MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 53703

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_010168	TCG	2	6	2813973	2813978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841893
48003	NC_010168	ATCG	2	8	2814164	2814171	25 %	25 %	25 %	25 %	163841893
48004	NC_010168	CTG	2	6	2814247	2814252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841893
48005	NC_010168	AAG	2	6	2814258	2814263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841893
48006	NC_010168	GCG	2	6	2814274	2814279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841893
48007	NC_010168	AGA	2	6	2814303	2814308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841893
48008	NC_010168	TG	3	6	2814328	2814333	0 %	50 %	50 %	0 %	163841893
48009	NC_010168	TGC	3	9	2814360	2814368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841893
48010	NC_010168	ACG	2	6	2814435	2814440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841893
48011	NC_010168	TTC	3	9	2814546	2814554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841893
48012	NC_010168	GCAT	2	8	2814876	2814883	25 %	25 %	25 %	25 %	163841894
48013	NC_010168	GCCG	2	8	2814908	2814915	0 %	0 %	50 %	50 %	163841894
48014	NC_010168	CAA	2	6	2814963	2814968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841894
48015	NC_010168	GCC	2	6	2815154	2815159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841894
48016	NC_010168	GCG	2	6	2815166	2815171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841894
48017	NC_010168	CGT	2	6	2815180	2815185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841894
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48019	NC_010168	TCG	2	6	2815206	2815211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841894
48020	NC_010168	CGG	2	6	2815228	2815233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841894
48021	NC_010168	GAG	2	6	2815292	2815297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841894
48022	NC_010168	GC	3	6	2815305	2815310	0 %	0 %	50 %	50 %	163841894
48023	NC_010168	TGCG	2	8	2815311	2815318	0 %	25 %	50 %	25 %	163841894
48024	NC_010168	TGG	2	6	2815386	2815391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841894
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48028	NC_010168	GCG	2	6	2815527	2815532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841894
48029	NC_010168	CG	3	6	2815577	2815582	0 %	0 %	50 %	50 %	163841894
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48034	NC_010168	CGGC	2	8	2815908	2815915	0 %	0 %	50 %	50 %	163841894
48035	NC_010168	AC	3	6	2815919	2815924	50 %	0 %	0 %	50 %	163841894
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48051	NC_010168	CGT	2	6	2817093	2817098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841895
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48054	NC_010168	GCT	3	9	2817290	2817298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841895
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48085	NC_010168	GCA	2	6	2820223	2820228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841898
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48088	NC_010168	T	6	6	2820331	2820336	0 %	100 %	0 %	0 %	163841898
48089	NC_010168	CAG	2	6	2820469	2820474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841898
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48100	NC_010168	GC	3	6	2820720	2820725	0 %	0 %	50 %	50 %	163841898
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48106	NC_010168	CAACT	2	10	2821031	2821040	40 %	20 %	0 %	40 %	163841898
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48115	NC_010168	GTCCG	2	10	2821380	2821389	0 %	20 %	40 %	40 %	163841899
48116	NC_010168	CTG	2	6	2821403	2821408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841899
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48229	NC_010168	GCT	2	6	2827666	2827671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841904
48230	NC_010168	ATC	2	6	2827675	2827680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841904
48231	NC_010168	CCG	2	6	2827706	2827711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841904
48232	NC_010168	GCT	2	6	2827758	2827763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841904
48233	NC_010168	CGA	2	6	2827857	2827862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841904
48234	NC_010168	GA	3	6	2827881	2827886	50 %	0 %	50 %	0 %	163841904
48235	NC_010168	GCT	2	6	2828013	2828018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841904
48236	NC_010168	CTA	2	6	2828021	2828026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841904
48237	NC_010168	CCA	2	6	2828051	2828056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841904
48238	NC_010168	TGC	2	6	2828084	2828089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841904
48239	NC_010168	GCA	2	6	2828100	2828105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841904
