MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_010263	TCG	2	6	736005	736010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933349
14502	NC_010263	TAT	3	9	736018	736026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933349
14503	NC_010263	CTC	2	6	736035	736040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165933349
14504	NC_010263	TAT	2	6	736132	736137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933349
14505	NC_010263	CATA	2	8	736167	736174	50 %	25 %	0 %	25 %	165933349
14506	NC_010263	TACTG	2	10	736262	736271	20 %	40 %	20 %	20 %	165933350
14507	NC_010263	A	6	6	736309	736314	100 %	0 %	0 %	0 %	165933350
14508	NC_010263	TA	3	6	736350	736355	50 %	50 %	0 %	0 %	165933350
14509	NC_010263	ATAA	2	8	736367	736374	75 %	25 %	0 %	0 %	165933350
14510	NC_010263	TTTC	2	8	736399	736406	0 %	75 %	0 %	25 %	165933350
14511	NC_010263	GCG	2	6	736431	736436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933350
14512	NC_010263	A	6	6	736449	736454	100 %	0 %	0 %	0 %	165933350
14513	NC_010263	TATT	2	8	736516	736523	25 %	75 %	0 %	0 %	165933350
14514	NC_010263	ATA	2	6	736530	736535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933350
14515	NC_010263	TGA	2	6	736558	736563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933350
14516	NC_010263	A	7	7	736566	736572	100 %	0 %	0 %	0 %	165933350
14517	NC_010263	AAT	2	6	736576	736581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933350
14518	NC_010263	AAC	2	6	736687	736692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933350
14519	NC_010263	ACA	2	6	736699	736704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933350
14520	NC_010263	CTAG	2	8	736709	736716	25 %	25 %	25 %	25 %	165933350
14521	NC_010263	TAT	2	6	736767	736772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933350
14522	NC_010263	AT	3	6	736806	736811	50 %	50 %	0 %	0 %	165933350
14523	NC_010263	T	7	7	736826	736832	0 %	100 %	0 %	0 %	165933350
14524	NC_010263	CGT	2	6	736835	736840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933350
14525	NC_010263	CAG	2	6	736869	736874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933350
14526	NC_010263	ATC	2	6	736911	736916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933350
14527	NC_010263	CCA	2	6	736977	736982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165933350
14528	NC_010263	ATT	4	12	736994	737005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933350
14529	NC_010263	GTG	2	6	737021	737026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165933350
14530	NC_010263	A	6	6	737106	737111	100 %	0 %	0 %	0 %	165933351
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14532	NC_010263	TTA	2	6	737188	737193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933351
14533	NC_010263	AGA	2	6	737224	737229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933351
14534	NC_010263	AAT	2	6	737239	737244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933351
14535	NC_010263	TAA	2	6	737278	737283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933351
14536	NC_010263	GCT	2	6	737284	737289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933351
14537	NC_010263	ATA	3	9	737295	737303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933351
14538	NC_010263	CTC	2	6	737322	737327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165933351
14539	NC_010263	ATTT	2	8	737352	737359	25 %	75 %	0 %	0 %	165933351
14540	NC_010263	GCA	2	6	737396	737401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933351
14541	NC_010263	AGCTA	2	10	737424	737433	40 %	20 %	20 %	20 %	165933351
14542	NC_010263	TGA	2	6	737434	737439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933351
14543	NC_010263	CCA	2	6	737479	737484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165933351
14544	NC_010263	AT	3	6	737564	737569	50 %	50 %	0 %	0 %	165933351
14545	NC_010263	ATA	2	6	737580	737585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933351
14546	NC_010263	AAT	2	6	737597	737602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933351
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14548	NC_010263	ACT	2	6	737621	737626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933351
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14550	NC_010263	A	7	7	737681	737687	100 %	0 %	0 %	0 %	165933351
14551	NC_010263	TGA	2	6	737701	737706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933351
14552	NC_010263	ATTTT	2	10	737787	737796	20 %	80 %	0 %	0 %	165933351
14553	NC_010263	TAA	2	6	737808	737813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933351
14554	NC_010263	CAAA	2	8	737884	737891	75 %	0 %	0 %	25 %	165933351
14555	NC_010263	ATA	2	6	737906	737911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933351
14556	NC_010263	TAA	2	6	737920	737925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933351
14557	NC_010263	CTA	2	6	738085	738090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933352
14558	NC_010263	A	7	7	738173	738179	100 %	0 %	0 %	0 %	165933352
14559	NC_010263	TTA	2	6	738293	738298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933353
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14561	NC_010263	CGG	2	6	738379	738384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933353
14562	NC_010263	AT	3	6	738388	738393	50 %	50 %	0 %	0 %	165933353
14563	NC_010263	TTA	3	9	738399	738407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933353
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14569	NC_010263	GAA	2	6	738605	738610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933353
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14571	NC_010263	AAAGT	2	10	738668	738677	60 %	20 %	20 %	0 %	165933353
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14574	NC_010263	ATCTT	2	10	738756	738765	20 %	60 %	0 %	20 %	165933353
14575	NC_010263	T	6	6	738768	738773	0 %	100 %	0 %	0 %	165933353
14576	NC_010263	GCGA	2	8	738840	738847	25 %	0 %	50 %	25 %	165933353
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14581	NC_010263	TGC	2	6	739142	739147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933355
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14587	NC_010263	TTC	2	6	739415	739420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933355
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14589	NC_010263	CCTG	2	8	739491	739498	0 %	25 %	25 %	50 %	165933355
14590	NC_010263	AGCA	2	8	739547	739554	50 %	0 %	25 %	25 %	165933355
14591	NC_010263	CTG	2	6	739597	739602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933355
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14593	NC_010263	CAACA	2	10	739706	739715	60 %	0 %	0 %	40 %	165933355
14594	NC_010263	TAC	2	6	739724	739729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933355
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14597	NC_010263	ACG	2	6	739922	739927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933355
14598	NC_010263	TA	3	6	739952	739957	50 %	50 %	0 %	0 %	165933355
14599	NC_010263	CTA	3	9	739966	739974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933355
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14601	NC_010263	GTA	2	6	740076	740081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933355
14602	NC_010263	TTTA	2	8	740111	740118	25 %	75 %	0 %	0 %	165933355
14603	NC_010263	ACT	2	6	740217	740222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933355
14604	NC_010263	TAGC	2	8	740233	740240	25 %	25 %	25 %	25 %	165933355
14605	NC_010263	T	6	6	740242	740247	0 %	100 %	0 %	0 %	165933355
14606	NC_010263	GCT	2	6	740301	740306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933355
14607	NC_010263	GAA	2	6	740319	740324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933355
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14609	NC_010263	AGC	2	6	740420	740425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933355
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14611	NC_010263	GTA	2	6	740733	740738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933356
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14613	NC_010263	TC	3	6	740813	740818	0 %	50 %	0 %	50 %	165933356
14614	NC_010263	CTTG	2	8	740885	740892	0 %	50 %	25 %	25 %	165933356
14615	NC_010263	AAAAT	2	10	740895	740904	80 %	20 %	0 %	0 %	165933356
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