MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_010263	CCG	2	6	627017	627022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933231
12502	NC_010263	CTT	2	6	627027	627032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933231
12503	NC_010263	AAT	2	6	627086	627091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933231
12504	NC_010263	ACCGG	2	10	627095	627104	20 %	0 %	40 %	40 %	165933231
12505	NC_010263	TAT	2	6	627109	627114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933231
12506	NC_010263	ACA	2	6	627116	627121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933231
12507	NC_010263	TAT	2	6	627126	627131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933231
12508	NC_010263	TCT	2	6	627305	627310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933232
12509	NC_010263	AT	3	6	627321	627326	50 %	50 %	0 %	0 %	165933232
12510	NC_010263	TTTGT	2	10	627343	627352	0 %	80 %	20 %	0 %	165933232
12511	NC_010263	TAT	2	6	627703	627708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933233
12512	NC_010263	CCT	2	6	627738	627743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165933233
12513	NC_010263	T	7	7	627754	627760	0 %	100 %	0 %	0 %	165933233
12514	NC_010263	CAAA	2	8	627848	627855	75 %	0 %	0 %	25 %	165933233
12515	NC_010263	TAA	2	6	627864	627869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933233
12516	NC_010263	ATTA	2	8	627884	627891	50 %	50 %	0 %	0 %	165933233
12517	NC_010263	CTG	2	6	627921	627926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933233
12518	NC_010263	ATCA	2	8	628026	628033	50 %	25 %	0 %	25 %	165933233
12519	NC_010263	TTCC	2	8	628107	628114	0 %	50 %	0 %	50 %	165933233
12520	NC_010263	TACAAT	2	12	628129	628140	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	165933233
12521	NC_010263	GAA	2	6	628340	628345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933234
12522	NC_010263	ATG	2	6	628395	628400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933234
12523	NC_010263	A	6	6	628429	628434	100 %	0 %	0 %	0 %	165933234
12524	NC_010263	CA	3	6	628435	628440	50 %	0 %	0 %	50 %	165933234
12525	NC_010263	CTA	2	6	628449	628454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933234
12526	NC_010263	TTG	2	6	628536	628541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933234
12527	NC_010263	AAT	2	6	628623	628628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933235
12528	NC_010263	TAT	2	6	628644	628649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933235
12529	NC_010263	T	7	7	628649	628655	0 %	100 %	0 %	0 %	165933235
12530	NC_010263	TAT	2	6	631312	631317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933236
12531	NC_010263	ACT	2	6	631319	631324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933236
12532	NC_010263	GCT	2	6	631356	631361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933236
12533	NC_010263	ATC	2	6	631443	631448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933236
12534	NC_010263	TAG	2	6	631460	631465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933236
12535	NC_010263	A	6	6	631511	631516	100 %	0 %	0 %	0 %	165933236
12536	NC_010263	TGC	2	6	631553	631558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933236
12537	NC_010263	GAA	2	6	631829	631834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933237
12538	NC_010263	CCA	2	6	631844	631849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165933237
12539	NC_010263	AAT	2	6	631867	631872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933237
12540	NC_010263	AAG	2	6	631910	631915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933237
12541	NC_010263	TGA	2	6	631966	631971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933237
12542	NC_010263	ATG	2	6	631983	631988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933237
12543	NC_010263	ACCGCT	2	12	631999	632010	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	165933237
12544	NC_010263	TGG	2	6	632029	632034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165933237
12545	NC_010263	GAT	2	6	632042	632047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933237
12546	NC_010263	CTA	2	6	632064	632069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933237
12547	NC_010263	GAA	2	6	632072	632077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933237
12548	NC_010263	ATG	2	6	632242	632247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933238
12549	NC_010263	AGA	2	6	632252	632257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933238
12550	NC_010263	ATA	2	6	632296	632301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933238
12551	NC_010263	A	8	8	632879	632886	100 %	0 %	0 %	0 %	165933239
12552	NC_010263	ACA	2	6	632907	632912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933239
12553	NC_010263	TACT	2	8	632925	632932	25 %	50 %	0 %	25 %	165933239
12554	NC_010263	ATTT	2	8	632991	632998	25 %	75 %	0 %	0 %	165933239
12555	NC_010263	TTA	2	6	633013	633018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933239
12556	NC_010263	AT	3	6	633055	633060	50 %	50 %	0 %	0 %	165933239
12557	NC_010263	CGG	2	6	633103	633108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933239
12558	NC_010263	CTT	2	6	633136	633141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933239
12559	NC_010263	GAT	2	6	633152	633157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933239
12560	NC_010263	TGC	2	6	633202	633207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933239
12561	NC_010263	TCAT	2	8	633277	633284	25 %	50 %	0 %	25 %	165933239
12562	NC_010263	TAT	2	6	633289	633294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933239
12563	NC_010263	TTA	2	6	633300	633305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933239
12564	NC_010263	GAA	2	6	633398	633403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933239
12565	NC_010263	TCA	2	6	633460	633465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933239
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12567	NC_010263	TAAA	2	8	633552	633559	75 %	25 %	0 %	0 %	165933239
12568	NC_010263	TTA	2	6	633587	633592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933239
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12571	NC_010263	TAA	2	6	633643	633648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933239
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12574	NC_010263	CTG	2	6	633756	633761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933239
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12581	NC_010263	A	7	7	634013	634019	100 %	0 %	0 %	0 %	165933239
12582	NC_010263	AT	4	8	634027	634034	50 %	50 %	0 %	0 %	165933239
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12591	NC_010263	TCGA	2	8	634558	634565	25 %	25 %	25 %	25 %	165933239
12592	NC_010263	GAA	2	6	634667	634672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933239
12593	NC_010263	AGTA	2	8	634686	634693	50 %	25 %	25 %	0 %	165933239
12594	NC_010263	AT	3	6	634781	634786	50 %	50 %	0 %	0 %	165933240
12595	NC_010263	AT	3	6	634826	634831	50 %	50 %	0 %	0 %	165933240
12596	NC_010263	GTA	2	6	635039	635044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933241
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12602	NC_010263	A	6	6	635596	635601	100 %	0 %	0 %	0 %	165933242
12603	NC_010263	GAA	2	6	635616	635621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933242
12604	NC_010263	CGA	2	6	635633	635638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933242
12605	NC_010263	T	7	7	635702	635708	0 %	100 %	0 %	0 %	165933242
12606	NC_010263	AAT	2	6	635730	635735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933242
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12610	NC_010263	GCA	2	6	635924	635929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933242
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12617	NC_010263	AT	3	6	636287	636292	50 %	50 %	0 %	0 %	165933242
12618	NC_010263	CGT	2	6	636309	636314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933242
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