MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_010168	GC	3	6	2842942	2842947	0 %	0 %	50 %	50 %	163841921
48502	NC_010168	CTG	2	6	2842977	2842982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841921
48503	NC_010168	GAT	2	6	2842992	2842997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841921
48504	NC_010168	GCCCTC	2	12	2843064	2843075	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	163841921
48505	NC_010168	CTT	2	6	2843138	2843143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841921
48506	NC_010168	ACC	2	6	2843155	2843160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841921
48507	NC_010168	CTGT	2	8	2843170	2843177	0 %	50 %	25 %	25 %	163841921
48508	NC_010168	CGCT	2	8	2843372	2843379	0 %	25 %	25 %	50 %	163841922
48509	NC_010168	AG	3	6	2843542	2843547	50 %	0 %	50 %	0 %	163841922
48510	NC_010168	GTC	2	6	2843614	2843619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841922
48511	NC_010168	TGA	2	6	2843661	2843666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841922
48512	NC_010168	GATC	2	8	2843854	2843861	25 %	25 %	25 %	25 %	163841923
48513	NC_010168	GAA	2	6	2843886	2843891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841923
48514	NC_010168	ACTCCA	2	12	2843899	2843910	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	163841923
48515	NC_010168	CTT	2	6	2843952	2843957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841924
48516	NC_010168	GAAG	2	8	2844085	2844092	50 %	0 %	50 %	0 %	163841924
48517	NC_010168	GGC	2	6	2844128	2844133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841924
48518	NC_010168	ATCA	2	8	2844176	2844183	50 %	25 %	0 %	25 %	163841924
48519	NC_010168	CCG	2	6	2844213	2844218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841924
48520	NC_010168	TCAA	2	8	2844237	2844244	50 %	25 %	0 %	25 %	163841924
48521	NC_010168	CAA	2	6	2844355	2844360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841924
48522	NC_010168	TCT	2	6	2844448	2844453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841924
48523	NC_010168	ACC	2	6	2844459	2844464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841924
48524	NC_010168	GCCATT	2	12	2844490	2844501	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	163841924
48525	NC_010168	GAT	2	6	2844572	2844577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841924
48526	NC_010168	CGAT	2	8	2844705	2844712	25 %	25 %	25 %	25 %	163841924
48527	NC_010168	CCA	2	6	2844816	2844821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841924
48528	NC_010168	CGGA	2	8	2844882	2844889	25 %	0 %	50 %	25 %	163841924
48529	NC_010168	GAA	2	6	2845071	2845076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841924
48530	NC_010168	CTTC	2	8	2845191	2845198	0 %	50 %	0 %	50 %	163841924
48531	NC_010168	CAA	2	6	2845261	2845266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841924
48532	NC_010168	TCA	2	6	2845281	2845286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841924
48533	NC_010168	GAT	2	6	2845294	2845299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841924
48534	NC_010168	TGCG	2	8	2845329	2845336	0 %	25 %	50 %	25 %	163841924
48535	NC_010168	CG	3	6	2845366	2845371	0 %	0 %	50 %	50 %	163841924
48536	NC_010168	ATCTGC	2	12	2845401	2845412	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	163841924
48537	NC_010168	T	6	6	2845438	2845443	0 %	100 %	0 %	0 %	163841924
48538	NC_010168	CGAA	2	8	2845536	2845543	50 %	0 %	25 %	25 %	163841925
48539	NC_010168	AGC	2	6	2845606	2845611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841925
48540	NC_010168	T	6	6	2845638	2845643	0 %	100 %	0 %	0 %	163841925
48541	NC_010168	CGT	2	6	2845723	2845728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841925
48542	NC_010168	TGG	2	6	2845812	2845817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841925
48543	NC_010168	CAA	2	6	2845818	2845823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841925
48544	NC_010168	CGC	2	6	2845863	2845868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841925
48545	NC_010168	CGG	2	6	2845881	2845886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841925
48546	NC_010168	ACT	2	6	2846080	2846085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841926
48547	NC_010168	CTG	2	6	2846129	2846134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841926
48548	NC_010168	GCG	2	6	2846336	2846341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841926
48549	NC_010168	CAC	2	6	2846377	2846382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841926
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48551	NC_010168	CACG	2	8	2846421	2846428	25 %	0 %	25 %	50 %	163841927
48552	NC_010168	GTC	2	6	2846540	2846545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841927
48553	NC_010168	TCA	2	6	2846579	2846584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841927
48554	NC_010168	CAGC	2	8	2846595	2846602	25 %	0 %	25 %	50 %	163841927
48555	NC_010168	GCT	2	6	2846633	2846638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841927
48556	NC_010168	GT	4	8	2846656	2846663	0 %	50 %	50 %	0 %	163841927
48557	NC_010168	ACG	2	6	2846675	2846680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841927
48558	NC_010168	AGC	2	6	2846699	2846704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841927
48559	NC_010168	GCC	2	6	2846732	2846737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841927
48560	NC_010168	GCA	2	6	2846948	2846953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841927
48561	NC_010168	CGGA	2	8	2847049	2847056	25 %	0 %	50 %	25 %	163841927
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48566	NC_010168	CTGAA	2	10	2847532	2847541	40 %	20 %	20 %	20 %	163841928
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48569	NC_010168	GCT	2	6	2847638	2847643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841928
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48572	NC_010168	CGC	2	6	2847740	2847745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841928
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48577	NC_010168	GGC	2	6	2848008	2848013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841928
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48585	NC_010168	CAT	2	6	2848818	2848823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841930