48240	NC_010168	CGG	2	6	2828154	2828159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841904
48241	NC_010168	GGCG	2	8	2828271	2828278	0 %	0 %	75 %	25 %	163841904
48242	NC_010168	AAG	2	6	2828315	2828320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841904
48243	NC_010168	GCT	2	6	2828433	2828438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841904
48244	NC_010168	AGCTG	2	10	2828458	2828467	20 %	20 %	40 %	20 %	163841904
48245	NC_010168	GAG	2	6	2828655	2828660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841905
48246	NC_010168	GC	3	6	2828666	2828671	0 %	0 %	50 %	50 %	163841905
48247	NC_010168	ATTGAT	2	12	2828805	2828816	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	163841905
48248	NC_010168	CCA	2	6	2828824	2828829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841905
48249	NC_010168	ATC	2	6	2828889	2828894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841905
48250	NC_010168	GCACC	2	10	2828954	2828963	20 %	0 %	20 %	60 %	163841905
48251	NC_010168	CAAT	2	8	2829012	2829019	50 %	25 %	0 %	25 %	163841905
48252	NC_010168	ATC	2	6	2829024	2829029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841905
48253	NC_010168	GAA	2	6	2829240	2829245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841905
48254	NC_010168	GAC	2	6	2829280	2829285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841905
48255	NC_010168	ATC	2	6	2829396	2829401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841905
48256	NC_010168	TC	3	6	2829483	2829488	0 %	50 %	0 %	50 %	163841905
48257	NC_010168	CG	3	6	2829505	2829510	0 %	0 %	50 %	50 %	163841905
48258	NC_010168	GCT	2	6	2829518	2829523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841905
48259	NC_010168	GGC	2	6	2829599	2829604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841905
48260	NC_010168	GC	4	8	2829647	2829654	0 %	0 %	50 %	50 %	163841905
48261	NC_010168	GCT	2	6	2829695	2829700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841905
48262	NC_010168	ACC	2	6	2829898	2829903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841906
48263	NC_010168	TCCGC	2	10	2829968	2829977	0 %	20 %	20 %	60 %	163841906
48264	NC_010168	GCC	2	6	2830033	2830038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841906
48265	NC_010168	GCT	2	6	2830168	2830173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841906
48266	NC_010168	GGA	2	6	2830174	2830179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841906
48267	NC_010168	ACT	2	6	2830183	2830188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841906
48268	NC_010168	GGC	2	6	2830219	2830224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841906
48269	NC_010168	TAC	2	6	2830246	2830251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841906
48270	NC_010168	GAT	2	6	2830258	2830263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841906
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48272	NC_010168	ACT	2	6	2830283	2830288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841906
48273	NC_010168	TAC	2	6	2830300	2830305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841906
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48275	NC_010168	CTG	2	6	2830355	2830360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841906
48276	NC_010168	CGA	2	6	2830445	2830450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841907
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48279	NC_010168	CGT	2	6	2830509	2830514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841907
48280	NC_010168	GC	3	6	2830534	2830539	0 %	0 %	50 %	50 %	163841907
48281	NC_010168	GCA	2	6	2830602	2830607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841907
48282	NC_010168	GCA	2	6	2830647	2830652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841907
48283	NC_010168	CGG	2	6	2830732	2830737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841907
48284	NC_010168	GTG	2	6	2830789	2830794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841907
48285	NC_010168	CCG	2	6	2830844	2830849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841907
48286	NC_010168	CCG	2	6	2830905	2830910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841907
48287	NC_010168	GATC	2	8	2831002	2831009	25 %	25 %	25 %	25 %	163841907
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48290	NC_010168	CG	3	6	2831098	2831103	0 %	0 %	50 %	50 %	163841907
48291	NC_010168	GGGC	2	8	2831165	2831172	0 %	0 %	75 %	25 %	163841907
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48294	NC_010168	GC	3	6	2831362	2831367	0 %	0 %	50 %	50 %	163841907
48295	NC_010168	CAA	2	6	2831401	2831406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841907
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48297	NC_010168	CAT	2	6	2831591	2831596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841908
