MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_010263	TAA	2	6	818538	818543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933447
16003	NC_010263	ATC	2	6	818587	818592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933447
16004	NC_010263	AGC	2	6	818602	818607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933447
16005	NC_010263	TCT	2	6	818610	818615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933447
16006	NC_010263	ATT	2	6	818628	818633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933447
16007	NC_010263	TGG	2	6	818711	818716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165933447
16008	NC_010263	GAA	2	6	818734	818739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933447
16009	NC_010263	A	7	7	819002	819008	100 %	0 %	0 %	0 %	165933448
16010	NC_010263	ATT	2	6	819044	819049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933448
16011	NC_010263	ATTA	2	8	819100	819107	50 %	50 %	0 %	0 %	165933448
16012	NC_010263	ATG	2	6	819119	819124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933448
16013	NC_010263	T	6	6	819382	819387	0 %	100 %	0 %	0 %	165933449
16014	NC_010263	ATC	2	6	819406	819411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933449
16015	NC_010263	AT	3	6	819453	819458	50 %	50 %	0 %	0 %	165933449
16016	NC_010263	AAT	2	6	819491	819496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933449
16017	NC_010263	T	7	7	819507	819513	0 %	100 %	0 %	0 %	165933449
16018	NC_010263	TCTA	2	8	819708	819715	25 %	50 %	0 %	25 %	165933449
16019	NC_010263	ACAA	2	8	819729	819736	75 %	0 %	0 %	25 %	165933449
16020	NC_010263	ACG	2	6	819775	819780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933449
16021	NC_010263	GCC	2	6	819795	819800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933449
16022	NC_010263	GCC	2	6	819854	819859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933449
16023	NC_010263	CAG	2	6	819910	819915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933449
16024	NC_010263	GA	3	6	819990	819995	50 %	0 %	50 %	0 %	165933449
16025	NC_010263	T	6	6	820026	820031	0 %	100 %	0 %	0 %	165933449
16026	NC_010263	TAT	2	6	820094	820099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933449
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16028	NC_010263	TTC	2	6	820183	820188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933449
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16032	NC_010263	GTT	2	6	820367	820372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933449
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16035	NC_010263	CTT	3	9	820406	820414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933449
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16037	NC_010263	TA	3	6	820475	820480	50 %	50 %	0 %	0 %	165933449
16038	NC_010263	AAT	2	6	820496	820501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933449
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16045	NC_010263	AAG	2	6	821001	821006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933449
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16051	NC_010263	TTAA	2	8	821263	821270	50 %	50 %	0 %	0 %	165933449
16052	NC_010263	TAT	2	6	821476	821481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933450
16053	NC_010263	TCA	2	6	821529	821534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933450
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16056	NC_010263	CTTAT	2	10	821718	821727	20 %	60 %	0 %	20 %	165933450
16057	NC_010263	AT	3	6	821734	821739	50 %	50 %	0 %	0 %	165933450
16058	NC_010263	CTA	2	6	821763	821768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933450
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16094	NC_010263	A	7	7	824658	824664	100 %	0 %	0 %	0 %	165933454
16095	NC_010263	AT	3	6	824747	824752	50 %	50 %	0 %	0 %	165933454
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16118	NC_010263	TCA	2	6	827164	827169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933462
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