MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 24582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_010263	TTA	2	6	601155	601160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933207
12003	NC_010263	TAG	2	6	601186	601191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933207
12004	NC_010263	ATT	2	6	601214	601219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933207
12005	NC_010263	ACT	2	6	601409	601414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933207
12006	NC_010263	CTA	2	6	601447	601452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933207
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12008	NC_010263	TTCTA	2	10	601481	601490	20 %	60 %	0 %	20 %	165933207
12009	NC_010263	AGC	2	6	601496	601501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933207
12010	NC_010263	TA	3	6	601549	601554	50 %	50 %	0 %	0 %	165933207
12011	NC_010263	AAG	2	6	601583	601588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933207
12012	NC_010263	TAA	2	6	601628	601633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933207
12013	NC_010263	T	6	6	601634	601639	0 %	100 %	0 %	0 %	165933207
12014	NC_010263	GTA	2	6	601729	601734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933207
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12017	NC_010263	ATA	2	6	601815	601820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933207
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12022	NC_010263	GAT	2	6	602101	602106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933208
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12026	NC_010263	TAG	2	6	602171	602176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933208
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12053	NC_010263	CATC	2	8	603073	603080	25 %	25 %	0 %	50 %	165933208
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12055	NC_010263	GTA	2	6	603202	603207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933208
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12064	NC_010263	TGCT	2	8	603398	603405	0 %	50 %	25 %	25 %	165933208
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12116	NC_010263	TTAT	2	8	605797	605804	25 %	75 %	0 %	0 %	165933210
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12484	NC_010263	TAT	2	6	626478	626483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933231
12485	NC_010263	TTA	2	6	626514	626519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933231
12486	NC_010263	GCT	2	6	626573	626578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933231
12487	NC_010263	AT	3	6	626605	626610	50 %	50 %	0 %	0 %	165933231
12488	NC_010263	CGC	2	6	626661	626666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933231
12489	NC_010263	TGA	2	6	626709	626714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933231
12490	NC_010263	A	6	6	626718	626723	100 %	0 %	0 %	0 %	165933231
12491	NC_010263	GTTT	2	8	626763	626770	0 %	75 %	25 %	0 %	165933231
12492	NC_010263	CCTGCT	2	12	626783	626794	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	165933231
12493	NC_010263	AAT	3	9	626797	626805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933231
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12497	NC_010263	TTTA	2	8	626863	626870	25 %	75 %	0 %	0 %	165933231
12498	NC_010263	AT	3	6	626896	626901	50 %	50 %	0 %	0 %	165933231
12499	NC_010263	GCT	2	6	626915	626920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933231
12500	NC_010263	TTA	2	6	626937	626942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933231

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