MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13502	NC_010263	CTA	2	6	681593	681598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933283
13503	NC_010263	GTT	2	6	681599	681604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933283
13504	NC_010263	AAAT	2	8	681615	681622	75 %	25 %	0 %	0 %	165933283
13505	NC_010263	AAT	2	6	681646	681651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933283
13506	NC_010263	TTA	2	6	681670	681675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933283
13507	NC_010263	AGA	2	6	681681	681686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933283
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13509	NC_010263	TAG	2	6	681717	681722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933283
13510	NC_010263	TAT	2	6	681725	681730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933283
13511	NC_010263	AAG	2	6	681740	681745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933283
13512	NC_010263	GGC	2	6	681939	681944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933283
13513	NC_010263	T	7	7	681987	681993	0 %	100 %	0 %	0 %	165933283
13514	NC_010263	AAT	2	6	681994	681999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933283
13515	NC_010263	AACTA	2	10	682017	682026	60 %	20 %	0 %	20 %	165933283
13516	NC_010263	GGA	2	6	682092	682097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165933283
13517	NC_010263	TGA	2	6	682152	682157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933283
13518	NC_010263	TAA	2	6	682236	682241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933283
13519	NC_010263	TTA	2	6	682294	682299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933283
13520	NC_010263	A	6	6	682311	682316	100 %	0 %	0 %	0 %	165933283
13521	NC_010263	TGC	2	6	682320	682325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933283
13522	NC_010263	TAA	2	6	682344	682349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933283
13523	NC_010263	AATT	2	8	682373	682380	50 %	50 %	0 %	0 %	165933283
13524	NC_010263	TAGA	2	8	682405	682412	50 %	25 %	25 %	0 %	165933283
13525	NC_010263	A	6	6	682471	682476	100 %	0 %	0 %	0 %	165933284
13526	NC_010263	TAC	2	6	682477	682482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933284
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13529	NC_010263	GAAAA	2	10	682623	682632	80 %	0 %	20 %	0 %	165933284
13530	NC_010263	TAA	3	9	682636	682644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933284
13531	NC_010263	GGC	3	9	682664	682672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933284
13532	NC_010263	ATA	2	6	682727	682732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933284
13533	NC_010263	TA	3	6	682862	682867	50 %	50 %	0 %	0 %	165933284
13534	NC_010263	TCA	2	6	682885	682890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933284
13535	NC_010263	TGA	2	6	682903	682908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933284
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13537	NC_010263	CGG	2	6	682945	682950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933284
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13539	NC_010263	GAA	2	6	683048	683053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933284
13540	NC_010263	CTA	2	6	683091	683096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933284
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13542	NC_010263	TTG	2	6	683241	683246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933284
13543	NC_010263	TTA	2	6	683273	683278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933284
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13545	NC_010263	A	6	6	683316	683321	100 %	0 %	0 %	0 %	165933284
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13548	NC_010263	ATCAA	2	10	683401	683410	60 %	20 %	0 %	20 %	165933284
13549	NC_010263	CT	3	6	683425	683430	0 %	50 %	0 %	50 %	165933284
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13551	NC_010263	ATA	2	6	683442	683447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933284
13552	NC_010263	ATA	2	6	683460	683465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933284
13553	NC_010263	CAG	2	6	683514	683519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933284
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13558	NC_010263	AT	3	6	683614	683619	50 %	50 %	0 %	0 %	165933284
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13605	NC_010263	AAT	2	6	685845	685850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933286
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13989	NC_010263	AAG	2	6	702077	702082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933312
13990	NC_010263	AG	3	6	702081	702086	50 %	0 %	50 %	0 %	165933312
13991	NC_010263	ATT	2	6	702150	702155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933312
13992	NC_010263	TAT	2	6	702239	702244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933312
13993	NC_010263	CAA	2	6	702245	702250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933312
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