48298	NC_010168	TCA	2	6	2831638	2831643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841908
48299	NC_010168	TGC	2	6	2831666	2831671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841908
48300	NC_010168	CG	3	6	2831676	2831681	0 %	0 %	50 %	50 %	163841908
48301	NC_010168	ACC	2	6	2831729	2831734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841908
48302	NC_010168	GCA	2	6	2831817	2831822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841908
48303	NC_010168	GCC	2	6	2831856	2831861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841908
48304	NC_010168	GCA	2	6	2831865	2831870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841908
48305	NC_010168	CGG	2	6	2831947	2831952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841908
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48309	NC_010168	CCG	2	6	2832311	2832316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841909
48310	NC_010168	GCA	2	6	2832332	2832337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841909
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48312	NC_010168	GCA	2	6	2832377	2832382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841909
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48315	NC_010168	A	6	6	2832542	2832547	100 %	0 %	0 %	0 %	163841909
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48318	NC_010168	CAAC	2	8	2832603	2832610	50 %	0 %	0 %	50 %	163841909
48319	NC_010168	ATCGCC	2	12	2832694	2832705	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	163841909
48320	NC_010168	TGG	2	6	2832750	2832755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841909
48321	NC_010168	C	6	6	2832809	2832814	0 %	0 %	0 %	100 %	163841910
48322	NC_010168	GTAAT	2	10	2832913	2832922	40 %	40 %	20 %	0 %	163841910
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48324	NC_010168	CGC	2	6	2832950	2832955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841910
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48326	NC_010168	GCTC	2	8	2832998	2833005	0 %	25 %	25 %	50 %	163841910
48327	NC_010168	CTCG	2	8	2833043	2833050	0 %	25 %	25 %	50 %	163841910
48328	NC_010168	CAG	2	6	2833109	2833114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841910
48329	NC_010168	GCCG	2	8	2833133	2833140	0 %	0 %	50 %	50 %	163841910
48330	NC_010168	AATACC	2	12	2833152	2833163	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	163841910
48331	NC_010168	TGC	2	6	2833244	2833249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841910
48332	NC_010168	GC	3	6	2833264	2833269	0 %	0 %	50 %	50 %	163841910
48333	NC_010168	CGC	2	6	2833301	2833306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841910
48334	NC_010168	T	6	6	2833328	2833333	0 %	100 %	0 %	0 %	163841910
48335	NC_010168	CCA	2	6	2833334	2833339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841910
48336	NC_010168	GTC	2	6	2833398	2833403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841910
48337	NC_010168	CTTGGG	2	12	2833433	2833444	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	163841910
48338	NC_010168	GCA	2	6	2833502	2833507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841911
48339	NC_010168	CGCCGG	2	12	2833508	2833519	0 %	0 %	50 %	50 %	163841911
48340	NC_010168	GAT	2	6	2833542	2833547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841911
48341	NC_010168	CCA	2	6	2833645	2833650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841911
48342	NC_010168	CAG	2	6	2833688	2833693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841911
48343	NC_010168	GC	3	6	2833696	2833701	0 %	0 %	50 %	50 %	163841911
48344	NC_010168	TAA	2	6	2833703	2833708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841911
48345	NC_010168	CCA	2	6	2833775	2833780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841911
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48452	NC_010168	AATGTA	2	12	2839996	2840007	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	163841920
48453	NC_010168	ACC	2	6	2840057	2840062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841920
48454	NC_010168	CTG	2	6	2840082	2840087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841920
48455	NC_010168	GGC	3	9	2840150	2840158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841920
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48457	NC_010168	ACG	2	6	2840255	2840260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841920
48458	NC_010168	TGA	2	6	2840403	2840408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841920
48459	NC_010168	CAA	2	6	2840503	2840508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841920
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48464	NC_010168	CGA	2	6	2840999	2841004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841921
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