015547	1015552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933656
19513	NC_010263	CCG	2	6	1015647	1015652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933656
19514	NC_010263	AATA	2	8	1015714	1015721	75 %	25 %	0 %	0 %	165933656
19515	NC_010263	CAC	2	6	1015738	1015743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165933656
19516	NC_010263	CGA	2	6	1015801	1015806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933656
19517	NC_010263	ATT	2	6	1015835	1015840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933656
19518	NC_010263	TAG	2	6	1015846	1015851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933656
19519	NC_010263	TTACCG	2	12	1015902	1015913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	165933656
19520	NC_010263	GTA	2	6	1015968	1015973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933656
19521	NC_010263	TTG	2	6	1015993	1015998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933656
19522	NC_010263	AAT	2	6	1016009	1016014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933656
19523	NC_010263	GTT	2	6	1016024	1016029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933656
19524	NC_010263	GTA	2	6	1016037	1016042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933656
19525	NC_010263	CTTG	2	8	1016050	1016057	0 %	50 %	25 %	25 %	165933656
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19527	NC_010263	ATT	2	6	1016144	1016149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933656
19528	NC_010263	GTA	2	6	1016178	1016183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933656
19529	NC_010263	ATT	2	6	1016231	1016236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933656
19530	NC_010263	AAC	2	6	1016285	1016290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933656
19531	NC_010263	TTA	2	6	1016322	1016327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933656
19532	NC_010263	CAT	2	6	1016368	1016373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933656
19533	NC_010263	GAATG	2	10	1016375	1016384	40 %	20 %	40 %	0 %	165933656
19534	NC_010263	ATG	2	6	1016453	1016458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933656
19535	NC_010263	TTGT	2	8	1016543	1016550	0 %	75 %	25 %	0 %	165933656
19536	NC_010263	CTA	2	6	1016587	1016592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933656
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19538	NC_010263	AGT	2	6	1016711	1016716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933656
19539	NC_010263	TTA	2	6	1016745	1016750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933656
19540	NC_010263	GTA	3	9	1016829	1016837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933656
19541	NC_010263	TAG	2	6	1016842	1016847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933656
19542	NC_010263	AATT	2	8	1016911	1016918	50 %	50 %	0 %	0 %	165933656
19543	NC_010263	ATT	2	6	1016975	1016980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933656
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19546	NC_010263	GCA	2	6	1017015	1017020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933656
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19549	NC_010263	TAT	3	9	1017160	1017168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933656
19550	NC_010263	CAA	2	6	1017232	1017237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933656
19551	NC_010263	TAGCTA	2	12	1017253	1017264	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	165933656
19552	NC_010263	AATCAA	2	12	1017265	1017276	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	165933656
19553	NC_010263	ATT	2	6	1017284	1017289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933656
19554	NC_010263	TTAAT	2	10	1017301	1017310	40 %	60 %	0 %	0 %	165933656
19555	NC_010263	ACC	2	6	1017314	1017319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165933656
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19559	NC_010263	T	7	7	1017385	1017391	0 %	100 %	0 %	0 %	165933656
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19597	NC_010263	CAG	2	6	1019445	1019450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319717303
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