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48593	NC_010168	TGGG	2	8	2849095	2849102	0 %	25 %	75 %	0 %	163841930
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48599	NC_010168	GC	3	6	2849301	2849306	0 %	0 %	50 %	50 %	163841930
48600	NC_010168	GCT	2	6	2849319	2849324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841930
48601	NC_010168	CAC	3	9	2849325	2849333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841930
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48604	NC_010168	TGA	2	6	2849435	2849440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841930
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48606	NC_010168	TGA	2	6	2849597	2849602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841930
48607	NC_010168	TTG	2	6	2849603	2849608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841930
48608	NC_010168	CTGCT	2	10	2849612	2849621	0 %	40 %	20 %	40 %	163841930
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48615	NC_010168	CGG	2	6	2850014	2850019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841931
48616	NC_010168	CGA	2	6	2850089	2850094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841931
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48719	NC_010168	TCAA	2	8	2854898	2854905	50 %	25 %	0 %	25 %	163841936
48720	NC_010168	GCCA	2	8	2854917	2854924	25 %	0 %	25 %	50 %	163841936
48721	NC_010168	GC	3	6	2854932	2854937	0 %	0 %	50 %	50 %	163841936
48722	NC_010168	ATCT	2	8	2854998	2855005	25 %	50 %	0 %	25 %	163841936
48723	NC_010168	CAG	2	6	2855125	2855130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841936
48724	NC_010168	CAGC	3	12	2855140	2855151	25 %	0 %	25 %	50 %	163841936
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48726	NC_010168	AGG	2	6	2855278	2855283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841937
48727	NC_010168	ATC	2	6	2855315	2855320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841937
48728	NC_010168	GCCA	2	8	2855351	2855358	25 %	0 %	25 %	50 %	163841937
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48730	NC_010168	GCACAA	2	12	2855389	2855400	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	163841937
48731	NC_010168	GCTC	2	8	2855403	2855410	0 %	25 %	25 %	50 %	163841937
48732	NC_010168	GCC	2	6	2855412	2855417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841937
48733	NC_010168	CTG	2	6	2855450	2855455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841937
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48832	NC_010168	GCCA	2	8	2861441	2861448	25 %	0 %	25 %	50 %	163841944
48833	NC_010168	CAA	2	6	2861465	2861470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841944
48834	NC_010168	GC	3	6	2861533	2861538	0 %	0 %	50 %	50 %	163841944
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48837	NC_010168	CCGG	2	8	2861638	2861645	0 %	0 %	50 %	50 %	163841944
48838	NC_010168	GGC	2	6	2861651	2861656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841944
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48841	NC_010168	GGC	2	6	2861872	2861877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841944
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48843	NC_010168	CGTCGC	2	12	2861928	2861939	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	163841944
48844	NC_010168	ACC	2	6	2861962	2861967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841944
48845	NC_010168	GCA	2	6	2861969	2861974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841944
48846	NC_010168	CA	3	6	2862060	2862065	50 %	0 %	0 %	50 %	163841944
48847	NC_010168	CGT	3	9	2862093	2862101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841944
48848	NC_010168	ACGG	2	8	2862379	2862386	25 %	0 %	50 %	25 %	163841944
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48853	NC_010168	GAT	2	6	2862867	2862872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841945
48854	NC_010168	CGA	2	6	2862878	2862883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841945
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48860	NC_010168	TCCCG	2	10	2863069	2863078	0 %	20 %	20 %	60 %	163841945
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48870	NC_010168	GCCC	2	8	2863941	2863948	0 %	0 %	25 %	75 %	163841946
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48874	NC_010168	CGCTG	2	10	2864032	2864041	0 %	20 %	40 %	40 %	163841946
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48921	NC_010168	TCA	2	6	2866284	2866289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841948
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48932	NC_010168	CTG	2	6	2866774	2866779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841948
48933	NC_010168	A	6	6	2866785	2866790	100 %	0 %	0 %	0 %	163841948
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48942	NC_010168	CTT	2	6	2867388	2867393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841949
48943	NC_010168	CGT	2	6	2867672	2867677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841950
48944	NC_010168	CGC	2	6	2867703	2867708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841950
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48947	NC_010168	GAC	2	6	2867890	2867895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841950
48948	NC_010168	CAAC	2	8	2867896	2867903	50 %	0 %	0 %	50 %	163841950
48949	NC_010168	CAC	2	6	2867979	2867984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841950
48950	NC_010168	CTC	2	6	2868012	2868017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841950
48951	NC_010168	GCT	2	6	2868063	2868068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841950
48952	NC_010168	TGC	2	6	2868230	2868235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841950
48953	NC_010168	CGA	2	6	2868332	2868337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841950
48954	NC_010168	GC	4	8	2868340	2868347	0 %	0 %	50 %	50 %	163841950
48955	NC_010168	CGA	2	6	2868413	2868418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841950
48956	NC_010168	TGG	2	6	2868790	2868795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841951
48957	NC_010168	CGT	2	6	2868822	2868827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841951
48958	NC_010168	GC	3	6	2868909	2868914	0 %	0 %	50 %	50 %	163841951
48959	NC_010168	GC	3	6	2868996	2869001	0 %	0 %	50 %	50 %	163841951
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